Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	CP000730	661760	661892	133	2 [1]	[1] 2	USA300HOU_0603	hypothetical protein

TAGTAAGTACCTGGTTAACTTTATTTCTTCCTATGATTAATTGGTTAATTCCAAAAAAATATGTCAAAATCAGTAAAAAAGAATTTGACGATTTAAACATTGTCAAACCTGTTAAAAATAAAGCTTTTTGGCCAGTTGCAGGT  >  CP000730/661619‑661761                                                                                                                                             |   tAGTAAGTACCTGGTTAACTTTATTTCTTCCTATGATTAATTGGTTAATTCCAAAAAAATATGTCAAAATCAGTAAAAAAGAATTTGACGATTTAAACATTGTCAAACCTGTTAAAAATAAAGCTTTTTGGCCAGTTGCAg    <  2:74221/141‑1 (MQ=255)   gtaaaaaCCTGGTGGACTTTAAATCTGCCAATGATTAATTGGTTAATTCAAAAAAAATATGTAAAAATCAGTAAAAAAGAATTTGACGATTTAAACATTGTCAAACCTGTTAAAAATAAAGCTTTTTGGCCAGTTGCAGgt  <  2:3604/135‑1 (MQ=37)                                                                                                                                             |   TAGTAAGTACCTGGTTAACTTTATTTCTTCCTATGATTAATTGGTTAATTCCAAAAAAATATGTCAAAATCAGTAAAAAAGAATTTGACGATTTAAACATTGTCAAACCTGTTAAAAATAAAGCTTTTTGGCCAGTTGCAGGT  >  CP000730/661619‑661761

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑