| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | 225392 = | NA (NA) | 3 (0.060) | 3/92 | NT | NA | noncoding (12/77 nt) | ileV | tRNA‑Ile |
| ? | AP009048 | 225417 = | NA (NA) | noncoding (37/77 nt) | ileV | tRNA‑Ile | |||||
GTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP009048/225466‑225392‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctgaTAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTT > AP009048/225417‑225486 GTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAC > 1:1048788/1‑71GTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGT‑CGCTCTAACCAC < 1:3797095/70‑1 GCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCT > 1:3623615/1‑71 CAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCT > 1:1669299/1‑70 CAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCT < 1:179106/70‑1 CAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCT > 1:1893246/1‑70 CAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCT > 1:2700319/1‑70 CAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCT > 1:4409513/1‑70 CAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCT < 1:2482832/70‑1 AAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCT > 1:2774807/1‑69 AAATTTCGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCT > 1:847/1‑69 CTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCT < 1:3889543/56‑1 CTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAC > 1:4092767/1‑54 GAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCT > 1:1860122/1‑54 GAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACC < 1:196810/53‑1 ACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCATGGGTGCGCTCTAACCAC < 1:4469678/46‑1 TTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGA > 1:4415509/1‑48 GAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGA < 1:3645570/46‑1 GACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTG > 1:1199659/1‑37 CACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAA < 1:2608573/56‑1 CCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAACTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTAC > 1:2891590/1‑70 AGGGGTGCGCTCTAACCACCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTG < 1:484843/70‑1 CCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTT < 1:3536928/51‑1 CTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGT > 1:3228494/1‑71 CTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGT < 1:485738/71‑1 CTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGT > 1:3454771/1‑71 CTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGT > 1:2610226/1‑71 CTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAA > 1:2098580/1‑66 CTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAA > 1:4144205/1‑66 CTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGC > 1:41468/1‑52 CTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGC > 1:3584253/1‑52 CTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAAT > 1:4454852/1‑48 CTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGG > 1:4820362/1‑38 TGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGGCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTT > 1:2894884/1‑71 TGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAA < 1:3756845/46‑1 TGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAA < 1:1754642/46‑1 ATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTT < 1:1530430/71‑1 ATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTT > 1:889998/1‑70 ATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTT < 1:4777563/69‑1 ATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTT < 1:1900739/69‑1 ATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATT > 1:176551/1‑46 ATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAA < 1:1597962/44‑1 ATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAA < 1:1897867/44‑1 GTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP009048/225466‑225392‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctgaTAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTT > AP009048/225417‑225486 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |