| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2699646 | 317 (0.890) | 8 (0.030) | 5/122 | NT | 3.0% | intergenic (+53/+37) | copZ/ldhD_2 | Copper chaperone CopZ/D‑lactate dehydrogenase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2699665 | 281 (1.040) | intergenic (+72/+18) | copZ/ldhD_2 | Copper chaperone CopZ/D‑lactate dehydrogenase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 175 total aligned reads displayed.
TTGCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/2699538‑2699646‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaaatcgaactgatgagaTAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATCGTAACC < USA300TCH1516_ALE/2699665‑2699576 TTGCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAA < 2:995412/91‑1TTGCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAA < 2:1692628/91‑1TTGCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAA < 1:1073610/91‑1 GCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAA > 1:76450/1‑91 GCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAA > 2:3560640/1‑91 GCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAA > 2:1861127/1‑91 GCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAA < 1:2020565/91‑1 CTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAA > 2:890192/1‑91 CTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAA > 2:6088430/1‑91 CTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAA < 2:2434108/91‑1 CTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAA > 2:639762/1‑91 CTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAA < 1:3453810/91‑1 CTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAA < 1:3453518/91‑1 TGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAA > 2:4798053/1‑91 TGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAA > 1:1263931/1‑91 TGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAA > 1:2487433/1‑91 TGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAA > 2:3537689/1‑91 GTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAAT < 1:3059476/91‑1 GTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAAT < 1:382685/91‑1 GTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAAT < 1:3668574/91‑1 GTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAAT < 1:3257405/91‑1 TATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATC > 1:1611379/1‑91 ATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCG < 2:6192338/91‑1 TCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGA > 1:3124216/1‑91 CTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAA > 2:642901/1‑91 CTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACAAAATTAAAAAATCGAA < 2:5355334/91‑1 AAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTG > 2:4587851/1‑91 AAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTG > 1:6412367/1‑91 AAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTG > 1:1918282/1‑91 AAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTG > 1:4392430/1‑91 AATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAAGTGA > 1:6490731/1‑91 AATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGA < 2:4723089/91‑1 AATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGA < 2:863036/91‑1 AATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGA < 2:2179818/91‑1 AATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGA > 1:578377/1‑91 AATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGA > 2:3359653/1‑91 ATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGAT > 2:4187253/1‑91 ATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGAT > 1:6906294/1‑91 ATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGAT > 1:6906967/1‑91 ATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAAAAAAAAATAAAAAAATCGAACTGAT < 2:2777200/91‑1 TGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCTGATTAAAAAATCGAACTGATG < 1:5403385/91‑1 TGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATG < 1:5113485/91‑1 TGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAAAAACAAAATAAAAAATCGAACTGATG < 2:773020/91‑1 GAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGt < 2:2050831/91‑2 GAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGA > 1:5916020/1‑91 GAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGA > 1:5935663/1‑91 GAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGA > 2:4363329/1‑91 AAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAG > 1:3055155/1‑91 AAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAG > 1:673816/1‑91 AAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAG > 1:148368/1‑91 AAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAG < 1:1416627/91‑1 AAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGA < 1:5212607/91‑1 AAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGA < 1:1106489/91‑1 GGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATT < 2:5889779/91‑1 GGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATT < 2:3134640/91‑1 GTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTC < 1:5194976/91‑1 TACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTC < 2:2620054/91‑1 ATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCA < 2:1848061/91‑1 GCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACT > 1:2053139/1‑42 GCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACT < 2:2053861/42‑1 AAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAA < 2:1556369/91‑1 AAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAA > 2:5031709/1‑91 AAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAA > 2:4544424/1‑91 AAAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGAGTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAA > 1:5795138/1‑91 AAAAATCGAACTGATGAGATAA‑TTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAAT < 2:861882/91‑1 AAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAAT > 1:2825165/1‑91 AAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAAT > 2:3123370/1‑91 AAAATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAAT > 2:4219787/1‑91 AATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTA < 2:4674088/91‑1 AATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTA > 2:1444874/1‑91 AATCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTA > 1:6525954/1‑91 TCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAA > 1:3037922/1‑91 TCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAA > 1:6062495/1‑91 TCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAA > 1:529361/1‑91 TCGAACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAA < 2:4733450/91‑1 AACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGA > 1:6540651/1‑91 AACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGA > 1:4402709/1‑91 ACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGAC < 2:529416/91‑1 ACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGAC < 1:2820678/91‑1 ACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGAC > 1:401641/1‑91 ACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGAC > 1:4847066/1‑91 ACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGAC > 2:4015752/1‑91 ACTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGAC > 1:5622874/1‑91 ACTGATGAGATAATCTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGAC > 2:231933/1‑91 CTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACA < 1:1187150/91‑1 CTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACA > 1:940756/1‑91 CTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACA < 1:2950012/91‑1 CTGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACA < 2:328343/91‑1 TGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACAT > 1:3888845/1‑91 TGATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACAT > 1:4327857/1‑91 GATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATC < 2:5762761/91‑1 GATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATC > 1:4073778/1‑91 GATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATC > 1:5247478/1‑91 GATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATC > 2:6828575/1‑91 ATGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTATTTTGTTTTTGATTACGTTGAATATTTCCTAATTAAACGACATCG > 2:5981934/1‑91 TGAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATCGT < 1:2070135/91‑1 GAGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATCGTA < 2:2240478/91‑1 AGATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATCGTAA > 2:1266568/1‑91 ATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATCGTAACC < 2:4963341/91‑1 ATAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATCGTAACC > 2:3842706/1‑91 TTGCTGTATCTCAAATGAAAGACGCAATTGAAGATCAAGGTTACGATGTCGTTTAATTAGGCAATATTCAACGTCATCAACACCAAATTAAAAAATCGAACTGATGAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/2699538‑2699646‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaaatcgaactgatgagaTAATTTGGATTGTTGGGATTCTCATCAGTTCGATTTTTTAATTTGGTGTTGATGACGTTGAATATTGCCTAATTAAACGACATCGTAACC < USA300TCH1516_ALE/2699665‑2699576 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |