| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913_3_pae_pgi | 1,823,788 | C→A | L92M (CTG→ATG) | cho → | endonuclease of nucleotide excision repair |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913_3_pae_pgi | 1,823,788 | 0 | C | A | 98.7% | 232.2 / NA | 76 | L92M (CTG→ATG) | cho | endonuclease of nucleotide excision repair |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base A (42/33); minor base T (1/0); total (43/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AAAGTGACACCATGCCGCTCTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGTGGATTTTTCACGAGCCCC > NC_000913_3_pae_pgi/1823642‑1823933 | aaaGTGACACCATGCCGCTCTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAACTCGGCGCTATg > 1:68765/1‑149 (MQ=255) aGTGACACCATGCCGCTCTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCAACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCt > 1:1247032/1‑149 (MQ=255) tGACACCATGCCGCTCTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTcc > 2:389510/1‑149 (MQ=255) acacCATGCCGCTCTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCtt > 1:939610/1‑149 (MQ=255) acacCATGCCGCTCTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCtt > 1:702221/1‑149 (MQ=255) acacCATGCCGCTCTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCtt > 1:65010/1‑149 (MQ=255) acCATGCCGCTCTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCGTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGa > 1:1037202/1‑149 (MQ=255) ccctGCCGCCTTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGaa < 1:656824/146‑1 (MQ=255) cATGCCGCTCTCTATCGGCAAAAGCGCTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGCACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATCCTCCTTGaac > 1:1270491/1‑148 (MQ=255) cATGCCGCTCTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGCTATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCTTTGatg > 2:656824/1‑147 (MQ=255) aTGCCGCTCTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGCAgc > 1:815415/1‑149 (MQ=255) aTGACGCTCTATATCGGCAAAAGCCTTAACATCGGCAGAACCGTCTTTTCTTATTTACGTCGCCCGGATGAAGAACCCATGTTACGGCAATCCCGACGGACCAGCTGGATAATTACCGCGGGTGAAATCGCCTCGTTGATGCTTGAAgc > 2:1315725/1‑149 (MQ=255) cGCTCTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGCTATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATTCGCCTGGGAGCGCGa > 1:1082721/1‑149 (MQ=255) ctctATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGAtt < 1:95762/149‑1 (MQ=255) tataTCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGTCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGCAGCGCGATTAAt < 2:31088/149‑1 (MQ=255) tatCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGGTTAATCa > 1:1124796/1‑149 (MQ=255) ggCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCACTCACAATTACGAACACCGGATAAAGCCGACATGCTACCGCAATCCCGACGGACCACGTGCAAAGATAGCAGCGGGTAAAGCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAACCAAAGa > 2:311297/1‑149 (MQ=255) gCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGaa > 1:571704/1‑149 (MQ=255) aaaaGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAGTCCCGCCGGATCAGCTGGCGATGTACCGCCAGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAACGCGATTACTCAAAGaaca > 2:526426/1‑149 (MQ=255) aaaGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGCAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGaacaa > 2:1201891/1‑149 (MQ=255) cGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGc < 1:1133542/149‑1 (MQ=255) ttAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTc < 2:858851/116‑1 (MQ=255) ttAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTc > 1:858851/1‑116 (MQ=255) aaCATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCTTGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCt < 2:1247032/149‑1 (MQ=255) aaCATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCt > 2:1248432/1‑149 (MQ=255) aCATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTg < 2:571704/149‑1 (MQ=255) aCATCCGCAGCCGCGTCATTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTg < 2:124987/149‑1 (MQ=255) aTCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGtt < 1:1184577/149‑1 (MQ=255) aTCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATAAAAGAACAACAGCCGCTGtt > 1:419859/1‑149 (MQ=255) tCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGttt > 1:322276/1‑149 (MQ=255) tCCGCAGCCACGTCCTTTCTCATTTACGTAACCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGttt > 2:380843/1‑149 (MQ=255) cATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCaa < 1:1248432/149‑1 (MQ=255) tttACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATc < 1:885011/149‑1 (MQ=255) aCGAACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCAGACGGATCAGCTGGACATGTACCGACGGGGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGGGCCGCACACGcc > 2:835296/1‑149 (MQ=255) aCCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGct > 2:1073543/1‑149 (MQ=255) cccGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTCCCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGctct > 1:998267/1‑149 (MQ=255) ccGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAAc > 2:220335/1‑124 (MQ=255) ccGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAAc < 1:220335/124‑1 (MQ=255) ccGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCtg > 1:252641/1‑149 (MQ=255) cGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCtgt < 1:159332/149‑1 (MQ=255) aTGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGcc > 1:245134/1‑149 (MQ=255) gAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCt < 2:939610/149‑1 (MQ=255) gaGCGGCCATGCTAAGGCAATCCCGACGGATGAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGCACAACAGCCGCTGTTTAAGAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTg < 1:985945/148‑1 (MQ=255) gccgccATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCa < 1:1093812/149‑1 (MQ=255) gccgccATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAAAAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTCCGCCGCAATCACCAGCCCTGGGCCCTCCa > 2:1089425/1‑149 (MQ=255) gccgccATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCAGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGACGCTGTTTAATAAACGGTAGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCa > 2:1059863/1‑149 (MQ=255) cgccATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAAt < 1:1245842/149‑1 (MQ=255) gccATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAAtt > 1:875048/1‑149 (MQ=255) ccATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGccc > 2:768520/1‑141 (MQ=255) ccATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGccc < 1:768520/141‑1 (MQ=255) ccATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTa > 2:916682/1‑149 (MQ=255) aTGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCCGCAATTaaa < 1:561000/149‑1 (MQ=255) aTGCTACGCCAATCCCCACGCAACAGCTGCACATGCACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTaaa < 1:584712/149‑1 (MQ=255) tGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAAt < 1:389510/149‑1 (MQ=255) aCGGCAATCCCGGCAGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGaaa < 2:401603/149‑1 (MQ=255) gCAATCCCGACGGAGCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAgc < 1:196910/149‑1 (MQ=255) aaTCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAgcgc > 2:1167447/1‑149 (MQ=255) tCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAATCGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGt < 1:380843/149‑1 (MQ=255) tCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAACGGCGt > 2:132523/1‑149 (MQ=255) ccGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTACAATTAAATAAAAAGCGCGTCg > 2:637818/1‑149 (MQ=255) 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tACCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATAAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAgg > 2:1056909/1‑149 (MQ=255) aCCGCCGGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCACCGGTTTTTGTTCTCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGt < 1:1028447/149‑1 (MQ=255) ccgGTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGTGGAt < 1:824049/149‑1 (MQ=255) gTGAAATCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGTGGAtttt < 1:346997/149‑1 (MQ=255) tGAAATCGGCGGTATGCTCCTTGAAGCGCGATGAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTACAATGAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGTGGAttttt < 1:1315725/149‑1 (MQ=255) aaTCGGCGGTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGTGGATTTTTCAc < 2:58604/149‑1 (MQ=255) aTCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGt < 2:459503/137‑1 (MQ=255) aTCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGt > 1:459503/1‑137 (MQ=255) tCGGCGCTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGTGGATTTTTCACgc > 1:568076/1‑148 (MQ=255) tCGGCGCTATGCCCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGGGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGTGGATTTTTCACGa < 1:442645/149‑1 (MQ=255) gcTATGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGTGGATTTTTCACGAGcccc > 1:791489/1‑149 (MQ=255) | AAAGTGACACCATGCCGCTCTATATCGGCAAAAGCGTTAACATCCGCAGCCGCGTCCTTTCTCATTTACGTACCCCGGATGAAGCCGCCATGCTACGGCAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAGCGCGATTAATCAAAGAACAACAGCCGCTGTTTAATAAACGGTTGCGCCGCAATCGCCAGCTCTGTGCCCTGCAATTAAATGAAAAGCGCGTCGATGTGGTGTATGCCAAAGAGGTGGATTTTTCACGAGCCCC > NC_000913_3_pae_pgi/1823642‑1823933 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |