| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 85318 = | 155 (1.040) | 9 (0.060) | 7/282 | 18.7 | 5.8% | intergenic (+6/‑312) | leuO/ilvI | global transcription factor/acetolactate synthase 3 large subunit |
| ? | NC_000913 | 85358 = | 149 (1.060) | intergenic (+46/‑272) | leuO/ilvI | global transcription factor/acetolactate synthase 3 large subunit | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AATTGATAATAAATCGGCTGAATCCCACAACTTACAGCAATTTCTCTATTTTTTTAATTAATCCTAAAATAGAGAGCCCACACATTCAGAATAAAATTCTACATTCAATAAAAAATGCAGAATAAACCAGACATTCATGTCTGACCTATTCTGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/85472‑85318‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tattctgcaTTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGATTTATTATCAATTTAATCCTCTGTAATGGAGGATTTTATCGTTTCTTT > NC_000913/85358‑85507 AATTGATAATAAATCGGCTGAATCCCACAACTTACAGCAATTTCTCTATTTTTTTAATTAATCCTAAAATAGAGAGCCCACACATTCAGAATAAAATTCTACATTCAATAAAAAATGCAGAATAAACCAGACATTCATGTCTGACCTATTC < 1:1010025/151‑1AATTGATAATAAATCGGCTGAATCCCACAACTTACAGCAATTTCTCTATTTTTTTAATTAATCCTAAAATAGAGAGCCCACACATTCAGAATAAAATTCTACATTCAATAAAAAATGCAGAATAAACCAGACATTCATGTCTGACCTATTC > 1:1437993/1‑151AATTGATAATAAATCGGCTGAATCCCACAACTTACAGCAATTTCTCTATTTTTTTAATTAATCCTAAAATAGAGAGCCCACACATTCAGAATAAAATTCTACATACAAT‑AAAAATGCAGAATAAACCAGACATTCATGTCTGACCTATTCT < 2:1156825/151‑1 TTGATAATAAATCGGCTGAATCCCACAACTTACAGCAATTTCTCTATTTTTTTAATTAATCCTAAAATAGAGAGCCCACACATTCAGAATAAACTTCTACATTCAATAAAAAATGCAGAATAAACCAGACATTCATGTCTGACCTATTCTt > 2:1806507/1‑150 GATAATAAATCGGCTGAATCCCACAACTTACAGCAATTTCTCTATTTTTTTAATTAATCCTAAAATAGAGAGCCCACACATTCAGAATAAAATTCTACATTCAATAAAAAATGCAGAATAAACCAGACATTCATGTCTGACCTATTCTGCA < 1:1094813/151‑1 GATAATAAATCGGCTGAATCCCACAACTTACAGCAATTTCTCTATTTTTTTAATTAATCCTAAAATAGAGAGCCCACACATTCAGAATAAAATTCTACATTCAATAAAAAATGCAGAATAAACCAGACATTCATGTCTGACCTATTCTGCA > 1:201165/1‑151 GATAATAAATCGGATTGATGCCACAACTTACAGCAATTTCTCTATTTTTTTAATTAATCCTAAAATAGAGAGCCCACACATTCAGAATAAAATTCTACATTCAATAAAAAATGCAGAATAAACCAGACATTCATGTCTGACCTATTCTGCA < 1:429872/151‑1 TACATTCAATAAAAAATGCAGAATAAACCAGACATTCATGTCTGACCTATTCTGCATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATT > 1:377838/1‑151 CATTCAATAAAAAATGCAGAATAAACCAGACATTCATGTCTGACCTATTCTGCATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCA > 2:2445501/1‑151 AATAAAAAATGCAGAATAAACCAGACATTCATGTCTGACCTATTCTGCATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCTGCCGA > 1:403821/1‑151 AATAAAAAATGCAGAATAAACCAGACATTCATGTCTGACCTATTCTGCATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGA > 1:1217592/1‑151 ATAAAAAATGCAGAATAAACCAGACATTCATGTCTGACCTATTCTGCATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGAT > 1:1234524/1‑151 ATAAAAAATGCAGAATAAACCAGACATTCATGTCTGACCTATTCTGCATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGAT > 1:1434731/1‑151 AAAAATGCAGAATAAACCAGACATTCATGTCTGACCTATTCTGCATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGCATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTCAGTTGTGGGATTCAGCCGATTTA > 2:839141/1‑151 GAATAAACCAGACATTCATGTCTGACCTATTCTGCATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGATTTATTATCAATT > 2:474963/1‑151 ATAAACCAGACATTCATGTCTGGTTTATTCTGCATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGATTTATTATCAATTTA > 2:524072/1‑151 ATTCTGCATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGATAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGATTTATTATCAATTTAATCCTCTGTAATGGAGGATTTTATCG < 1:792955/151‑1 ATTCTGCATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGATTTATTATCAATTTAATCCTCTGTAATGGAGGATTTTATCG < 1:861118/151‑1 ATTCTGCATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGATTTATTATCAATTTAATCCTCTGTAATGGAGGATTTTATCG < 2:650311/151‑1 ATTCTGCATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGATTTATTATCAATTTAATCCTCTGTAATGGAGGATTTTATCG < 2:941588/151‑1 ATTCTGCATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGATTTATTATCAATTTAATCCTCTGTAATGGAGGATTTTATCG < 2:2038370/151‑1 TTCTGCATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGATTTATTATCAATTTAATCCTCTGTAATGGAGGATTTTATCGT < 1:1381543/151‑1 TCTGCATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGATTTATTATCAATTTAATCCTCTGTAATGGAGGATTTTATCGTT > 1:1971862/1‑151 TCTGCATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGATTTATTATCAATTTAATCCTCTGTAATGGAGGATTTTATCGTT > 2:1578155/1‑151 CTGCATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGATTTATTATCAATTTAATGCTCTGTAATTGAGGATTTTATCGTTT > 2:2222950/1‑151 TGCATTTTTTTTTTTTTTTTGAATTTTATTATGAATGTGCGGGCTCTCTCTTTTCGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTACGTTGTGGGATTCAGCCGATTTATTATCAATTTAATCCTCTGTAATGCAGCTTTTTATCGTTTC > 2:2312437/1‑151 TGCATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGATTTATTATCAATTTAATCCTCTGTAATGGAGGATTTTATCGTTTC < 2:1623504/151‑1 ATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGATTTATTATCAATTTAATCCTCTGTAATGGAGGGTTTTATCGTTTCTTT > 1:326278/1‑151 ATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGATTTATTATCAATTTAATCCTCTGTAATGGAGGATTTTATCGTTTCTTT < 1:1821290/151‑1 ATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGATTTATTATCAATTTAATCCTCTGTAATGGAGGATTTTATCGTTTCTTT < 2:1164485/151‑1 ATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGATTTATTATCAATTTAATCCTCTGTAATGGAGGATTTTATCGTTTCTTT < 1:1821645/151‑1 ATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCGCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGATTTATTATCAATTTAATCCTCTGTAATGGAGGATTTTATCGTTTCTTT < 1:1687108/151‑1 AATTGATAATAAATCGGCTGAATCCCACAACTTACAGCAATTTCTCTATTTTTTTAATTAATCCTAAAATAGAGAGCCCACACATTCAGAATAAAATTCTACATTCAATAAAAAATGCAGAATAAACCAGACATTCATGTCTGACCTATTCTGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/85472‑85318‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tattctgcaTTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGATTTATTATCAATTTAATCCTCTGTAATGGAGGATTTTATCGTTTCTTT > NC_000913/85358‑85507 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |