| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP000730 | 190627 = | 111 (0.860) | 6 (0.050) | 6/232 | NT | 5.8% | intergenic (+3/+62) | cap5P/isdG1 | capsular polysaccharide biosynthesis protein Cap5P/heme‑degrading enzyme IsdG |
| ? | CP000730 | 190682 = | 94 (0.800) | intergenic (+58/+7) | cap5P/isdG1 | capsular polysaccharide biosynthesis protein Cap5P/heme‑degrading enzyme IsdG | |||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
GCGTATCAACGTATGAGTCAAGCGAATAATCCATATGGTGATGGACAAGCATCACGACGTATTTGTGAAGCAATAGAATATTATTTTGGATTGCGCACAGACAAGCCGGATGAATTCGTACCTTTACGTCACAAATAATAAAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTTTTAATATATTTATTTTTGATAGTGGTAGCCAATATCATATTTGAATACTTTATTTGATAATATTGGACTTTGCTGTCCATCGTCATCA > CP000730/190487‑190767 | ttggttgaattccgatgtatttaaagaagctcataaaaatgtacgtttaaaaagtgatgacgatggacagcaaagtccaatattatcaaataaagtattcaaatatgatattggctaccactatcaaaaataaatatatta < 2:1077155‑M1/1‑1 (MQ=255)ttggttgaattccgatgtatttaaagaagctcataaaaatgtacgtttaaaaagtgatgacgatggacagcaaagtccaatattatcaaataaagtattcaaatatgatattggctaccactatcaaaaataaatatatta < 1:7467‑M1/1‑1 (MQ=255)gCGTATCAACGTATGAGTCAAGCGAATAATCCATATGGTGATGGACAAGCATCACGACGTATTTGTGAAGCAATAGAATATTATTTTGGATTGCGCACAGACAAGCCGGATGAATTCGTACCTTTACGTCACAAAtaataa < 2:1256283/141‑1 (MQ=255)gCGTATCAACGTATGAGTCAAGCGAATAATCCATATGGTGATGGACAAGCAGCACGACGTATTTGTGAAGCAATAGAATATTATTTTGGATTGCGCACAGACAAGCCGGATGAATTCGTACCTTTACGTCACAAAtaataa > 2:721757/1‑141 (MQ=255) 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(MQ=255) cacaAATAATAAAAATCCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTTTTAATATATTTATTTTTGATAGTGGTAGACAATAGCATATTTGTGTACTTTTTTTGTTACTGTTGGTCTTTGCTGTc < 2:1279381/141‑1 (MQ=255) acaAATAATAAAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTTTTAATATATTTATTTTTGATAGTGGTAGCCAATATCATATTTGAATACTTTATTTGATAATATTGGACTTTGCTGTcc > 2:914346/1‑141 (MQ=255) taaaTAATAAAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTTTTAATAtattta < 1:603351/73‑1 (MQ=255) taataaAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTTTTAATATATTTATTTTTGATAGTGGTAGCCAATATCATATTTGAATACTTTATTTGATAATATTGGACTTTGCTGTCCATCGt < 2:160748/141‑1 (MQ=255) aaaaaaCCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTTTTAATATATTTATTTTTGATAGTGGTAGCCAATATCATATTTGAATACTTTATTTGATAATATTGGACTTTGCTGTCCATCGtcatc < 1:237849/141‑1 (MQ=255) AAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTTTTAATATATTTATTTTTGATAGTGGTAGCCAATATCATATTTGAATACTTTATTTGATAATATTGGACTTTGCTGTCCATCGtcatca > 1:823419‑M1/1‑141 (MQ=255) | GCGTATCAACGTATGAGTCAAGCGAATAATCCATATGGTGATGGACAAGCATCACGACGTATTTGTGAAGCAATAGAATATTATTTTGGATTGCGCACAGACAAGCCGGATGAATTCGTACCTTTACGTCACAAATAATAAAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTTTTAATATATTTATTTTTGATAGTGGTAGCCAATATCATATTTGAATACTTTATTTGATAATATTGGACTTTGCTGTCCATCGTCATCA > CP000730/190487‑190767 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |