Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP000730 | 2,744,205 | 0 | A | G | 5.7% | 490.9 / 14.3 | 159 | intergenic (+142/+51) | fdaB/mqo2 | fructose‑bisphosphate aldolase/malate dehydrogenase (acceptor) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (74/76); new base G (5/4); total (79/80) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.46e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.39e-01 |
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
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1:863805/141‑1 (MQ=255) | TATACATTAAACTATTTTTTGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGTAAAAAAATCGGACAGCTG‑AAAAATCTTTAAGATTT‑CTCAGTTGTCCGATTTTAAATATAGCTATTAGAATTTAGTTTTCGTAGTAACCTAATTCTAAGTCTTTTGAAGTTTGTTTACGGATTTTTCTCATTAATTTTTCGTCTTCAATTAATGATTCA > CP000730/2744066‑2744343 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |