Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA CP000730 628,481 C→A 5.3% intergenic (‑154/‑116) USA300HOU_0562 ← / → nagB hypothetical protein/glucosamine‑6‑phosphate deaminase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*CP000730628,4810CA 5.3% 409.6 / 2.0 126intergenic (‑154/‑116)USA300HOU_0562/nagBhypothetical protein/glucosamine‑6‑phosphate deaminase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (63/55);  new base A (2/6);  total (65/61)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.55e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 127 total aligned reads displayed.

ATGTGTTTATCTTTCTATTTTACTAAAAACTATTCGATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGA  >  CP000730/628342‑628621
                                                                                                                                           |                                                                                                                                             
aTGTGTTTATCTTTCTATTTTACTAAAAACTATTCGATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCa                                                                                                                                              <  1:853794/141‑1 (MQ=255)
aTGTGTTTATCTTTCTATTTTACTAAAAACTATTCGATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCa                                                                                                                                              >  2:505730/1‑141 (MQ=255)
aTGTGTTTATCTTTCTATTTTACTAAAAACTATTCGATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCa                                                                                                                                              <  1:976744/141‑1 (MQ=255)
    gtTTATCTTTCTATTTTACTAAAAACTATTCGATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCaaaaa                                                                                                                                          >  1:162433/1‑141 (MQ=255)
     tttATCTTTCTATTTTACTAAAAACTATTCGATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAAt                                                                                                                                         <  1:384282/141‑1 (MQ=255)
       tATCTTTCTATTTTACTAAAAACTATTCGATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTAAAAAAATCAAAAAttt                                                                                                                                       <  2:238143/141‑1 (MQ=255)
         tCTTTCTATTTTACTAAAAACTATTCGATAAATGTATACGATTGCTGAATTATTTATAAATTAATTGTCATGGAGGGTAATTACGCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACAAAAAAAAAAAAAAAATttgt                                                                                                                                     <  2:386019/141‑1 (MQ=255)
            ttCTATTTTACTAAAAACTATTCGATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTgg                                                                                                                                  <  1:825757/141‑1 (MQ=255)
            ttCTATTTTACTAAAAACTATTCGATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTgg                                                                                                                                  <  2:84430/141‑1 (MQ=255)
              cTATTTTACTAAAAACTATTCGATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGaa                                                                                                                                <  1:518348/141‑1 (MQ=255)
              cTATTTTACTAAAAACTATTCGATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGaa                                                                                                                                >  2:953064/1‑141 (MQ=255)
              cTATTTTACTAAAAACTATTCGATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGaa                                                                                                                                >  1:1036208/1‑141 (MQ=255)
                aTTTTACTAAAAACTATTCGATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAAtt                                                                                                                              <  1:499793/141‑1 (MQ=255)
                aTTTTACTAAAAACTATTCGATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAAtt                                                                                                                              <  1:552772/141‑1 (MQ=255)
                aTTTTACTAAAAAATATTCGATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAAGTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTGTTGGAAtt                                                                                                                              <  2:255106/141‑1 (MQ=255)
                    tACTAAAAACTATTCGATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGaa                                                                                                                          >  1:1061971/1‑141 (MQ=255)
                     aCTAAAAACTATTCGATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGaaa                                                                                                                         <  1:607512/141‑1 (MQ=255)
                              tATTCTATAATTGTATACGATTGCTAAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGATAATTACACAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAgtaaaaaa                                                                                                                <  2:32595/141‑7 (MQ=255)
                               aTTCGATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAAc                                                                                                               >  2:857229/1‑141 (MQ=255)
                                ttCGATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACa                                                                                                              >  1:293262/1‑141 (MQ=255)
                                ttCGATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACa                                                                                                              >  1:939336/1‑141 (MQ=255)
                                ttCGATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATAAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACa                                                                                                              >  1:67748/1‑141 (MQ=255)
                                  cGATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACAtt                                                                                                            >  2:1039886/1‑141 (MQ=255)
                                   gATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTa                                                                                                          >  2:609516/1‑141 (MQ=255)
                                   gATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTa                                                                                                          >  2:383196/1‑141 (MQ=255)
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                                            ataCGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAatgatg                                                                                                 >  1:267992/1‑141 (MQ=255)
                                                 aTTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCtata                                                                                            >  2:621746/1‑141 (MQ=255)
                                                  ttGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTatat                                                                                           <  1:891063/141‑1 (MQ=255)
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                                                       cAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATg                                                                                      <  1:496803/141‑1 (MQ=255)
                                                        aaTTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATgg                                                                                     <  2:298603/141‑1 (MQ=255)
                                                        aaTTATTTATAAATTAAGTGTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTAAAAAAAAAAAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATgg                                                                                     <  2:735099/141‑1 (MQ=255)
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                                                         attattTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGgt                                                                                    >  2:2592/1‑141 (MQ=255)
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                                                                  aaaTTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTatgaatg                                                                           <  1:1012027/141‑1 (MQ=255)
                                                                   aattaattTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAAGTTGGTGGAATTTTAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTatgaatga                                                                          >  1:758160/1‑141 (MQ=255)
                                                                   aattaataTTCATGAAAGGTAATTACTCAAGAATAAGTAATCATACAGCATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTatgaatga                                                                          <  2:680967/141‑1 (MQ=255)
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                                                                                  aGGGTAATTACTCAGTATTACGTAATGATACAGCATTAGTTTTTTACATTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTGTATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTa                                                           <  2:857425/141‑1 (MQ=255)
                                                                                       aaTTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATg                                                      >  2:497081/1‑141 (MQ=255)
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                                                                                             tCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTaa                                                >  1:356143/1‑141 (MQ=255)
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                                                                                                    tACTTAATCATACAGCAGTATTTTTTGACTTGTAAAAAGCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATGCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTtgtg                                         <  2:78231/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                     aCGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAAAAATAAGTTGGAATTTGATAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGCTGTATGAATGAATTCATAAGATTTTAAAATGTATTAAAttttttt                                        >  2:218357/1‑137 (MQ=255)
                                                                                                     aCGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTgg                                        >  2:925543/1‑141 (MQ=255)
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                                                                                                      cGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGa                                       >  1:183762/1‑141 (MQ=255)
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                                                                                                        tAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAgg                                     >  2:14870/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                          aTCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCa                                   >  1:429520/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                          aTCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCa                                   <  1:967626/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                          aTCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCa                                   <  1:989076/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                           tCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCCTAAGTTTTTCAAATGTATGGAATGTGTGGAGGCAt                                  >  1:584938/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                           tCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCAt                                  >  1:256448/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                           tCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCAt                                  <  2:799786/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                            cATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATg                                 <  1:64770/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                             aTACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGt                                >  2:676006/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                               aCAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTaa                              >  2:222058/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                cAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATATGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTATTTAAACTGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTaaa                             >  2:157590/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                    aTTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAAt                         <  1:972704/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                     ttAGTTTNTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGTAGGCATGTAAACAATg                        <  2:816416/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                       aGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGaa                      >  1:690007/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                       aGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGaa                      >  2:189075/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                         ttttttAATTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGTAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAg                    <  2:30308/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                           ttttACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTa                  <  1:1022547/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                           ttttACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATCCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTa                  <  1:550523/141‑1 (MQ=255)
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                                                                                                                            tttACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTAt                 >  1:1046188/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                            tttACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTAt                 >  2:794680/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                              tACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTa               >  2:147927/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                               aCTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTaa              <  1:770016/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                               aCTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTaa              <  1:606042/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                cTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAACCTATGAAAGTATTaaa             <  2:1046405/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                cTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTaaa             <  2:878096/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                cTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTaaa             <  2:83664/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                  tttAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACt           >  2:7645/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                                     aaaaaTCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAg        >  2:1003081/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                                     aaaaaTCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAg        <  2:855511/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                       aaaTCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGa      <  2:758160/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                         aTCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATc    >  1:838869/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                                          tCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCg   >  2:311058/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                                          tCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCg   >  1:736316/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                                          tCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCg   <  1:859273/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                          tCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCg   >  1:385424/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                                          tCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGa  >  1:201984/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                                          acAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCg   <  2:803652/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                           |                                                                                                                                             
ATGTGTTTATCTTTCTATTTTACTAAAAACTATTCGATAATTGTATACGATTGCTCAATTATTTATAAATTAATTTTCATGAAGGGTAATTACTCAGGATTACGTAATCATACAGCATTAGTTTTTTACTTTTAAAAATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGA  >  CP000730/628342‑628621

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: