Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP000730 | 495,436 | C→T | 5.9% | A228T (GCA→ACA) | yibE ← | hypothetical membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP000730 | 495,436 | 0 | C | T | 5.9% | 249.3 / 4.1 | 86 | A228T (GCA→ACA) | yibE | hypothetical membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/45); new base T (2/3); total (37/49) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.91e-01 |
TTCATGCATACCACTAGCAATTGTAATTGCAACATCCATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAGCAATAAAGTGAGTATTGTTGAACAGATCATGGCAATGGT > CP000730/495296‑495574 | ttCATGCATACCACTAGCAATTGTAATTGCAACATCCATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGc < 1:174680/141‑1 (MQ=255) tCATGCATACCACTAGCAATTGTACTTGCAACATCCATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGcc < 1:40244/141‑1 (MQ=255) aTGCATACCACTAGCAATTGTAATTGCAACATCCATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCATTTACCATCTGCCaa > 2:368976/1‑140 (MQ=255) tACCACTAGCAATTGTAATTGCAACATCCATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTAGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCatatata < 2:134953/141‑1 (MQ=255) ccACTAGCAATTGTAATTGCAACATCCATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATg < 1:155383/141‑1 (MQ=255) cACTAGCAATTGTAATTGCAACATCCATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGa < 1:223533/141‑1 (MQ=255) cACTAGCAATTGTAATTGCAACATCCATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGa < 2:700203/141‑1 (MQ=255) aCTAGCAATTGTAATTGCAACATCCATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGAt < 2:617645/141‑1 (MQ=255) cTAGCAATTGTAGTTGCAACATCCATAATGGGGCCAAGTGAGCCTATTAACACTGGGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGAtt < 2:409043/141‑1 (MQ=255) gCAATTGTAATTGCAACATCCATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATATTTCGGTGGTGAGGAGAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAAt > 1:486859/1‑141 (MQ=255) aaTTGTAATTGCAACATCCATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCCTATTTAATGCCTTTACCATATGCCATATATATGATTAAtta > 2:769044/1‑140 (MQ=255) aTTGTAATTGCAACATCCATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCt > 2:824374/1‑141 (MQ=255) aTTGTAATTGCAACATCCATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCt > 1:129530/1‑141 (MQ=255) ttGTAATTGCAACATCCATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACAATCTGCCATATATATGATTAATTCTg > 1:740485/1‑141 (MQ=255) gTAATTGCAACATCCATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGtt > 2:553798/1‑141 (MQ=255) gTAATTGCAACAGCCATAATAGCGCCAAGTGATCCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGtt < 2:364558/141‑1 (MQ=255) cAACATCCATAATAGCGCCTAGTGAACCTATTAACACTGCGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCta > 2:305494/1‑141 (MQ=255) cAACATCCATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCta > 1:809078/1‑141 (MQ=255) aaCATCAATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAGCACTGAGGCTAGTAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTaaaaatat < 2:73013/141‑6 (MQ=255) aCATCCATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCtata < 2:1076627/141‑1 (MQ=255) aTCCATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAAAACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACt < 2:891905/141‑1 (MQ=255) tCCATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATACTGTTAAACCTATACTc > 2:922124/1‑141 (MQ=255) ccATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCa < 1:1042378/141‑1 (MQ=255) ccATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCa < 2:984432/141‑1 (MQ=255) ccATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATAATCa < 2:626333/141‑1 (MQ=255) cATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGTCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCaa < 2:546655/141‑1 (MQ=255) cATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCaa < 1:793675/141‑1 (MQ=255) ataataGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCaaa < 1:737730/141‑1 (MQ=255) aataGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCaaaaa > 1:291049/1‑141 (MQ=255) gcgcCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGtt < 1:755293/141‑1 (MQ=255) cgcCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTc > 1:148023/1‑141 (MQ=255) ccAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCg > 2:869748/1‑141 (MQ=255) aaGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGAt > 2:987955/1‑141 (MQ=255) gTGAACCTATTAACACAGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACAAAAAAAAAAAAAAGTTCCGATaa < 2:791231/141‑1 (MQ=255) aCCTATTAACACTGAGGCTAGGGAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGCTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATCCTCAAAAAAGTTCCGATAATTGt > 2:144104/1‑141 (MQ=255) aCCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTCCGATAATTGt < 2:992986/141‑1 (MQ=255) ccTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTa < 1:174459/141‑1 (MQ=255) ccTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTa > 1:373035/1‑141 (MQ=255) ccTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTa < 1:238812/141‑1 (MQ=255) ttAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTgg < 1:190629/141‑1 (MQ=255) acacTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACAAAAAAAAAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTa < 2:547114/141‑1 (MQ=255) cacTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTAt > 2:842302/1‑141 (MQ=255) acTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATg < 1:286749/141‑1 (MQ=255) cTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATgg > 1:974518/1‑141 (MQ=255) cTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATgg > 2:769778/1‑141 (MQ=255) tGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGt > 1:234755/1‑141 (MQ=255) aGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTaa < 2:388108/141‑1 (MQ=255) gCTAGGAAGATGTCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCATTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATg < 2:51254/141‑1 (MQ=255) tatCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCa < 1:225317/141‑1 (MQ=255) atCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCat > 1:848635/1‑141 (MQ=255) cTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCatat > 2:778981/1‑141 (MQ=255) tCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGcc > 2:671616/1‑141 (MQ=255) cGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCa < 1:834564/141‑1 (MQ=255) cGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCa < 1:834547/141‑1 (MQ=255) cGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCa < 1:707922/141‑1 (MQ=255) tggtTATGTTAAAAAGATCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCAAATATATGATCAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACAGGCTATGGTAATCAGTGTACGCATATGCCAGcc > 2:442230/1‑141 (MQ=255) tAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGt < 1:917399/141‑1 (MQ=255) aTAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGTCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGa > 2:747508/1‑141 (MQ=255) tAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAg < 2:208172/141‑1 (MQ=255) tAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAg < 1:72398/141‑1 (MQ=255) tAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAg < 2:253750/141‑1 (MQ=255) aaaaGTTCATCGTTTGATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAGCa < 1:901084/141‑1 (MQ=255) aaaaGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAGCa < 2:599932/141‑1 (MQ=255) aaaaGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAGCa < 2:382736/141‑1 (MQ=255) aaaaGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACACAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAGCa < 2:336290/141‑1 (MQ=255) aaaaGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCAGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAGCa > 1:872688/1‑141 (MQ=255) gTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAGCAATaa > 2:488134/1‑141 (MQ=255) aTCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAGCAATAAAGTg > 1:877317/1‑141 (MQ=255) cGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAGCAATAAAGTGAg > 1:226572/1‑141 (MQ=255) tCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAGCAATAAAGTGAGTAtt < 1:617882/141‑1 (MQ=255) tatTTCTTGCCTGTATCTTCTTTCATATATATTATTTATTCTATTGATCTTTTACTCTAAAAATATCCGTTAACTTTACTTACTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGGACGTTGCAATAATGTGAGTTctgtt < 2:873815/141‑1 (MQ=255) aTGCCTTTACCATCTGTCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAGCAATAAAGTGAGTATTGTTGAACAg < 2:933968/141‑1 (MQ=255) aTGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAGCAATAAAGTGAGTATTGTTGAACAg > 1:883554/1‑141 (MQ=255) tGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAGCAATAAAGTGAGTATTGTTGAACAGa < 1:107438/141‑1 (MQ=255) ccTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAGCAATAAAGTGAGTATTGTTGNACAGATc > 2:811575/1‑141 (MQ=255) ccTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAGCAATAAAGTGAGTATTGTTGAACAGATc > 2:898475/1‑141 (MQ=255) ccTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATACCAGCCTGTAACGAGCAATAAAGTGAGTATTGTTGAACAGATc > 1:827787/1‑141 (MQ=255) cTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAGTTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAGCAATAAAGTGAGTATTGTTGAACAGATCa > 1:212041/1‑141 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1:492172/1‑141 (MQ=255) tCTGCCATATATATGAATAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAGCAATAAAGTGAGTATTGTTGAACAGATCATGGCAATg < 2:514380/141‑1 (MQ=255) tGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAGCAATAAAGTGAGTATTGTTGAACAGATCATGGCAATGGt < 1:769778/141‑1 (MQ=255) tGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAGCAATAAAGTGAGTATTGTTGAACAGATCATGGCAATGGt > 1:404979/1‑141 (MQ=255) tGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAGCAATAAAGTGAGTATTGTTGAACAGATCATGGCAATGGt < 2:871534/141‑1 (MQ=255) | TTCATGCATACCACTAGCAATTGTAATTGCAACATCCATAATAGCGCCAAGTGAACCTATTAACACTGAGGCTAGGAAGATATCTTTCGGTGGTAATGATAAAAAGTTCATCGTTTCATATTTAATGCCTTTACCATCTGCCATATATATGATTAATTCTGTTAAACCTATACTCAAAAAAGTTCCGATAATTGTACTGGCTATGGTAATGAGTGTACGCATATGCCAGCCTGTAACGAGCAATAAAGTGAGTATTGTTGAACAGATCATGGCAATGGT > CP000730/495296‑495574 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |