| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 614,094 | T→C | 13.9% | S802S (AGT→AGC) | sdrC → | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein‑binding protein SdrC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 614,094 | 0 | T | C | 13.9% | 203.2 / 4.1 | 97 | S802S (AGT→AGC) | sdrC | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein‑binding protein SdrC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (43/34); new base C (13/2); total (59/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.04e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGA > CP000730/613955‑614234 | cagattcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTg < 1:230684/141‑1 (MQ=255) agattcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTga < 2:1068299/141‑1 (MQ=255) ttcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGAgattc > 2:81181/1‑141 (MQ=255) ttcagaCACCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTgattc < 2:69052/141‑1 (MQ=255) tcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTgattca > 1:245543/1‑141 (MQ=255) cagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTgattcag > 1:206548/1‑141 (MQ=255) cagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGACAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGAgattcag > 2:934838/1‑141 (MQ=255) gaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTgattcagat > 1:21833/1‑141 (MQ=255) gCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGattcagnttcag > 1:305175/1‑141 (MQ=255) gCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGattcagattcag > 2:520536/1‑141 (MQ=14) cGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGAttcagattcaga < 1:594627/141‑1 (MQ=255) ctcagactcagaCAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTc > 1:357593/1‑141 (MQ=255) tcagactcagacAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCa > 1:524774/1‑141 (MQ=255) agactcagacAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGa < 1:533264/141‑1 (MQ=255) agactcagacAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTCATTCAGCTTCAGACTCAGa < 2:222884/141‑1 (MQ=255) agactcagacAGCGATCCAGGGTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGa < 1:826237/141‑1 (MQ=255) gactcagacAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGAt < 1:199903/141‑1 (MQ=255) gactcagacAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGATTCAGATTCAGACTCAGAt > 2:937328/1‑141 (MQ=255) gactcagacAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGATTCAGATTCAGACACAGAt > 2:685980/1‑141 (MQ=255) tcagacAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGc < 1:192038/141‑1 (MQ=255) agacAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGa < 1:743802/141‑1 (MQ=255) agacAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGAGATTCAGATTCAGAcagagaatgcga > 2:768007/1‑130 (MQ=255) gacAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGAc < 1:405584/141‑1 (MQ=255) gacAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGCGATTCAGATTCAGACACAGATACCGAc > 2:96932/1‑141 (MQ=255) gacAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGAc < 2:592486/141‑1 (MQ=255) gCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAg < 1:862036/141‑1 (MQ=255) cGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATCGCGCTTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACGCAGCTAGCGACTCAGa > 1:980228/1‑141 (MQ=255) cGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGa < 2:995693/141‑1 (MQ=255) gACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGAc > 1:65276/1‑141 (MQ=255) cTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAg < 1:927234/141‑1 (MQ=255) cTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAg > 1:640141/1‑141 (MQ=255) ggATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGa < 1:189155/141‑1 (MQ=255) aTAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGAtt > 1:938130/1‑141 (MQ=255) tAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATtc < 1:840229/141‑1 (MQ=255) caGCCACCCAGACTCAGACAGCGACGCAGATTCGGATCGCGACTCACGCTCAGCTGGCGATTCAGATGCAGATAGCGATTCGGACTCAGACTGCGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATtc < 2:328636/140‑1 (MQ=18) aGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATtca > 1:443138/1‑141 (MQ=255) aGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATtca > 1:411571/1‑141 (MQ=255) gCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATtcag < 1:250850/141‑1 (MQ=255) gactcagactcaGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATtcagac > 1:960552/1‑141 (MQ=255) ctcagactcagaTAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTTAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATtcagactc < 2:573728/141‑1 (MQ=255) ctcagactcagaTAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCCGACCGCGATtcagactc > 2:997457/1‑141 (MQ=255) agactcagaTAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATtcagactcaga < 1:489958/141‑1 (MQ=255) actcagaTAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACa > 1:770033/1‑141 (MQ=255) ctcagaTAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAg < 1:974324/141‑1 (MQ=255) ctcagaTAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAg > 1:557585/1‑141 (MQ=255) agaTAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCga < 2:106052/141‑1 (MQ=255) agaTAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCga < 1:611550/141‑1 (MQ=255) agaTAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGATTCAGATTCAGACACAGATAGCGATTCAGATTCCGACAACGATTCAGCCTCAGACAgaga > 2:514774/1‑141 (MQ=18) agaTAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACACAGACAGAGACTCAGATACCGAAAGCGATTCAGACTCAGACAgaga > 2:514781/1‑141 (MQ=18) gACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGATTCAGATTCAGACACAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCgactcagac > 2:1046156/1‑141 (MQ=255) aCTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATACTGACAGCGATTCAGACACAGACAGCgactcagaca > 2:253723/1‑140 (MQ=255) cAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGactcagactcag < 1:713122/141‑1 (MQ=255) agtttccgacactgactcacactcaGACTCCAAATCAGATTGCGACACCGATTCGGTCACCGATAAAGATTCAGATTCAGACTCAGATAGAGACTCAGATTCTGATAGCGATTCAGACTCAGACAGCGActcagactcaga < 2:87237/128‑1 (MQ=9) gATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACtcagactcagac > 1:534390/1‑141 (MQ=255) aatgcGGACACCGACTCACACGCAGAGAGAGATTCAGATTCAGATTGCGATTCGGACTCAGACTGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACtcagactcagac < 2:915107/137‑1 (MQ=21) aTTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTGAGACTCAGATACCGACAGAGATTCAGACTCAGACACAGACTCAGACTCAGACa > 2:828765/1‑141 (MQ=17) ttCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGATTCAGATTCAGACTGAGATAGAGATTCAGATTCAGACAGCGATACAGACTCAGAAAGCGAGTCAGAGCCAGAAAg > 2:281763/1‑141 (MQ=18) tCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACGCGGGGTCAGATAGCGACTCGGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACTCAGATACCGACTCAGATCCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACCCAGACTCAGACAGt > 2:323039/1‑141 (MQ=21) cGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAgcg > 1:176973/1‑139 (MQ=255) cGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTg < 1:737040/141‑1 (MQ=255) cGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACACAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTg > 1:458608/1‑141 (MQ=255) cGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCGGACTCAGACAGCGATTCAGATTCAGACACCGACACAGATTCAGATACTGATTCCGATTCAGACTCAGACACCGACACAGACacagacagcg > 2:66206/1‑139 (MQ=11) ggATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCCGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGActcagattcagagcgcga > 2:273426/1‑135 (MQ=18) ggATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGATTCAGATTCAGACTCAGATAGAGACTCAGATACAGATAGCGACTCAGACTCAGAGAGAGAGTCAGATACAgagagaga > 2:520922/1‑141 (MQ=17) tAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTgattc > 1:208480/1‑141 (MQ=255) cGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACCCACACAGTgattcaga > 1:875736/1‑141 (MQ=255) gactcagactcaGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCGGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTgattcagat < 2:494147/141‑1 (MQ=255) gactcagactcaGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTgattcagat < 1:643700/141‑1 (MQ=255) ctcagactcagaTAGCGATTCAGATTCAGATTGCGATTCGGACTCAGACAGAGACTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTgattcagattc < 2:226333/141‑1 (MQ=255) tcagactcagaTAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGATTCAGATTCAGACTCAGATACCGACTCAGATTGTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCgattcagataca > 2:387971/1‑141 (MQ=18) cagaTAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGAGATTCAGATTCTGACACCGATTCAGCCTCAGACTGCGAGTCAGACTCAGAACCCCATTCAGATACAGACaatg > 2:1045925/1‑138 (MQ=18) agaTAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACCCAGACAGCGACTCAGACACAGACAGTGATTCAGATGCAGACACCGa > 2:1046664/1‑141 (MQ=255) aTACCGATTCAGATAAAGATTCCGATTCCGACAAAGACTCTGATTCAGATGCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACt < 2:818825/141‑1 (MQ=17) gattcagattcaGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACtcagat > 1:404393/1‑141 (MQ=255) gattcagattcaGATAGAGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGCCTCAGATTCTGACAGCGATTCCGACTCAGACAGCGACTCTGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACtcagat < 1:648012/141‑1 (MQ=255) ttcagattcagaTAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACACAGACAGAGATTCAGATTCAGACAGCGACtcagattc > 2:479693/1‑141 (MQ=255) cagattcagatAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACtcagattcag > 2:468839/1‑141 (MQ=255) cgattcagatAGCGATTCGGACTGAGCCGGCGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACtcagattcaga < 1:1048816/140‑1 (MQ=255) agattcagatAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACtcagattcaga < 1:549146/141‑1 (MQ=255) cagatAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcg > 2:608047/1‑141 (MQ=255) agatAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcga > 1:838028/1‑141 (MQ=255) gatAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgac > 2:963320/1‑141 (MQ=255) gatAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgac > 1:509480/1‑141 (MQ=255) ataacGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgact > 2:391771/5‑141 (MQ=255) gCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcag > 2:471893/1‑141 (MQ=255) gCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATGCAGACTCAGACAGCGACTCAGGCTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcag > 1:919447/1‑141 (MQ=255) cGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGAGTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcaga > 2:602504/1‑141 (MQ=255) gATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagac > 2:804464/1‑141 (MQ=255) gATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagac > 2:364597/1‑141 (MQ=255) tCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactca > 2:468511/1‑141 (MQ=255) cGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcag > 1:143754/1‑141 (MQ=255) gACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagat > 1:315195/1‑141 (MQ=255) cTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagatag > 1:153754/1‑141 (MQ=255) tCAGACTCTGATTAAGACTCAGACTCAGATAGAGACTCAGACTCTGACGGAGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCTGACAGTGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagatagc < 2:97803/141‑1 (MQ=14) tCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACTGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACGCAGACAGTGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagatagc < 2:960552/141‑1 (MQ=255) gACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagatagcgac < 1:326607/141‑1 (MQ=255) gTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCCGATACTAACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagatagcgactcag > 1:29901/1‑141 (MQ=255) tGATTCAGATTCCGACTCAGATACCGACTCCGACTCAGACAGCGATTCCGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagatagcgactcaga < 2:765087/141‑1 (MQ=14) | CAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGA > CP000730/613955‑614234 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |