Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP000730 | 372,106 | T→A | 5.0% | intergenic (‑166/‑204) | USA300HOU_0339 ← / → lip1 | hypothetical membrane protein/triacylglycerol lipase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP000730 | 372,106 | 0 | T | A | 5.0% | 514.8 / 14.1 | 159 | intergenic (‑166/‑204) | USA300HOU_0339/lip1 | hypothetical membrane protein/triacylglycerol lipase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (82/69); new base A (6/2); total (88/71) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.00e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.06e-01 |
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
ATTTTAATTTAGAAAAATCTGAAAACTTACTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAATCAAAAAATAATATATGTCATGTTATA > CP000730/371966‑372246 | attTTAATTTAGAAAAATCTGAAAACTTACTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGAt < 2:1058720/141‑1 (MQ=255) attTTAATTTAGAAAAATCTGAAAACTTACTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGAt < 2:677338/141‑1 (MQ=255) attTTAATTTAGAAAAATCTGAAAACTTACTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGAt < 2:1608992/141‑1 (MQ=255) attTTAATTTAGAAAAATCTGAAAACTTACTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGAt < 1:1127782/141‑1 (MQ=255) ttAATTTAGAAAAATCTGAAAACTTACTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCa < 1:1625027/141‑1 (MQ=255) ttAATTTAGAAAAATCTGAAAACTTACTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTGGTGTTGAATCa < 2:1392413/141‑1 (MQ=255) aTTTAGAAAAATCTGAAAACTTACTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAaca > 2:769184/1‑141 (MQ=255) ttAGAAAAATCTGAAAACTTACTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAAcacc > 1:1136836/1‑141 (MQ=255) tAGAAAAATCTGAAAACTTACTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAAcacca < 1:1445705/141‑1 (MQ=255) tAGAAAAATCTGAAAACTTACTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAAcacca < 1:1065178/141‑1 (MQ=255) aGAAAAATCTGAAAACTTACTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTGGTGTTGAATCAacacaac < 2:440989/141‑4 (MQ=255) aTCTGAATACTTACTATAATTGTATAGTTTGAAGTATTTTCATACGAATACAAATTAACTTATTATATATAGTTTGAAACTTTATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTCGATTCTACACCCCAACTaa > 1:1020121/1‑141 (MQ=255) aTCTGAAAACTTACTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACGCCACAACTaa > 2:332058/1‑141 (MQ=255) aTCTGAAAACTTACTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTaa > 1:961738/1‑141 (MQ=255) aTCTGAAAACTTACTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTaa > 2:1286623/1‑141 (MQ=255) aTCTGAAAACTTACTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTaa > 1:845388/1‑141 (MQ=255) aTCTGAAAACTTACTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTaa > 1:1138065/1‑141 (MQ=255) aaaaCTTACTATAATTGTATAGTTTGAATAATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAgtg > 1:270519/1‑141 (MQ=255) cTTACTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTta > 1:1189645/1‑141 (MQ=255) cTTACTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTta < 1:399583/141‑1 (MQ=255) ttACTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTtat < 2:1095103/141‑1 (MQ=255) tACTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTtata < 1:340805/141‑1 (MQ=255) aCTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATaa > 1:995029/1‑141 (MQ=255) ataATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAatt > 2:234143/1‑141 (MQ=255) ataATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAatt > 2:129953/1‑141 (MQ=255) taATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAatta < 2:1003787/141‑1 (MQ=255) ttGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTAttt < 1:1638070/141‑1 (MQ=255) tataGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGa < 1:1470237/141‑1 (MQ=255) aGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAAt > 2:1147984/1‑141 (MQ=255) aGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAAt > 1:1211170/1‑141 (MQ=255) gTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATa > 1:2326/1‑141 (MQ=255) gTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGATGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATa > 2:1318880/1‑141 (MQ=255) ttGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATaca < 2:301238/141‑1 (MQ=255) gAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTAAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATAcaca < 1:1577999/141‑1 (MQ=255) aaTTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACat < 2:322025/141‑1 (MQ=255) tattTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATAtt < 2:121527/141‑1 (MQ=255) ttttCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTg > 2:1072350/1‑141 (MQ=255) ttttCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTg > 2:421103/1‑141 (MQ=255) ttttCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTg < 2:1362824/141‑1 (MQ=255) tttCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGAt < 1:587481/88‑1 (MQ=255) tttCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGAt > 2:587481/1‑88 (MQ=255) tttCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGt < 2:504419/141‑1 (MQ=255) ttCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTa < 1:757668/141‑1 (MQ=255) cATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTaaa > 1:233388/1‑141 (MQ=255) aaaCCAATACAAAAAAACTAATTATATATAGATTGAAAATATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATACAACACCACAAATAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACAAATATTTGTAAAt > 2:1175004/3‑141 (MQ=255) tACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATg > 1:1607819/1‑141 (MQ=255) ccAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGAt > 2:220221/1‑141 (MQ=255) aCAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTa < 1:1351407/141‑1 (MQ=255) cAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTAt > 2:387215/1‑141 (MQ=255) aaaTTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATc < 1:118265/141‑1 (MQ=255) aaTTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCg > 2:377216/1‑141 (MQ=255) aaTTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCg > 1:900588/1‑141 (MQ=255) aTTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGa < 1:41668/141‑1 (MQ=255) aCTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTa < 1:1286623/141‑1 (MQ=255) aCTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTa > 2:188998/1‑141 (MQ=255) aaTTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAata > 1:21631/1‑141 (MQ=255) aTTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAatat > 1:1240383/1‑141 (MQ=255) tataGATTGAAACTATCTTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTCGTGTTCATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATAAATAGTATCGAATAAAAATAGtatt > 2:984953/1‑141 (MQ=255) aGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTattatt < 2:1086904/141‑1 (MQ=255) tGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAAt < 1:1273740/141‑1 (MQ=255) tGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAAt > 1:874457/1‑141 (MQ=255) gAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAAtt > 2:1540148/1‑141 (MQ=255) aaaCTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAAttt < 1:34494/141‑1 (MQ=255) aaCTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAAtttt > 1:1395215/1‑141 (MQ=255) cTAGATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTtta < 2:623459/141‑1 (MQ=255) atatTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTttatt > 1:1328375/1‑141 (MQ=255) aCTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAACTACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAAttt > 1:1349360/1‑141 (MQ=255) aCTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAAttt > 2:763030/1‑141 (MQ=255) ttAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTg < 2:94321/141‑1 (MQ=255) aaaaTATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTa < 2:615942/94‑1 (MQ=255) aaaaTATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTc > 2:1262922/1‑141 (MQ=255) aaTATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCtt < 2:179311/141‑1 (MQ=255) atatTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTa > 2:932545/1‑141 (MQ=255) tatTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTaa > 1:931411/1‑141 (MQ=255) atTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAAt > 1:630168/1‑141 (MQ=255) tttATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCTCAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAATc < 1:196467/141‑1 (MQ=255) tCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAATCaaaa > 1:1403767/1‑141 (MQ=255) cacttttagttgtggtGTTGAATCAACACAACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAATCaaaa > 1:665403/9‑141 (MQ=39) tAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAATCAAAAaat < 1:1027668/141‑1 (MQ=255) ttaggtgtggggttgAATCAACACAACAACTAACAGTGTTTATAAATTATTGGGGAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGGAGTCGTATTCAAAAaataa > 2:1403130/12‑141 (MQ=255) tgttgttgtGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAATCAAAAAataata < 2:1262575/141‑1 (MQ=255) tgttgtgttgATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGAAAAAATAAAAAAATAatatat < 2:995029/141‑1 (MQ=255) tgtggtgttgAATCAACACAACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAATCAAAAAATAatatat > 2:883620/1‑141 (MQ=255) gttgtgttgATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGaaa > 1:1638302/1‑51 (MQ=255) gttgtgttgATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGaaa < 2:1638302/51‑1 (MQ=255) gttgtgttgATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAATCAAAAAATAATATATg > 1:572812/1‑141 (MQ=255) gttgtgttgATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAATCAAAAAATAATATATg > 2:1579683/1‑141 (MQ=255) ttgtgttgATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAATCAAAAAATAATATATGt > 2:1114548/1‑141 (MQ=255) ttgtgttgATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCATAATCAAAAAATAATATATGt < 2:553169/141‑1 (MQ=255) tggtgttgAATCAACACAACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAATCAAAAAATAATATATGt > 1:160713/3‑141 (MQ=255) tggtgttgAATCAACACAACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATGTTGTAGTCTTAATCAAAAAATAATATATGt > 1:364183/3‑141 (MQ=255) tgtgttgATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAATCAAAAAATAATATATGTc > 2:1033710/1‑141 (MQ=255) gtgttgATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAATCAAAAAATAATATATGTCa < 2:1643790/141‑1 (MQ=255) aataaaTTCAACACCAAAACTAAAATTGTTTATAAATTATTTGAAAATACAAATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAATCAAAAAATAATATATGTCAt < 1:531295/136‑1 (MQ=255) tttaTTAAACACAACAAATAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAAAAAAAAAAAAAAAATAATATATGTCATGt < 2:1164506/138‑1 (MQ=255) ttgATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAATCAAAAAATAATATATGTCATGt > 1:1063534/1‑141 (MQ=255) ttgATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAATCAAAAAATAATATATGTCATGt < 2:279834/141‑1 (MQ=255) ttgATTCAACACAACAACTAAAAGTGTTTATTAAGTTTCTCAGAGTACAGATGGTTGTAAATGAGTTGTAGTTATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAATCAAAAAATAATATATGTCATGt < 1:1073582/141‑1 (MQ=255) aTTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAATCAAAAAATAATATATGTCATGTtat < 1:387215/141‑1 (MQ=255) ttCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAATCAAAAAATAATATATGTCATGTtata > 2:205664/1‑141 (MQ=255) | ATTTTAATTTAGAAAAATCTGAAAACTTACTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAATCAAAAAATAATATATGTCATGTTATA > CP000730/371966‑372246 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |