Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP000730 | 392,622 | G→A | 5.7% | A229A (GCG→GCA) | yhbW → | possible alkanal monooxygenase (FMN‑linked) |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP000730 | 392,622 | 0 | G | A | 5.7% | 314.1 / 4.4 | 100 | A229A (GCG→GCA) | yhbW | possible alkanal monooxygenase (FMN‑linked) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (47/47); new base A (4/2); total (51/49) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.78e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-01 |
TTGCCAATATGGCGTGCTGTTGGTGGTCCACCTGCAAGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGAATACAGGGATGTCATTTATTCGTG > CP000730/392485‑392761 | ttGCCAATATGGCGTGCTGTTGGTGGTCCACCTGCAAGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCCATGATGCTTACCACCCCTGGTGGCCCCGCCATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCa < 1:432373/141‑1 (MQ=255) tGCCAATATGGCGTGCTGTTGGTGGTCCACCTGCAAGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCaa > 2:344223/1‑141 (MQ=255) aaTATGGCGTGCTGTTGGTGGTCCACCTGCAAGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGa > 1:489755/1‑141 (MQ=255) atGGCGTGCTGTTGGTGGTCCACCTGCAAGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGc < 1:846646/141‑1 (MQ=255) ggCGTGCTGTTGGTGGTCCACCTGCAAGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAg > 1:897285/1‑141 (MQ=255) cGTGCTGTTGGTGGTCCACCTGCAAGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGt > 1:691747/1‑141 (MQ=255) gtccTGTTGGTGGTCCACCTGAAAGTGCTATTAAAGCGGGAACACAAGGAGAGACACCGACGCTCACACACCCCAGTGGCTCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCatcga < 1:102910/138‑5 (MQ=255) gCTGTTGGTGGTCCACCTGCAAGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTc > 2:72900/1‑141 (MQ=255) gCTGTTGGTGGTCCACCTGCAAGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTc > 1:238545/1‑141 (MQ=255) cTGTTGGTGGTCCACCTGCAAGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCg < 2:32686/141‑1 (MQ=255) cTGTTGGTGGTCCACATGCAAGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCg < 1:811290/141‑1 (MQ=255) tggtggTCCACCTGCAAGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGc < 2:28101/141‑1 (MQ=255) tggtggTCCACCTGCAAGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGc < 2:689070/141‑1 (MQ=255) ggtggtCCACCTGCAAGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCt > 1:779352/1‑141 (MQ=255) tCCACCTGCAAGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGcc > 1:402123/1‑141 (MQ=255) ccACCTGCAAGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCt > 1:648607/1‑141 (MQ=255) ccACCTGCAAGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCt > 1:513406/1‑141 (MQ=255) ccACCTGCAAGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCAGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGcat < 1:468746/141‑3 (MQ=255) cACCTGCAAGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTa < 1:141014/141‑1 (MQ=255) cACCTGCAAGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTCAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTa < 1:142821/141‑1 (MQ=255) aCCTGCAAGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTaa < 1:983304/141‑1 (MQ=255) cTGCAAGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGt > 2:782316/1‑141 (MQ=255) aGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTa < 1:111798/141‑1 (MQ=255) gCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCa > 2:821715/1‑141 (MQ=255) gCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCa < 1:341986/141‑1 (MQ=255) gCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTCATCGTCACGCGGCAACTGAAGCAGGTATCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCa > 2:601435/1‑141 (MQ=255) aTTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCAGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCATAAGTCTTTACCagta > 2:553659/1‑141 (MQ=255) tAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTNGATGCTTCGCCTNAGTCTTTACCagtaag < 1:761207/141‑1 (MQ=255) aaaGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAATGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCagtaagt < 1:684271/141‑1 (MQ=255) aaGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCagtaagta > 2:347054/1‑141 (MQ=255) aGCGGGAAAACAAGGTGGGCCAATGATGATTACAACCCGGGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAGAGGGTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTGCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTAc > 2:648050/1‑141 (MQ=255) cGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAg > 1:552044/1‑141 (MQ=255) gggAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTGAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCGTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGc > 1:162333/1‑141 (MQ=255) gggAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTAAAAGCATTGGTATCAAAGTAATGAACATTAAAGGTTCTATAGTTTCTTATCGTGAAGAAGTATCTGAAGCAGGGTTAGTTGCTTCGCCTAATTCATTACCAGTAAGTAAAgg > 2:950860/1‑140 (MQ=255) ggAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCg < 2:233385/141‑1 (MQ=255) aCAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCt < 2:823442/141‑1 (MQ=255) aGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGtt > 2:992092/1‑141 (MQ=255) ggTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGttt < 1:265581/141‑1 (MQ=255) gtgtGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGtttt > 1:367287/1‑141 (MQ=255) gtgCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTtat < 1:1032295/141‑1 (MQ=255) gtgCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTtat < 2:408044/141‑1 (MQ=255) tgCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTtata < 2:255875/141‑1 (MQ=255) cAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAg < 2:878718/141‑1 (MQ=255) cAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAg > 2:83998/1‑141 (MQ=255) tgatgaTTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTg < 1:586602/141‑1 (MQ=255) tgatTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGaaa > 1:524435/1‑141 (MQ=255) tgatTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGaaa > 2:1055602/1‑141 (MQ=255) gatTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAaac < 2:1006575/141‑1 (MQ=255) atTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAaact > 2:1044561/1‑140 (MQ=255) atTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAaaca > 1:507646/1‑141 (MQ=255) ttACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAaacaa > 1:346570/1‑141 (MQ=255) tACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAaacaac > 1:580824/1‑141 (MQ=255) aCAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGATTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACt > 1:237611/1‑141 (MQ=255) aCCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGACACAACCCAg > 1:730871/1‑141 (MQ=255) cccTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAgg < 2:990655/141‑1 (MQ=255) cccTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAgg < 1:596784/141‑1 (MQ=255) cccTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAgg < 2:317057/141‑1 (MQ=255) cccTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAgg < 2:1053090/141‑1 (MQ=255) ccTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGa < 1:929403/141‑1 (MQ=255) cTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGTAt < 2:161158/141‑1 (MQ=255) cTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGAt < 1:756670/141‑1 (MQ=255) cTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCGATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCATGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGAt < 1:644941/141‑1 (MQ=255) gtggCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTa > 1:808031/1‑141 (MQ=255) tggCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAaacaaaccagtttattaa > 2:15548/1‑128 (MQ=255) tggCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTAt > 2:969527/1‑141 (MQ=255) tggCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGCTTTATACAGCTGAaacaaaccagtttattaa > 2:15626/1‑128 (MQ=255) gCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATga > 1:970190/1‑141 (MQ=255) ccAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATgaga < 1:688268/141‑1 (MQ=255) ccAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATgaga > 2:133834/1‑141 (MQ=255) cAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACt > 1:804268/1‑125 (MQ=255) cAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACt < 2:804268/125‑1 (MQ=255) aGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATCCAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATgagaga < 2:227078/141‑1 (MQ=255) gAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTa < 1:818226/141‑1 (MQ=255) aaCTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTAt < 1:42033/141‑1 (MQ=255) cTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATcc < 1:923278/141‑1 (MQ=255) tttAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCca > 2:457857/1‑141 (MQ=255) aaaGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACAt > 1:295495/1‑141 (MQ=255) gTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGa > 1:912042/1‑141 (MQ=255) ttCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGaa < 1:516898/141‑1 (MQ=255) tCTATAGATGCTTATCGTCAAGCAGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCATAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGAAt > 1:576923/1‑141 (MQ=255) gATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGAATACAggg > 1:138026/1‑141 (MQ=255) gATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGAATACAggg > 2:1057458/1‑141 (MQ=255) aTGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTACGTACAGCGAGTCCTTTTTATATGGTGCAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGAATACAGGGa > 1:1028185/1‑141 (MQ=255) aTGCTTATCGTCAAGCAGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCATAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGAATACAGGGa > 2:635431/1‑141 (MQ=255) gCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATGTTATCCACATTTGAATACAGGGATg > 1:662888/1‑141 (MQ=255) tATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGAATACAGGGATGTCa > 1:851810/1‑141 (MQ=255) tATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGAATACAGGGATGTCa < 1:636446/141‑1 (MQ=255) tATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGAATACAGGGATGTCa < 2:452805/141‑1 (MQ=255) aTCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGAATACAGGGATGTCAt > 2:584020/1‑141 (MQ=255) aTCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGAATACAGGGATGTCAt < 2:362838/141‑1 (MQ=255) tCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGAATACAGGGATGTCAtt < 1:344223/141‑1 (MQ=255) cGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGAATACAGGGATGTCAttt < 1:808796/141‑1 (MQ=255) tCAAGCAGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCATAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGAATACAGGGATGTCATTTAt < 2:153083/141‑1 (MQ=255) cAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGAATACAGGGATGTCATTTAtt > 2:746743/1‑141 (MQ=255) cAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGAATACAGGGATGTCATTTAtt < 1:84988/141‑1 (MQ=255) aaGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGAATACAGGGATGTCATTTATTc < 1:397300/141‑1 (MQ=255) aGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGAATACAGGGATGTCATTTATTCg < 1:309697/141‑1 (MQ=255) aGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGAATACAGGGATGTCATTTATTCg < 2:23428/141‑1 (MQ=255) cGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGAATACAGGGATGTCATTTCTTCgtg > 2:637903/1‑141 (MQ=255) cGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGAATACAGGGATGTCATTTATTCgtg > 2:230389/1‑141 (MQ=255) | TTGCCAATATGGCGTGCTGTTGGTGGTCCACCTGCAAGTGCTATTAAAGCGGGAAAACAAGGTGTGCCAATGATGATTACAACCCTTGGTGGCCCAGCAATGAACTTTAAAGGTTCTATAGATGCTTATCGTCAAGCGGCAACTGAAGCAGGTTTCGATGCTTCGCCTAAGTCTTTACCAGTAAGTACAGCGAGTCTGTTTTATACAGCTGAAACAACTCAGGATGCTATGAGAGAATTTTATCCACATTTGAATACAGGGATGTCATTTATTCGTG > CP000730/392485‑392761 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |