| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913_3_KO_pgi | 3,440,137 | T→G | K298T (AAA→ACA) | rpoA ← | RNA polymerase, alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913_3_KO_pgi | 3,440,137 | 0 | T | G | 98.4% | 196.9 / NA | 62 | K298T (AAA→ACA) | rpoA | RNA polymerase, alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base G (28/33); minor base C (1/0); total (29/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.68e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGATCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATC > NC_000913_3_KO_pgi/3439994‑3440282 | gcgcATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTa < 1:832308/149‑1 (MQ=255)gcgcATGACCTTATCCTCCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTa < 1:858202/149‑1 (MQ=255) cgcATGACCTTATCCTTCTCAGTACAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGCCAGCGATGCTTGCCGGTAGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTAc < 1:835109/149‑1 (MQ=255) gcATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAACCTCAGTAAGAGATGTTTTAcc > 1:498770/1‑149 (MQ=255) cATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTAATCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCCGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGCCTTTATAACCAAGAAGAGATGTTTTACCa > 2:223791/1‑149 (MQ=255) ttATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAg > 1:408897/1‑149 (MQ=255) cTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCCGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGtt > 1:312326/1‑149 (MQ=255) ttCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGttt > 1:868589/1‑149 (MQ=255) cAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAg < 2:134613/149‑1 (MQ=255) cAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACGCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGAGAGTCCACGGGAAGCCAGGACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAg < 2:147963/149‑1 (MQ=255) gTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGa > 2:417077/1‑149 (MQ=255) tAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGGAAGAGTTGGTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAg > 1:701170/1‑149 (MQ=255) aCCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCtga > 1:160908/1‑147 (MQ=255) agccTGCGATCCGGTTACTCGCGAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGGTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTTCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCGGTAAGAGATGTTTTACCAATGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTc < 2:366474/147‑1 (MQ=255) cccggtgATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCg < 1:160238/145‑1 (MQ=255) aCCTTTGAGCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCg < 1:160157/149‑1 (MQ=255) aCCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCg < 2:900383/149‑1 (MQ=255) cTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTGTTACCCAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCGCCACCTccga > 2:165326/1‑146 (MQ=255) cTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCACATGCCGGGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCggc > 1:528529/1‑148 (MQ=255) aTCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTACGGAGATCAACCTCGGTACGCt > 2:317216/1‑149 (MQ=255) ttACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCa > 2:49242/1‑149 (MQ=255) ctggTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTGTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGAt < 2:504187/146‑1 (MQ=255) cTCGTCAGCGAGGTTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTACGAGATGTTTTACCAAGGTTAGTCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGAt < 1:317216/149‑1 (MQ=255) tCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATc > 1:899585/1‑149 (MQ=255) tCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCCCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATc < 1:55832/149‑1 (MQ=255) tCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGTGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCATCCTCGGTACGCTGTACCAGATCAcc < 2:905219/149‑1 (MQ=255) tCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCCCAGTAAGAGATCTTTTGCCAAGGATAGGAGGTTTAAGCACCTCAACCTCGGTACGCTGTGCCAGCTCAcc > 2:566413/1‑149 (MQ=255) gCTTGCTGGTGTCCAGTTTTCCAGGCGCATGCTCAGAGGCAGTTCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGCGATGGTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCGCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGt < 1:436089/149‑1 (MQ=255) gCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGt > 1:586141/1‑149 (MQ=255) ttGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTgg > 2:279588/1‑149 (MQ=255) tGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGa < 2:586141/149‑1 (MQ=255) gCCGGGGGCCGGTTTGCCAGGGGGATTCTCAGAGACAGTCCATGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTTCCAAGGTTAGGCTTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGAt < 2:223810/149‑1 (MQ=255) tGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTCGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCtt < 1:30327/149‑1 (MQ=255) ccAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGGTTTAAGGAGCTCAACCGCGGTACGCTGTACCAGAGCGCCAAGATAATGGATAGCTtgtg > 2:163240/1‑149 (MQ=255) cAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGc > 1:517058/1‑149 (MQ=255) ttCGAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTaa < 2:563201/149‑1 (MQ=255) ttCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGATGTAAAATAGCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTaa < 1:670403/149‑1 (MQ=255) ccAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAgg < 1:338601/149‑1 (MQ=255) cAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGc > 2:528049/1‑149 (MQ=255) aGGCGCATGCCGAGAAACAGTGCACGAGAAGCCAGCAAGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCTGGACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCa < 2:610226/149‑1 (MQ=255) aGGCGCATGCCCAGGGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACTTCTTTAATCTCAGTAAGATATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCa < 2:339909/149‑1 (MQ=255) gcATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTa < 1:638045/149‑1 (MQ=255) cATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGCCCCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAg < 1:809526/149‑1 (MQ=255) cccAGAGACAGGCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCaga < 1:581378/149‑1 (MQ=255) cAGAGACAGTCCACGGGAAGCAAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATAACCGATCTAGTGGGTAGCTTCTGCTTTAACGCAGTTaaccgatc > 2:785366/1‑142 (MQ=255) agaCAGTCCACGGGACTCCAGCTCGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGa < 2:660421/149‑1 (MQ=255) aCAGTCGACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCGCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACa < 2:91160/149‑1 (MQ=255) aGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGCCAGt > 2:521175/1‑149 (MQ=255) gTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAACCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTc < 2:498770/149‑1 (MQ=255) tCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCa > 2:263951/1‑149 (MQ=255) gCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTGTGAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGATc < 1:359789/149‑1 (MQ=255) tttAATCTCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGACGTTAGCAGCGCGGACAGTCAATTCCAGATCGTCAACACGgc > 1:390758/1‑149 (MQ=255) aTCCCAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGATCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGACATAGTGGAAAGCTTCTGCTTTCAGGCAGCTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGATCGTCAACAGGGCgcag < 1:212048/149‑1 (MQ=255) tctcAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGATCGTCAACAGGgcg < 2:441997/145‑1 (MQ=255) tctcAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGATCGTCAACAGGgcg > 1:441997/1‑145 (MQ=255) tctcAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACACTCAACTCCCAATCGCGAACCGGgcgctcc > 1:883658/1‑146 (MQ=255) tcAGTAAGGGATGGTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGATCGTCAACAGGGCGcagcag < 1:377022/149‑1 (MQ=255) tcAGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTGCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGATCGTCAACAGGGCGcagcag > 1:663423/1‑149 (MQ=255) aGTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTAACAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAAAGCGGGCAGTCAATTCCAGCTCGTCAAGCGGGCGCAGCAggc > 2:884436/1‑148 (MQ=255) gTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCagag > 2:426115/1‑108 (MQ=255) gTAAGAGATGTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCagag < 1:426115/108‑1 (MQ=255) gaTGTTTTACGAATTTTTGGCGGTTTAAGTAGCTCAACCTCTGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGATCGTCAACAGGGCGCAGCAggatcggatc > 2:670338/1‑149 (MQ=255) | GCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGATCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATC > NC_000913_3_KO_pgi/3439994‑3440282 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |