| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913_3_pae_pgi | 3,546,391 | 0 | C | T | 71.4% | 121.0 / 61.5 | 84 | intergenic (+192/‑168) | nfuA/gntT | Fe/S biogenesis protein, putative scaffold/chaperone protein/gluconate transporter, high‑affinity GNT I system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (9/15); new base T (22/38); total (31/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.25e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TCATTTCGGGCCTACGTTGAACATGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGAC > NC_000913_3_pae_pgi/3546243‑3546525 | tCATTTCGGGCCTACGTTGAACATGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCg < 2:538162/150‑1 (MQ=255) aTTTCGGGCCTACGTTGAACATGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTa > 1:551932/1‑150 (MQ=255) aTTTCGGGCCTACGTTGAACATGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTa < 2:454804/150‑1 (MQ=255) tttCGGGCCTACGTTGAACATGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTAt < 4:207036/150‑1 (MQ=255) ttCGGGCCTACGTTGAACATGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATc < 4:705912/150‑1 (MQ=255) ccTACGTTGAACATGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTcac < 3:675719/150‑1 (MQ=255) cTACGTTGAACATGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTcaca < 1:770629/150‑1 (MQ=255) aCGTTGAACATGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATg < 3:586879/150‑1 (MQ=255) cGTTGAACATGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATgg > 2:869448/1‑150 (MQ=255) cGTTGAACATGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATgg < 1:869448/150‑1 (MQ=255) cGTTGAACATGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATgg < 4:538710/150‑1 (MQ=255) gTTGGACATCGGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAAGCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATggg < 3:597145/150‑1 (MQ=255) gTTGAACATGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATggg < 1:145337/150‑1 (MQ=255) gTTGAACATGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATggg < 3:597146/150‑1 (MQ=255) gTTGAACATGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTATCCCCGCGATAATATGACCAAGCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATggg > 1:49666/1‑150 (MQ=255) gAACATGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTAc > 2:1066608/1‑150 (MQ=255) cATGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCaa > 4:386951/1‑150 (MQ=255) gCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATa < 3:526018/150‑1 (MQ=255) ccAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATAc > 3:532621/1‑150 (MQ=255) aGACGTTGGCGCCGCATTGCTTTGTCAACTCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAACCGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTc < 2:49666/150‑1 (MQ=255) gACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTcc < 4:440057/150‑1 (MQ=255) gTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTGGGTTCGTTTCTTCGCGATAATATGACCAGCCTCGCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCGTATGTTACCTGTATCTTTCACATGGGTACCAAACAAACTCCTGa < 2:506094/150‑1 (MQ=255) gTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGa < 3:342457/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCATTGCTTCGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATc < 4:690576/150‑1 (MQ=255) gcagcaTTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTg > 4:564248/1‑150 (MQ=255) cagcaTTGCTTTGTCAAATCCTGGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATCGGTACCAAACATACTCCTGACATCTgt < 2:749438/150‑2 (MQ=255) agcaTTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGAc < 2:135071/150‑1 (MQ=255) gCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACaat < 1:217570/150‑1 (MQ=255) cTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACaata > 1:125006/1‑150 (MQ=255) cTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACACGGGTCGGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACaata > 1:320720/1‑150 (MQ=255) tttGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACaataa < 2:679050/150‑1 (MQ=255) ttGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACaataat < 1:93096/150‑1 (MQ=255) tGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAAtt < 1:282136/150‑1 (MQ=255) gTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTa < 3:277099/150‑1 (MQ=255) tCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAg < 3:283758/150‑1 (MQ=255) tCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAg < 1:182789/150‑1 (MQ=255) aaaTCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGtt > 4:474956/1‑150 (MQ=255) tCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGACTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTa > 3:726221/1‑150 (MQ=255) cTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGt < 2:532066/150‑1 (MQ=255) cGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTgg > 2:680498/1‑150 (MQ=255) cGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTgg > 3:364265/1‑150 (MQ=255) ggTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGCGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTggg < 3:466676/150‑1 (MQ=255) tCGTTTGCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTAt < 1:628513/150‑1 (MQ=255) tCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGGAt > 4:645331/1‑150 (MQ=255) gTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCa > 1:103919/1‑150 (MQ=255) cccGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCgt > 2:507548/1‑150 (MQ=255) cccGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCgt > 4:51718/1‑150 (MQ=255) cccGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCgt > 2:357217/1‑150 (MQ=255) cccGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCgt > 4:12151/1‑150 (MQ=255) ccGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCgtg < 2:919372/150‑1 (MQ=255) cgcgATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCgtgg > 2:1101367/1‑150 (MQ=255) cgcgATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCgtgg < 4:364265/150‑1 (MQ=255) gATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATa < 2:993709/98‑1 (MQ=255) gATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATa > 1:993709/1‑98 (MQ=255) aataTGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGc < 1:296183/150‑1 (MQ=255) aataTGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGc < 3:432327/150‑1 (MQ=255) gACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGa < 1:136202/104‑1 (MQ=255) gACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGa > 2:136202/1‑104 (MQ=255) ccAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATAtct > 4:154944/1‑150 (MQ=255) cAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATAtctc > 2:207938/1‑150 (MQ=255) atccTCTCATAATTTAAATTGACCGCGCTCGGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTGACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACTTCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATctct < 2:2967/148‑1 (MQ=255) aaCCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATctct < 1:1142268/150‑1 (MQ=255) ctcATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTcc < 3:609732/150‑1 (MQ=255) tcATAATTTAAATTTACCCCTCTCTGCTTATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACGTCTGACTACAATAATTAGTTTGAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTccc < 2:862387/150‑1 (MQ=255) aatttaaatttaCCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGAtt > 2:509121/1‑150 (MQ=255) tttaaatttaCCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTgg < 2:125006/150‑1 (MQ=255) taCCCCGCTCTGGTGACTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTa < 4:726221/150‑1 (MQ=255) ccccGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTaga < 3:269915/150‑1 (MQ=255) cccGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTACTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTagag > 4:735181/1‑150 (MQ=255) cGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGtt < 3:12151/150‑1 (MQ=255) gCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGttt < 1:929675/150‑1 (MQ=255) ctctGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTg < 3:495152/150‑1 (MQ=255) tctGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTgt < 2:522711/150‑1 (MQ=255) ctGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTgtc < 1:1162712/150‑1 (MQ=255) gTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTgtcgtc < 3:588489/150‑1 (MQ=255) gTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTgtcgtc > 2:358074/1‑150 (MQ=255) gATTCTCAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGGTTGTCGTCAg > 1:357632/1‑150 (MQ=255) tctcAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGaaa > 2:576255/1‑150 (MQ=255) tctcAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGaaa > 3:539651/1‑150 (MQ=255) tcAAACGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAAt < 1:235135/150‑1 (MQ=255) aaaCGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGCCTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTg > 1:681015/1‑150 (MQ=255) aaCGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGa < 1:357217/150‑1 (MQ=255) aaCGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGa < 1:1066608/150‑1 (MQ=255) aCGCCAGATGTTACCTGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTGCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGAc < 2:547583/150‑1 (MQ=255) | TCATTTCGGGCCTACGTTGAACATGTGCCAGACGTTGGCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGAC > NC_000913_3_pae_pgi/3546243‑3546525 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |