| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 612,852 | A→T | 5.3% | A388A (GCA→GCT) | sdrC → | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein‑binding protein SdrC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 612,852 | 0 | A | T | 5.3% | 360.4 / 9.5 | 113 | A388A (GCA→GCT) | sdrC | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein‑binding protein SdrC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (52/55); new base T (3/3); total (55/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CTTATTTCAAGTACAAACTATATTAACAATGAAGATTTATCGCGTAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGTTATTTATAGTAATGATAATAAAACAGCTACAGTCGAT > CP000730/612715‑612990 | cTTATTTCAAGTACAAACTATATTAACAATGAAGATTTATCGCGTAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCaaaa > 2:278486/1‑141 (MQ=255) tttCAAGTACAAACTATATTAACAATGAAGATTTATCGCGTAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACt > 2:1052268/1‑141 (MQ=255) tttCAAGTACAAACTATATTAACAATGAAGATTTATCGCGTAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACt > 2:351901/1‑141 (MQ=255) ttCAAGTACAAACTATATTAACAATGAAGATTTATCGCGTAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACtt < 1:114195/141‑1 (MQ=255) ttCAAGTACAAACTATATTAACAATGAAGAAATATCACATAAGATTACAGCATATGTAAAGCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGGTAGTTACTACTTTAACTGGATATAAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAACtt < 2:429299/141‑1 (MQ=255) aaGTACAAACTATATTAACAATGAAGATTTATCGCGTAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCaa > 1:21236/1‑141 (MQ=255) aaGTACAAACTATATTAACAATGAAGATTTATCGCGTAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCaa > 1:700388/1‑141 (MQ=255) aGTACAAACTATATTAACAATGAAGATTTATCGCGTAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCaaa < 1:105768/141‑1 (MQ=255) aCAAACTATATTAACAATGAAGATTTATCGCGTAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAAtt > 1:1011038/1‑141 (MQ=255) cAAATTATATTAATAATGAAGATTTGTCACGTAATATGACTGTTTATGTAAATCAACCTAAAAAGACCTATACAAAAGAAACATTTGTAACAAATTTAACTGGCTATAAATTTAATCCAGATGCTAAAAACTTCAAAAttt < 1:783420/141‑1 (MQ=255) cAAACTATATTAACAATGAAGATTTATCGCGTAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAAttt > 1:45503/1‑141 (MQ=255) aCTATATTAACAATGAAGATTTATCGCGTAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACg > 2:234958/1‑141 (MQ=255) cTATATTAACAATGAAGATTTATCGCGTAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTCCTAATTTAACTGAATATAGATTTAAACCAAATGCAAAAAACAACAAAACTTACGa > 1:31010/1‑141 (MQ=255) cTATAATAACAATGAAGATTTATCGCGTAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAACTTCAAAATTTACGa < 2:501763/141‑1 (MQ=255) cTATAATAAAAATGAAGAATTATCGCGTAATATGACTGCATATGAAAAACAAAAAAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGAAAAAAACTTCAAAATTTACGa < 2:763707/141‑1 (MQ=255) tatTAACAATGAAGATTTATCGCGTAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGt > 2:927517/1‑141 (MQ=255) tatTAACAATGAAGATTTATCGCGTAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGt > 2:366404/1‑141 (MQ=255) aaaaCAATGAAAAAATATCGCGAAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGa < 2:274278/139‑1 (MQ=255) tAACAATGAAGATTTATCGCGTAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGAc < 2:369449/141‑1 (MQ=255) cAATGAAGATTTATCGCGTAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGa > 2:664183/1‑141 (MQ=255) cAATGAAGATTTATCGCGTAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGa < 1:944333/141‑1 (MQ=255) aTGAAGATTTATCGCGTAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAAACAAAATGAAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATc < 2:952132/141‑1 (MQ=255) aGATTTGTCACGTAATATGACTGTTTATGTAAATCAACCTAAAAAGACCTATACAAAAGAAACATTTGTAACAAATTTAACTGGTTATAAATTTAATCCAGATGCTAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCaaaa > 1:743256/1‑141 (MQ=255) aGATTTATCGCGTAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCaaaa < 2:696642/141‑1 (MQ=255) aGATTTATCGCGTAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCaaaa > 1:1028784/1‑141 (MQ=255) aGATTTATCGCGTAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGGTACTAATTTGTCTCGGTATAAATTTAAGCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCaaaa > 1:1028716/1‑141 (MQ=255) aaTATGACCGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAAGTTCAAACTTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGAt < 1:934928/141‑1 (MQ=255) tatGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAg < 2:433541/141‑1 (MQ=255) atGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGt > 2:855057/1‑141 (MQ=255) tGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGtt < 1:541130/141‑1 (MQ=255) gACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGttt > 1:581662/1‑141 (MQ=255) actgtttatGTAAATCAACCTAAAAAGACCTATACAAAAGAAACATTTGTAACAAATTTAACTGGTTATAAATTTAATCCAGATGCTAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTc > 1:944625/7‑141 (MQ=255) cTGCATATGTAAATAAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCa > 2:337251/1‑141 (MQ=255) tGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCAc > 1:516719/1‑141 (MQ=255) atatGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCAcccc > 1:269202/1‑141 (MQ=255) atatGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCAcccc < 1:866949/141‑1 (MQ=255) tatGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCt > 1:250893/1‑141 (MQ=255) atGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTg < 1:748111/141‑1 (MQ=255) gTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGAt < 2:460391/141‑1 (MQ=255) gTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGAt < 2:127125/141‑1 (MQ=255) tAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATa > 2:1020593/1‑141 (MQ=255) aaaTCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATAc > 2:559696/1‑141 (MQ=255) aTCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACtt < 2:590048/141‑1 (MQ=255) aaCCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCaa < 2:110304/141‑1 (MQ=255) aCCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCaaaa < 2:925438/105‑1 (MQ=255) aCCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCaaaa > 1:925438/1‑105 (MQ=255) aCCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCaaa > 2:219353/1‑141 (MQ=255) ccTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCaaaa < 2:68725/141‑1 (MQ=255) cTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCACTTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCaaaaa > 1:1004813/1‑140 (MQ=255) tAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACt < 1:779723/141‑1 (MQ=255) aaaaTACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTa < 1:260538/141‑1 (MQ=255) aaaTACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTaa < 1:960784/141‑1 (MQ=255) tACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGa < 1:309141/141‑1 (MQ=255) cATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATg > 2:348827/1‑141 (MQ=255) cATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATg > 1:1046515/1‑141 (MQ=255) atatACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGt < 1:273424/141‑1 (MQ=255) tataCTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGtt > 2:733708/1‑141 (MQ=255) taCTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTAc < 1:840217/141‑1 (MQ=255) aCTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACt < 2:433260/141‑1 (MQ=255) cTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATACAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTg < 2:62659/141‑1 (MQ=255) tAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGa < 2:165000/141‑1 (MQ=255) tAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGa < 2:771554/141‑1 (MQ=255) acaaacGTTTGTTACTAATTTCCCCGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCa > 1:354714/1‑141 (MQ=255) acaaacGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCa > 1:593046/1‑141 (MQ=255) aaacGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAAt > 1:151135/1‑141 (MQ=255) aaacGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAAt > 2:170255/1‑141 (MQ=255) cGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCg > 1:693867/1‑141 (MQ=255) cGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCg > 2:54064/1‑141 (MQ=255) gTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGa < 2:458927/141‑1 (MQ=255) tttGTTACTAATTTAANTGGATATAAATTNAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGAt > 1:677470/1‑141 (MQ=255) tttGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGAt > 1:907578/1‑141 (MQ=255) ttGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATg < 1:1067100/141‑1 (MQ=255) ttGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATg < 2:274694/141‑1 (MQ=255) ttGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATg > 2:169164/1‑141 (MQ=255) tGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGt < 1:867101/141‑1 (MQ=255) gTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGtt > 2:172508/1‑141 (MQ=255) tACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGttat < 1:987304/141‑1 (MQ=255) cTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGttattt > 1:958152/1‑141 (MQ=255) cTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGTTATTTATAGTAATg < 1:737507/141‑1 (MQ=255) tggttataAATTTAATCCAGATGCTAAAAACGTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCAGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGGTCAATTCGATGTTATTTATAGTAATGa < 2:449428/137‑1 (MQ=255) ggATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGTTATTTATAGTAATGat < 1:1051916/141‑1 (MQ=255) ggATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGTTATTTATAGTAATGat > 2:190656/1‑141 (MQ=255) gATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGTTATTTATAGTAATGata > 2:544149/1‑141 (MQ=255) gATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGTTATTTATAGTAATGata > 1:942864/1‑141 (MQ=255) atatAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGTTATTTATAGTAATGataa < 1:899346/141‑1 (MQ=255) tataAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGTTATTTATAGTAATGataat < 2:743875/141‑1 (MQ=255) aTTTAATCCAGATGCTAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCAGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGGTCAATTCGATGTTATTTATAGTAATGATAATAAGAc > 2:23615/1‑141 (MQ=255) tAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGTTATTTATAGTAATGATAATAAAACAGc < 2:803232/141‑1 (MQ=255) aaTCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGTTATTTATAGTAATGATAATAAAACAGCt < 1:61502/141‑1 (MQ=255) aaccAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGTTATTTATAGTAATGATAATAAAACAGCTa < 2:1066390/139‑1 (MQ=255) aTCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGTTATTTATAGTAATGATAATAAAACAGCTa > 1:478790/1‑141 (MQ=255) tCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGTTATTTATAGTAATGATAATAAAACAGCTAc < 1:366404/141‑1 (MQ=255) cAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGTTATTTATAGTAATGATAATAAAACAGCTACAg < 2:358730/141‑1 (MQ=255) cAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGTTATTTATAGTAATGATAATAAAACAGCTACAg < 2:321278/141‑1 (MQ=255) agaTGCTAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCAGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGGTCAATTCGATGTTATTTATAGTAATGATAATAAGACGGCGACAGt < 2:944625/139‑1 (MQ=255) aaaTGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGTTATTTATAGTAATGATAATAAAACAGCTACAGt < 1:625513/141‑1 (MQ=255) gCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGTTATTTATAGTAATGATAATAAAACAGCTACAGTCGAt > 2:887130/1‑141 (MQ=255) gCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGTTATTTATAGTAATGATAATAAAACAGCTACAGTCGAt < 2:907578/141‑1 (MQ=255) gCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGTTATTTATAGTAATGATAATAAAACAGCTACAGTCGAt < 1:639812/141‑1 (MQ=255) gCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGTTATTTATAGTAATGATAATAAAACAGCTACAGTCGAt < 2:479158/141‑1 (MQ=255) | CTTATTTCAAGTACAAACTATATTAACAATGAAGATTTATCGCGTAATATGACTGCATATGTAAATCAACCTAAAAATACATATACTAAACAAACGTTTGTTACTAATTTAACTGGATATAAATTTAATCCAAATGCAAAAAACTTCAAAATTTACGAAGTGACAGATCAAAATCAATTTGTGGATAGTTTCACCCCTGATACTTCAAAACTTAAAGATGTTACTGATCAATTCGATGTTATTTATAGTAATGATAATAAAACAGCTACAGTCGAT > CP000730/612715‑612990 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |