| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 570695 = | 5881 (26.950) | 123 (0.610) | 35/172 | 13.1 | 2.3% | intergenic (+267/‑198) | ybcK/ybcL | DLP12 prophage; putative recombinase/inactive polymorphonuclear leukocyte migration suppressor; DLP12 prophage; UPF0098 family secreted protein |
| ? | NC_000913 | 570719 = | 5188 (25.710) | intergenic (+291/‑174) | ybcK/ybcL | DLP12 prophage; putative recombinase/inactive polymorphonuclear leukocyte migration suppressor; DLP12 prophage; UPF0098 family secreted protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1090 total aligned reads displayed.
CAATTGTACCCCCAACCCAATTATTTGCCACAATATACACAAAGCACATTGATACTATCTAAAAACTCTGCTTTATTATTAGTAACACCTACGAAAGTCGGTGTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/570800‑570695‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggtgttaCTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGA > NC_000913/570719‑570817 CAATTGTACCCCCAACCCAATTATTTGCCACAATATACACAAAGCACATTGATACTATCTAAAAACTCTGCTTTATTATTAGTAACACCTACGAAAGTCG < 1:3946428/100‑1CAATTGTACCCCCAACCCAATTATTTGCCACAATATACACAAAGCACATTGATACTATCTAAAAACTCTGCTTTATTATTAGTAACACCTACGAAAGTCG > 1:2167176/1‑100 AATTGTACCCCCAACCCAATTATTTGCCACAATATACACAAAGCACATTGATACTATCTAAAAACTCTGCTTTATTATTAGTAACACCTACGAAAGTCGG < 1:1709216/100‑1 ATTGTACCCCCAACCCAATTATTTGCCACAATATACACAAAGCACATTGATACTATCTAAAAACTCTGCTTTATTATTAGTAACACCTACGAAAGTCGGT > 1:1842858/1‑100 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2:780257/1‑89 ACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTG > 2:2063561/1‑89 ACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAAGTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGA > 1:5083734/1‑100 CAATTGTACCCCCAACCCAATTATTTGCCACAATATACACAAAGCACATTGATACTATCTAAAAACTCTGCTTTATTATTAGTAACACCTACGAAAGTCGGTGTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/570800‑570695‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggtgttaCTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGA > NC_000913/570719‑570817 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |