Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP000730 | 372,114 | 0 | C | A | 6.0% | 481.1 / 11.5 | 153 | intergenic (‑174/‑196) | USA300HOU_0339/lip1 | hypothetical membrane protein/triacylglycerol lipase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (79/63); new base A (8/2); total (87/66) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.90e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
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2:732270/1‑134 (MQ=255) aaCACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAATCAAAAAATAATATATGTCATGTTATATTg < 1:528348/141‑1 (MQ=255) aaCACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAATCAAAAAATAATATATGTCATGTTATATTg > 1:638405/1‑141 (MQ=255) aaCACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAAAAAAAAAAAAAAAATAATATATGTCATGTTATATTg < 2:608668/141‑1 (MQ=255) aaccacAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAAAAAAAAAAAAAAAATAATATATGTCATGTTATATTGaa < 2:130278/140‑1 (MQ=255) | TTAGAAAAATCTGAAAACTTACTATAATTGTATAGTTTGAATTATTTTCATACCAATACAAATTAACTAATTATATATAGATTGAAACTATATTACTTAATAAAATATTTATCTTAAATGTTGTTGTGTTGATTCAACACCACAACTAAAAGTGTTTATAAATTATTTGGAAATACACATATTTGTAAATGATTAGTATCGATTTAATATCGTATTATTAAATTTTTATTAATTTTGTAGTCTTAATCAAAAAATAATATATGTCATGTTATATTGAAGG > CP000730/371974‑372253 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |