| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 62771 = | 24 (0.270) | 7 (0.080) | 3/240 | NT | 34.7% | intergenic (+36/+275) | USA300HOU_0056/speG | hypothetical protein/diamine N‑acetyltransferase |
| ? | CP000730 | 62827 = | 4 (0.050) | intergenic (+92/+219) | USA300HOU_0056/speG | hypothetical protein/diamine N‑acetyltransferase | |||||
ATTATTAAAACAACGCAAACAAGGCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGATTTTATCAAGAATTTATTCCTCTTACAGACAT > CP000730/62687‑62964 | aaaacaacgcaaacaaggcttactacaaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaacaataaattgcgcggatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTttgtt < 1:759564‑M2/10‑1 (MQ=255)aaaacaacgcaaacaaggcttactacaaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTttgtt < 1:398751‑M2/10‑1 (MQ=255) caacgcaaacaaggcttactacaaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTGTTGTTGaaa < 1:954192‑M2/14‑1 (MQ=255) aacgcaaacaaggcttactacaaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAAt > 1:109033‑M2/127‑141 (MQ=255) cgcaaacaaggcttactacaaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTa > 1:614880‑M2/125‑141 (MQ=255) cgcaaacaaggcttactacaaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTa < 1:245937‑M2/17‑1 (MQ=255) cgcaaacaaggcttactacaaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTa > 1:311713‑M2/125‑141 (MQ=255) cgcaaacaaggcttactacaaaaaatgtttctgtaattcagataaagccctattatgttaactgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATCTTTGTTGAACTTa > 2:217969‑M2/125‑141 (MQ=255) gcaaacaaggcttactacaaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTaa > 2:1007824‑M2/124‑141 (MQ=255) gcaaacaaggcttactacaaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTaa < 1:298944‑M2/18‑1 (MQ=255) gcaaacaaggcttactacaaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTaa > 2:1007713‑M2/124‑141 (MQ=255) aaacaaggcttactacacaaactgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAata > 2:1086892‑M2/122‑141 (MQ=255) caaggcttactacaaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATaa < 1:943945‑M2/23‑1 (MQ=255) caaggcttactacaaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATaa < 2:689766‑M2/23‑1 (MQ=255) caaggcttactacaaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATaa < 1:479330‑M2/23‑1 (MQ=255) aaggcttactacaaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAg < 1:549211‑M2/24‑1 (MQ=255) aaggcttactacaaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctaaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAg < 1:195625‑M2/24‑1 (MQ=255) aggcttactacaaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGc < 1:691745‑M2/25‑1 (MQ=255) gcttactacaaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCtt > 1:111370‑M2/115‑141 (MQ=255) ttactacaaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATATTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCa > 2:923767‑M2/113‑141 (MQ=255) tactacaaaaaatgtttgtgtaatcctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCAt > 1:252302‑M2/112‑141 (MQ=255) caaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTga < 1:3337‑M2/35‑1 (MQ=255) caaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTga > 2:721439‑M2/107‑141 (MQ=255) tgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGatagatag < 2:264438‑M2/42‑1 (MQ=255) gtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGt > 2:934178‑M2/99‑141 (MQ=255) ttgtgtanttctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCa < 2:811464‑M2/45‑1 (MQ=255) ttgtgtaattctgataacgtcttattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCa < 2:699347‑M2/45‑1 (MQ=255) ttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaataggcaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCa > 1:792731‑M2/97‑141 (MQ=255) ttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCa > 2:829930‑M2/97‑141 (MQ=255) ttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCa < 1:850334‑M2/45‑1 (MQ=255) tgtgtaattctgataacttcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCAt < 1:874704‑M2/46‑1 (MQ=255) tgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCAt > 2:663150‑M2/96‑141 (MQ=255) gtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCAtt > 1:1070241‑M2/95‑141 (MQ=255) gtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATtaa < 2:764665‑M2/49‑1 (MQ=255) taattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATtaat < 2:738046‑M2/50‑1 (MQ=255) tgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGt < 2:736653‑M2/56‑1 (MQ=255) ataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGttt < 1:222013‑M2/58‑1 (MQ=255) gtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCaaa < 1:839945‑M2/63‑1 (MQ=255) cctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATc > 2:591443‑M2/77‑141 (MQ=255) atgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagatcatcccttaccgcaaagttaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGttatt < 2:261911‑M2/71‑1 (MQ=255) atgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGttatt < 2:452030‑M2/71‑1 (MQ=255) tgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGttatta > 1:320167‑M2/70‑141 (MQ=255) taattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGt < 2:444535‑M2/75‑1 (MQ=255) aattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTa > 2:1034240‑M2/66‑141 (MQ=255) tgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCg < 1:715230‑M2/79‑1 (MQ=255) gaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCgt < 2:1011213‑M2/80‑1 (MQ=255) gaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCgt < 2:474107‑M2/80‑1 (MQ=255) aaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCgtt > 1:668338‑M2/61‑141 (MQ=255) aaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCgttg > 1:236933‑M2/60‑141 (MQ=255) aatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCgttgt > 2:953816‑M2/59‑141 (MQ=255) aataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGtca < 2:866042‑M2/93‑1 (MQ=255) CAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGtcatc > 1:684011‑M1/1‑141 (MQ=255) aaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGtcatca > 1:356240‑M2/46‑141 (MQ=255) ttgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCAtcattc < 1:800155‑M2/99‑1 (MQ=255) atcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATc > 1:100233‑M2/35‑141 (MQ=255) tccttcactttgcggtaagggatgctctcaatttatttttgtTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATcc > 1:181751‑M2/43‑141 (MQ=255) tcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTCATATTCGTTCGAAAGTAGTTCTTATGTAACGTTGTTACAGAGTCATCATTCATAAAATcc > 1:643815‑M2/34‑141 (MQ=255) cttcactttgcggtaagggatgctctcaatttatttttttTTTTATTTATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTc > 2:499008‑M2/41‑141 (MQ=255) cttcactttgcggtaagggatgctctcaatttatttttgtTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTc > 2:756476‑M2/41‑141 (MQ=255) cttcactttgcggtaagggatgctctcaatttatttttgtTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTc > 1:222210‑M2/41‑141 (MQ=255) cttcactttgcggtaagggatgctctcaatttatttttgtTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTc > 2:667013‑M2/41‑141 (MQ=255) cttcactttgcggtaagggatgctctcaatttatttttgtTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTc > 2:667084‑M2/41‑141 (MQ=255) ttcactttgcggtaagggatgctctcaatttatttttgtTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACGGCGTCATCATTCATAAAATCCTCg > 1:796004‑M2/40‑141 (MQ=255) gCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTTTTTTTTTTTTTATAAGATTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGTGTTATCATTCATAAATTCCTct > 2:113003/1‑140 (MQ=255) cttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCg < 1:328453‑M2/111‑1 (MQ=255) ttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGt < 2:577114‑M2/112‑1 (MQ=255) ttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGt < 2:577327‑M2/112‑1 (MQ=255) taccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTa > 1:1068794‑M2/29‑141 (MQ=255) accgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCataaaatctacgagg < 2:272676‑M2/114‑8 (MQ=255) ccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTTTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGa > 2:405602‑M2/27‑141 (MQ=255) ccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGa < 2:221445‑M2/115‑1 (MQ=255) cgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGAt < 1:607293‑M2/116‑1 (MQ=255) caaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCattcataaaatctacgaggattt < 2:515562‑M2/118‑12 (MQ=255) aaaagtaaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGAttt < 2:727681‑M2/118‑1 (MQ=255) aaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGAtttt < 2:854267‑M2/119‑1 (MQ=255) aagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGATTTTa > 2:1061965‑M2/22‑141 (MQ=255) agtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGATTTTAt > 2:821536‑M2/21‑141 (MQ=255) agtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGATTTTAt > 2:464933‑M2/21‑141 (MQ=255) gtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGATTTTATc < 2:1070241‑M2/122‑1 (MQ=255) tgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGATTTTATCa > 2:616773‑M2/19‑141 (MQ=255) aaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGATTTTATCAAg > 1:804945‑M2/17‑141 (MQ=255) aaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGATTTTATCAAg > 1:889650‑M2/17‑141 (MQ=255) aaGTGCAGGATGCTCTATTTTTTTTTTTTTTAATATAAGCTTCATTCTGAGATATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGATTTNATCAAGa > 2:813516/1‑141 (MQ=255) tGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGATTTTATCAAGAAtt < 1:913613/141‑1 (MQ=255) ctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATACTCGTAGATTTTATCAAGAATTTAt > 2:255220‑M2/10‑141 (MQ=255) tctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGATTTTATCAAGAATTTAtt < 2:79500‑M2/133‑1 (MQ=255) aTGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGATTTTATCAAGAATTTATTcc < 1:174091/141‑1 (MQ=255) atttttgtTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGATTTTATCAAGAATTTATTCCTCTTACa < 2:320167‑M2/133‑1 (MQ=255) tttttgtTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGATTTTATCAAGAATTTATTCCTCTTACAg < 2:638064‑M2/134‑1 (MQ=255) tttgtTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTAATCTGAACCTCGTAGATTTTATCAAGAATTTATTCCTCTTACAGAc < 1:1062794‑M2/136‑1 (MQ=255) tgtTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGATTTTATCAAGAATTTATTCCTCTTACAGACAt < 1:338474‑M2/138‑1 (MQ=255) | ATTATTAAAACAACGCAAACAAGGCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGATTTTATCAAGAATTTATTCCTCTTACAGACAT > CP000730/62687‑62964 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |