New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | CP000730 | 1575673 = | 81 (0.910) | 7 (0.080) | 5/248 | NT | 8.2% | coding (1844/6201 nt) | hlgB | possible bacteriophage tail protein |
? | CP000730 | 1575710 = | 78 (0.920) | coding (1807/6201 nt) | hlgB | possible bacteriophage tail protein |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGTACCAACTATTGT > CP000730/1575570‑1575848 | ccAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTgag > 1:775345/1‑141 (MQ=255) ccAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTgag > 1:236015/1‑141 (MQ=255) cAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTgaga < 2:101213/141‑1 (MQ=255) cttgattgaagcgggaccagataaaattaatagctatagtaaatccttaaagaattccaatggcgaaagtaaaaaagcagcagatttgatgaaagataatcTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGAt > 1:465208‑M1/102‑141 (MQ=255) 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(MQ=255) aaaTCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATc > 2:1046165/1‑141 (MQ=255) cAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCtt < 1:707412/141‑1 (MQ=255) aaCTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCttt < 1:105198/141‑1 (MQ=255) aaCTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCttt > 1:738669/1‑141 (MQ=255) aCTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCtttt > 1:987324/1‑141 (MQ=255) tttGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCACATCTGCTGCTTTTTTACtt < 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< 2:625776/141‑1 (MQ=255) aaTTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTtgct < 1:790493/141‑1 (MQ=255) aTTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTtactg < 2:201041/141‑1 (MQ=255) tGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTgctgct > 1:569416/1‑141 (MQ=255) cAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGt > 1:106591/1‑141 (MQ=255) agagCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGTa < 2:806780/141‑1 (MQ=255) agagCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAAATCTTTAAGGATTTAGTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGTa > 1:836524/1‑141 (MQ=255) gcgcCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGTACCa < 1:867273/141‑1 (MQ=255) gcgcCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGTACCa < 1:358425/141‑1 (MQ=255) gcgcCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGTACCa < 2:898176/141‑1 (MQ=255) gcCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGTACCAAc < 2:165646/141‑1 (MQ=255) ccTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATGTGGTCCTGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCAACTTGCTGATTCAGTACCAACt > 1:374035/1‑141 (MQ=255) ccTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGTCTAAAAATTCACTTGCTGCTTCATNTCCAACt > 2:813118/1‑141 (MQ=255) ttgaGATTATCTTTCATCAACTCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGTACCAACTAtt > 2:483365‑M2/5‑141 (MQ=255) ttgaGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGTACCAACTAtt > 1:924918‑M2/5‑141 (MQ=255) gaGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGTACCAACTATTGt < 2:931579‑M2/139‑1 (MQ=255) | CCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGTACCAACTATTGT > CP000730/1575570‑1575848 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |