| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 534,181 | C→G | 6.1% | intergenic (+3752/‑1973) | veg → / → rplY | hypothetical protein/ribosomal protein L25 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 534,181 | 0 | C | G | 6.1% | 317.9 / 12.4 | 100 | intergenic (+3752/‑1973) | veg/rplY | hypothetical protein/ribosomal protein L25 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (40/53); new base G (3/3); total (43/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.63e-01 | |||||||||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
TAGTTCAGGTATTTTTGCGTTTAATAATAAAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCTAAATGGTGTGACAATCATCGATCCTGACAGCACT > CP000730/534043‑534319 | tAGTTCAGGTATTTTTGCGTTTAATAATAAAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTa > 2:69606/1‑141 (MQ=255) aGTTCAGGTATTTTTGCGTTTAATAATAAAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTcggg > 2:110992/1‑138 (MQ=255) aGTTCAGGTATTTTTGCGTTTAATAATAAAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTAt > 1:416130/1‑141 (MQ=255) aGTTCAGGTATTTTTGCGTTTAATAATAAAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTAt < 1:974332/141‑1 (MQ=255) gTTCAGGTATTTTTGCGTTTAATAATAAAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATc > 1:968920/1‑141 (MQ=255) tCAGGTATTTTTGCGTTTAATAATAAAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGt < 2:310520/141‑1 (MQ=255) aGGTATTTTTGCGTTTAATAATAAAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTAc < 2:1042866/141‑1 (MQ=255) ggTATTTTTGCGTTTAATAATAAAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTAcc > 1:239071/1‑141 (MQ=255) aTTTTTGCGTTTAATAATAAAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAat < 2:114919/141‑1 (MQ=255) tttttttttttttataaAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTTGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAatgat > 2:91839/14‑141 (MQ=255) tttttttttttataaAACGAGGTTTGAAAAATTAATACAAGTGAAAAATGATAATGCGCCAGGTGAATATTACCTCCCTGCTGTATTTTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGAAGAAGTCTATCGTATCAATGATGt > 2:240677/12‑141 (MQ=255) gCGTTTAATAATAAAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGtt < 2:1034750/141‑1 (MQ=255) gCGGTTAATAATAAAACTTTGTGTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGTATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGAGGtt < 2:643896/141‑1 (MQ=255) tttttttttataaAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTg > 2:1002929/10‑141 (MQ=255) cGTTTAATAATAAAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTg > 2:528669/1‑141 (MQ=255) tttAATAATAAAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTgaa < 2:804543/141‑1 (MQ=255) tttAATAATAAAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTgaa < 1:139297/141‑1 (MQ=255) ttAATAATAAAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTGTATCGTACCAATGATGTTgaag < 2:240934/141‑1 (MQ=255) ttAATAATAAAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTGTATCGTACCAATGATGTTgaag < 1:602822/141‑1 (MQ=255) ttAATAATAAAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTgaag < 1:485950/141‑1 (MQ=255) ttAATAATAAAACGTTGTCTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGGCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAAGGATGTTgaag < 2:535408/141‑1 (MQ=255) aataaAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATc > 1:769041/1‑141 (MQ=255) aataaAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGCATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATc > 2:1047412/1‑141 (MQ=255) ataaAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCa < 2:694434/141‑1 (MQ=255) taaAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCAt > 1:397753/1‑141 (MQ=255) aaaaCGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATg > 2:529146/1‑141 (MQ=255) aaCGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATggg > 2:497484/1‑141 (MQ=255) cGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGTAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGgtg < 1:737678/141‑1 (MQ=255) cGTTGTATGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGgtg < 2:406188/141‑1 (MQ=255) cGTAGTGTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATAATAATGCGCAAGGTGAATAGTACCACACTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGAGGCATCGTAGAAGTCAATCGTAACCATGATTTTGAAGAAATCATGGgtg < 2:305323/141‑1 (MQ=255) ttgttTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTa > 1:693912/1‑141 (MQ=255) gttTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTaaa > 2:150643/1‑141 (MQ=255) gttTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTaaa > 2:543730/1‑141 (MQ=255) gttTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTaaa > 1:994302/1‑141 (MQ=255) gttTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTaaa > 1:11583/1‑141 (MQ=255) gttTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTaaa > 2:263591/1‑141 (MQ=255) tGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGa > 2:196376/1‑141 (MQ=255) aaaaTTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCg > 1:796092/1‑141 (MQ=255) aaaaTTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCg < 2:360110/141‑1 (MQ=255) aaTTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCgtg < 1:556782/141‑1 (MQ=255) aaCACAAGTCAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCACAGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATTATCGTGTaaa > 2:889236/1‑140 (MQ=255) cacaAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGc < 1:173613/141‑1 (MQ=255) acaAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCt < 2:765324/141‑1 (MQ=255) caAGTGAAGAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGACGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCtt < 1:563457/141‑1 (MQ=255) tGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTc < 2:354785/141‑1 (MQ=255) aaaTGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGc > 1:621231/1‑141 (MQ=255) aaaTGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGc > 1:319339/1‑141 (MQ=255) aaaTGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGc > 1:417776/1‑141 (MQ=255) aTGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTg > 1:968280/1‑141 (MQ=255) tGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTga < 1:518824/141‑1 (MQ=255) cgcAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGa > 2:497472/1‑141 (MQ=255) cgcAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGa < 1:917168/141‑1 (MQ=255) aaGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGc < 1:533609/141‑1 (MQ=255) aGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTGTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCa > 2:947280/1‑141 (MQ=255) tGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAAcg < 2:662831/141‑1 (MQ=255) gAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAAcgt > 2:494941/1‑141 (MQ=255) atatTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAAcgtcg < 2:192932/141‑1 (MQ=255) atatTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAAcgtcg > 1:451529/1‑141 (MQ=255) atatTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAAcgtcg < 2:868732/141‑1 (MQ=255) atTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTGTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAgg > 1:375970/1‑117 (MQ=255) atTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTGTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAgg < 2:375970/117‑1 (MQ=255) ttACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTAc < 1:88101/141‑1 (MQ=255) agcacaattaTGTAGTGACATTAATATTAAATGAAGGCGGCATCGTAGAAGTAAATAAAAAAAAAAATATTAAAAAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGa < 2:255780/132‑1 (MQ=255) ccTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGaa < 2:682429/141‑1 (MQ=255) cTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAAt > 2:823533/1‑141 (MQ=255) cTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAAt > 1:382822/1‑141 (MQ=255) catGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCAt > 1:951235/3‑141 (MQ=255) cTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCAtt > 2:111493/1‑141 (MQ=255) tGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTa < 2:769041/141‑1 (MQ=255) tATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATcaca < 2:686645/141‑1 (MQ=255) aTTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACAt < 2:778997/141‑1 (MQ=255) ttGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACTTCGTACGAATCATTATCACATg < 1:401910/141‑1 (MQ=255) ttGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATg > 1:262186/1‑141 (MQ=255) ttGGCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATGGTAGAGGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATg < 2:265183/141‑1 (MQ=255) tGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGc > 2:366939/1‑141 (MQ=255) gTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCt < 2:1062866/141‑1 (MQ=255) tCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCTa > 2:743363/1‑141 (MQ=255) cGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCTaa < 1:957285/141‑1 (MQ=255) cGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCTaa > 2:396493/1‑141 (MQ=255) ttAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGNCGTACGAATCATTATCACATGCTGAATGGtgtg < 1:957146/141‑1 (MQ=255) tAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCTAAATGGTGTGa < 1:895061/141‑1 (MQ=255) aaTGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCTAAATGGTGTGACa > 2:670730/1‑141 (MQ=255) aaTGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCTAAATGGTGTGACa > 2:637704/1‑141 (MQ=255) atgatgGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCTAAATGGTGTGACaa < 2:297341/141‑1 (MQ=255) atgatgGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCTAAATGGTGTGACaa < 2:480537/141‑1 (MQ=255) atgatgGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCTAAATGGTGTGACaa < 2:693912/141‑1 (MQ=255) atgatgGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCTAAATGGTGTGACaa < 1:617697/141‑1 (MQ=255) ggcggcATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCTAAATGGTGTGACAatcatc < 1:1071090/141‑1 (MQ=255) gcATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCTAAATGGTGTGACAATCATCGATc < 2:108584/141‑1 (MQ=255) cATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCTAAATGGTGTGACAATCATCGATcc < 1:67220/141‑1 (MQ=255) cATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCTAAATGGTGTGACAATCATCGATcc < 2:850957/141‑1 (MQ=255) aTCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCTAAATGGTGTGACAATCATCGATCCt > 1:672048/1‑141 (MQ=255) tCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACTTGCGAAATGGTGTGACAATCATCGATCCTg < 2:218625/141‑1 (MQ=255) tCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCTAAATGGTGTGACAATCATCGATCCTg < 2:323765/141‑1 (MQ=255) gTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCTAAATGGTGTGACAATCATCGATCCTGAc < 2:393851/141‑1 (MQ=255) aaGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCTAAATGGTGTGACAATCATCGATCCTGACAGCa < 2:45380/141‑1 (MQ=255) aaGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCTAAATGGTGTGACAATCATCGATCCTGACAGCa < 2:1027199/141‑1 (MQ=255) aGTCTATNGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCTAAATGGTGTGACAATCATCGATCCTGACAGCAc < 2:812368/141‑1 (MQ=255) ttCTATCGTACCAATGATGTCGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCTAAATGGTGTGACAATCATCGATCCTGACAGCACt < 2:875294/140‑1 (MQ=255) gTCTATCGTACCAATGATGTAGAAGAAATCATGCGTGTACATGATCGTGTACTGCTTAATGCGGCTCAGACGGCGTTGCAACGGCGTACGAACCATTATCACATGCTAAATGGTGTGACAATCATCGATCCTGACAGCACt < 1:647572/141‑1 (MQ=255) | TAGTTCAGGTATTTTTGCGTTTAATAATAAAACGTTGTTTGAAAAATTAACACAAGTGAAAAATGATAATGCGCAAGGTGAATATTACCTCCCTGATGTATTGTCGTTAATTTTAAATGATGGCGGCATCGTAGAAGTCTATCGTACCAATGATGTTGAAGAAATCATGGGTGTAAATGATCGTGTAATGCTTAGTCAGGCTGAGAAGGCGATGCAACGTCGTACGAATCATTATCACATGCTAAATGGTGTGACAATCATCGATCCTGACAGCACT > CP000730/534043‑534319 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |