| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 2508438 = | 157 (1.220) | 9 (0.080) | 7/232 | NT | 6.4% | intergenic (+670/+81) | sarZ/narK | transcriptional regulator/MFS family major facilitator transporter, nitrate:nitrite antiporter |
| ? | CP000730 | 2508486 = | 119 (1.010) | intergenic (+718/+33) | sarZ/narK | transcriptional regulator/MFS family major facilitator transporter, nitrate:nitrite antiporter | |||||
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
TGTTGATAAGCAACATATTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGC > CP000730/2508298‑2508578 | tGTTGATAAGCAACATATTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACActacta < 1:1200582/141‑1 (MQ=255)gatcaagtcatttagcatttattttcttagcggtatttggatgtattgcattatttaccatgcgtcatttataccaaaaagaatatggctcattgaaaaacggttgatatgtaatacatgccattcatttagttaaataca < 1:690191‑M1/1‑1 (MQ=255) gATAAGCAACATATTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGc < 1:1351033/141‑1 (MQ=255) gATAAGCAACATATTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGc < 1:1321556/141‑1 (MQ=255) aagtcatttagcatttattttcttagcggtatttggatgtattgcattatttaccatgcgtcatttataccaaaaagaatatggctcattgaaaaacggttgatatgtaatacatgccattcatttagttaaatacAAAGc < 2:828362‑M1/5‑1 (MQ=255) aagtcatttagcatttattttcttagcggtatttggatgtattgcattatttaccatgcgtcatttataccaaaaagaatatggctcattgaaaaacggttgatatgtaatacatgccattcatttagttaaatacAAAGc < 2:828762‑M1/5‑1 (MQ=255) gtcatttagcatttattttcttagcggtatttggatgtattgcattatttaccatgcgtcatttataccaaaaagaatatggctcattgaaaaacggttgatatgtaatacatgccattcatttagttaaatacAAAGCCt > 2:1492667‑M1/135‑141 (MQ=255) aaGCAACATATTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTGTTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCtt > 2:272443/1‑141 (MQ=255) atttagcatttattttcttagcggtatttggatgtattgcattatttaccatgcgtcatttataccaaaaagaatatggctcattgaaaaacggttgatatgtaatacatgccattcatttagttaaatacAAAGCCTTaa < 1:272443‑M1/10‑1 (MQ=255) cAACATATTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAAt > 2:140457/1‑141 (MQ=255) cAACATATTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAAt > 2:376407/1‑141 (MQ=255) cAACATATTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAAt > 2:18843/1‑141 (MQ=255) aaCATATTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCt < 1:40114/136‑1 (MQ=255) aaCATATTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAAta > 1:511878/1‑140 (MQ=255) aCATATTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGt > 1:381103/1‑141 (MQ=255) cATATTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTc > 1:955036/1‑141 (MQ=255) tatTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCAt < 2:42363/141‑1 (MQ=255) tACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCt > 2:863206/1‑141 (MQ=255) aCTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTa > 2:1505993/1‑141 (MQ=255) aCTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTa > 2:1602790/1‑141 (MQ=255) aCTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTa > 2:303278/1‑141 (MQ=255) cTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCGTCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTAc > 2:796561/1‑141 (MQ=255) cTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAGTTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTAc < 1:507038/141‑1 (MQ=255) cTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTAc < 1:953948/141‑1 (MQ=255) cTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTAc > 1:1084308/1‑141 (MQ=255) tGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACg < 2:113146/141‑1 (MQ=255) tAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGaac > 1:353234/1‑140 (MQ=255) gTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAatat < 2:1328684/141‑1 (MQ=255) ttGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTgc > 2:561311/1‑141 (MQ=255) tGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTgcg < 2:1550682/141‑1 (MQ=255) aaaaTGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCa < 2:1228735/141‑1 (MQ=255) aaaTGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCAt < 2:1551207/141‑1 (MQ=255) aaaTGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCAt < 2:160430/141‑1 (MQ=255) gggTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTACTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGAGAATGata > 2:1222480/1‑141 (MQ=255) ggTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGatat < 2:1549961/141‑1 (MQ=255) ggTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGatat < 2:1071774/141‑1 (MQ=255) ggTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGatat < 2:1314628/141‑1 (MQ=255) gatgtattgcattatttaccatgcgtcatttataccaaaaagaatatggctcattgaaaaacggttgatatgtaatacatgccattcatttagttaaatacAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATAtt > 1:1582200‑M1/102‑141 (MQ=255) ttattaACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAAGGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTGCTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTa < 1:755337/141‑1 (MQ=255) tattaACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATCAGACTAGTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGATAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTaa > 1:380388/1‑141 (MQ=255) attgcattatttaccatgcgtcatttataccaaaaagaatatggctcattgaaaaacggttgatatgtaatacatgccattcatttagttaaatacAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGc > 1:1414759‑M1/97‑141 (MQ=255) cattatttaccatgcgtcatttataccaaaaagaatatggctcattgaaaaacggttgatatgtaatacatgccattcatttagttaaatacAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTg > 2:1564831‑M1/93‑141 (MQ=255) cattatttaccatgcgtcatttataccaaaaagaatatggctcattgaaaaacggttgatatgtaatacatgccattcatttagttaaatacAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTg > 1:1657285‑M1/93‑141 (MQ=255) aTTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGt < 1:127228/141‑1 (MQ=255) aCCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTAtt < 1:342250/141‑1 (MQ=255) tGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAAc < 2:202926/141‑1 (MQ=255) gCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTCCATAAACATCTAGTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACt < 1:606062/141‑1 (MQ=255) ccTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTa > 1:59240/1‑141 (MQ=255) cTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTaa < 1:1097828/141‑1 (MQ=255) tAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTaaa < 2:693006/141‑1 (MQ=255) cAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAaatgaatg < 1:863206/141‑1 (MQ=255) aaaCCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGTGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAaatgaatgt > 1:1404283/1‑140 (MQ=255) aaaCCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATgg > 2:503592/1‑141 (MQ=255) aaaCCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATgg < 1:564968/141‑1 (MQ=255) aaCCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGc > 1:81102/1‑141 (MQ=255) aaCCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGc > 2:1274763/1‑141 (MQ=255) aCCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATTTTAATGCTTTGTATTTAACTAAATGATTGGCa > 2:509819/1‑141 (MQ=255) aCCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCa > 1:58573/1‑141 (MQ=255) ccAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGatat > 2:1085425/1‑109 (MQ=255) cAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATg > 2:1102567/1‑141 (MQ=255) cAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATg < 1:40591/141‑1 (MQ=255) aGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTa < 1:278204/141‑1 (MQ=255) gCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTAt > 1:862533/1‑141 (MQ=255) cAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTAtt < 1:636465/141‑1 (MQ=255) aTGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTAc > 1:1011130/1‑141 (MQ=255) tGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACa < 2:527067/141‑1 (MQ=255) aaaCTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACata < 1:457004/141‑1 (MQ=255) aaCTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACatat > 1:166189/1‑141 (MQ=255) aaCTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACatat < 1:1595703/141‑1 (MQ=255) aaCTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACatat > 1:1176699/1‑141 (MQ=255) ctactTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCa < 2:1175890/141‑1 (MQ=255) tactTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGTTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCaa < 2:1590170/141‑1 (MQ=255) caACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGttttt < 2:1036252/141‑1 (MQ=255) caACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGttttt < 1:787685/141‑1 (MQ=255) tATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAg > 2:1359029/1‑141 (MQ=255) aTTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTAtt > 2:582196/1‑93 (MQ=255) ccAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCat < 1:1473541/141‑1 (MQ=255) cAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCata < 2:369210/141‑1 (MQ=255) ttCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCt > 1:84078/1‑141 (MQ=255) tAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCttttt > 2:752741/1‑141 (MQ=255) tAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCttttt < 2:616650/141‑1 (MQ=255) aGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTAAATGTCATGCTACGAATATTGCGCAAGATATTAAAGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATATATGACATATCAACCGATTTTCAATAAGCCATATTCTTTTTg > 1:413454/1‑141 (MQ=255) gTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTgg < 1:1511595/141‑1 (MQ=255) aaaTTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATACCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGtat > 2:101206/1‑141 (MQ=255) aTTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATaa < 1:503592/141‑1 (MQ=255) aaaaTGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGa < 1:819934/141‑1 (MQ=255) aaaTGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATg > 1:1628849/1‑139 (MQ=255) aaaTGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATg < 2:1628849/139‑1 (MQ=255) aaaTGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGAc > 1:662563/1‑141 (MQ=255) aaTGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACg < 2:625434/141‑1 (MQ=255) aaTGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACg < 2:381103/141‑1 (MQ=255) gAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCAt > 1:203325/1‑141 (MQ=255) gAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCAt > 1:770591/1‑141 (MQ=255) aTACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATgg < 1:1563960/141‑1 (MQ=255) aTACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATgg < 1:1289721/141‑1 (MQ=255) aTACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCGTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATgg < 1:1028830/141‑1 (MQ=255) acacTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTa > 1:312780/1‑141 (MQ=255) ctaAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGc < 2:744112/103‑1 (MQ=255) ctaAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGc > 1:744112/1‑103 (MQ=255) AAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGc < 1:1218012‑M1/141‑1 (MQ=255) | TGTTGATAAGCAACATATTACTGCTAGTTTTGAAAATGGGTTATTAACCATTACCTTGCCTAAAATCAAACCAAGCAATGAAACTACTTCATCAACATCTATTCCAATTTCATAGTTAAATTTAAAATGAATACACTACTAAAGCCTTAATGTCATGCTACGAATATTGCGCATGATATTAAGGCTTTGTATTTAACTAAATGAATGGCATGTATTACATATCAACCGTTTTTCAATGAGCCATATTCTTTTTGGTATAAATGACGCATGGTAAATAATGC > CP000730/2508298‑2508578 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |