| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 770,883 | T→C | 5.7% | intergenic (+69/‑184) | ebsC → / → fruR | possible transcriptional regulator/DeoR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 770,883 | 0 | T | C | 5.7% | 287.2 / 4.9 | 100 | intergenic (+69/‑184) | ebsC/fruR | possible transcriptional regulator/DeoR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (51/43); new base C (2/4); total (53/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.16e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
AAATCACAATAGCTGTTGAGGATTTGATTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGATTGTTTTTGGTAATTTATGATTGAAAA > CP000730/770744‑771023 | aaaTCACAATAGCTGTTGAGGATTTGATTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAGGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCAttt > 1:852763/1‑141 (MQ=255) aaTCACAATAGCTGTTGAGGATTTGATTACAATAACAATAGGAATTATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTc > 1:1062621/1‑141 (MQ=255) caATAGCTGTTGAGGATTTGATTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGGCAGAAATGAATTTTATAAAAAT‑‑TTCATCTCTgtca < 1:513468/141‑4 (MQ=37) caATAGCTGTTGAGGATTTGATTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCca < 1:343746/141‑1 (MQ=255) caATAGCTGTTGAGGATTTGATTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCca > 1:940198/1‑141 (MQ=255) caATAGCTGTTGAGGATTTGATTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATCTCTGCca > 2:50117/1‑141 (MQ=255) aaTAGCTGTTGAGGATTTGATTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCcac > 2:565472/1‑141 (MQ=255) aTAGCTGTTGAGGATTTGATTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGGCAGAAATGAATTTTATAAAAAT‑‑TTCATCTCTGTcaca < 1:89941/141‑1 (MQ=25) tAGCTGTTGAGGATTTGATTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGGCAGAAATGAATTTTATAAAAAT‑‑TTCATCTCTGTCacac < 2:747753/141‑1 (MQ=25) tAGCTGTTGAGGATTTGATTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCacac < 1:196588/141‑1 (MQ=255) tAGCTGTTGAGGATTTGATTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATACAAGTAGGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCacac < 1:510434/141‑1 (MQ=255) tAGCTGGTGAGGATTTGATTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGGAGTTATGCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCNGCCacac > 2:811893/1‑141 (MQ=255) aGCTGTTGAGGATTTGATTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACt > 2:312241/1‑141 (MQ=255) aGCTGTTGAGGATTTGATTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACt > 1:347299/1‑141 (MQ=255) aGCTGTTGAGGATTTGATTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACt < 2:945713/141‑1 (MQ=255) gCTGTTGAGGATTTGATTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTc > 1:1012512/1‑141 (MQ=255) tGAGGATTTGATTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCtttt < 2:320156/141‑1 (MQ=255) tGAGGATTTGATTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCtttt < 1:421627/141‑1 (MQ=255) aGGATTTGATTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTttg < 1:712721/141‑1 (MQ=255) ggATTTGATTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTttga < 1:106296/141‑1 (MQ=255) gATTTGATTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGCGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTttgat < 2:304992/141‑1 (MQ=255) tGATTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGaa > 1:668122/1‑141 (MQ=255) aTTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAAtt > 1:598011/1‑141 (MQ=255) aTTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAAtt < 2:253752/141‑1 (MQ=255) aCAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGc < 2:656335/141‑1 (MQ=255) aCAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGc > 2:623384/1‑141 (MQ=255) aCAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGc > 1:55545/1‑141 (MQ=255) aCTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTa > 2:82466/1‑141 (MQ=255) cTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTAc > 2:295342/1‑141 (MQ=255) tAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACg > 1:1074941/1‑141 (MQ=255) aaGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGAt < 2:794501/141‑1 (MQ=255) aaGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGAt > 2:1042360/1‑141 (MQ=255) ggCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCa > 2:361457/1‑141 (MQ=255) ttGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAg > 2:799818/1‑141 (MQ=255) gtaGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTc < 1:596126/139‑1 (MQ=255) gCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCAtt > 2:95295/1‑141 (MQ=255) gCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCAtt > 2:550963/1‑141 (MQ=255) gCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCAtt > 1:878744/1‑141 (MQ=255) gTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATtata < 2:229356/141‑1 (MQ=255) tATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAAt < 2:500683/141‑1 (MQ=255) ctatgaatgaTTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTTTTTTTTTTTTCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTgt > 2:1029093/3‑140 (MQ=255) ccATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGa < 2:469242/141‑1 (MQ=255) aatgaTTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTAtt > 1:375621/1‑141 (MQ=255) tgaTTAATAACAACAAAGAGTATGGGGCGAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTg < 1:698575/141‑1 (MQ=255) tgaTTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTg > 1:408867/1‑141 (MQ=255) aTTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGaa > 1:1063425/1‑141 (MQ=255) ttAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAAc < 2:841748/141‑1 (MQ=255) taataaCAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTTATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACa > 1:884997/1‑141 (MQ=255) ataaCAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATa > 1:914219/1‑141 (MQ=255) aacaacAAAAAGTATGGGACAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATaaa < 2:806168/141‑1 (MQ=255) aacaaAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATaaaaag < 1:1031100/141‑2 (MQ=255) aacaaAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAAt > 1:90338/1‑141 (MQ=255) caaAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGt < 1:1042360/141‑1 (MQ=255) aaaaGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTaa > 1:481824/1‑141 (MQ=255) gTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAAtttt > 1:488047/1‑141 (MQ=255) gTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAAtttt > 1:983944/1‑141 (MQ=255) gTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAAtttt > 2:171733/1‑141 (MQ=255) tATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCCCACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGCGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTa > 1:641523/1‑141 (MQ=255) tATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTa > 2:465880/1‑141 (MQ=255) tATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTa > 2:398458/1‑141 (MQ=255) tATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTa > 2:398380/1‑141 (MQ=255) tGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTAtt > 1:584683/1‑140 (MQ=255) ttcaatcaaaaaGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCg > 1:118067/12‑141 (MQ=255) ggggCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCGTTTTTTTTTTTTTTGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATct > 2:1023401/1‑140 (MQ=255) gggCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGt > 2:800086/1‑141 (MQ=255) cAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTcac < 2:410165/141‑1 (MQ=255) aGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACaa > 2:650550/1‑141 (MQ=255) aGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACaa > 2:649693/1‑141 (MQ=255) ttAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAAttt < 1:1080548/141‑1 (MQ=255) aGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTATTTTAAGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAACAATGTACTATTAACGTTTCAATTTGa > 2:490981/1‑141 (MQ=255) aGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGa < 2:803734/141‑1 (MQ=255) aGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGa > 1:303094/1‑141 (MQ=255) aGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGa > 1:598211/1‑141 (MQ=255) gAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAgt > 2:1045307/1‑141 (MQ=255) aGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAgtg > 2:309659/1‑141 (MQ=255) tgtgACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAATCTGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGtt < 2:1022349/141‑1 (MQ=255) cAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGTTTTTTTTTTCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGa > 2:480502/1‑141 (MQ=255) agagATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGAt > 1:563154/1‑141 (MQ=255) agagATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGAt < 2:442368/141‑1 (MQ=255) agagATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGAt > 2:165056/1‑141 (MQ=255) gaaatgaattttATAAAAATTTCATCTCTGTCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGAtt > 1:867806/9‑141 (MQ=38) aaTTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGATTGTTTTTg < 1:981408/141‑1 (MQ=255) aaTTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGATTGTTTTTg < 1:491530/141‑1 (MQ=255) tttttATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGATTGTTTTTGGt < 2:347299/141‑1 (MQ=255) tttttATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGATTGTTTTTGGt < 2:944965/141‑1 (MQ=255) ttttATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGATTGTTTTTGGTa < 1:382652/141‑1 (MQ=255) tttATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGATTGTTTTTGGTaa > 1:764489/1‑141 (MQ=255) tttATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGATTGTTTTTGGTaa < 1:224461/141‑1 (MQ=255) tataAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGATTGTTTTTGGTAAtt < 1:584472/141‑1 (MQ=255) ttaAAA‑‑TTAATTTCAGCCATAGTCCTTTTTGTTAGAATTATCATTTTACGATCATTAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGATCATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGATTGTTTTTGGTAAttt < 2:324258/140‑1 (MQ=255) atcaaa‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTGTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGACATTATACTTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGCGTGTTTGTGATTGTTTTTGGTAAttt < 1:83537/138‑1 (MQ=255) taAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGATTGTTTTTGGTAATTTa < 1:979606/141‑1 (MQ=255) tCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGATTGTTTTTGGTAATTTATGATTg < 1:811381/141‑1 (MQ=255) cATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGATTGTTTTTGGTAATTTATGATTGa < 2:68452/141‑1 (MQ=255) cATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGATTGTTTTTGGTAATTTATGATTGa < 1:531810/141‑1 (MQ=255) cATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGATTGTTTTTGGTAATTTATGATTGa < 1:457274/141‑1 (MQ=255) cATCTCTGTCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGATTGTTTTTGGTAATTTATGATTGa < 2:867806/141‑1 (MQ=255) aTTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGATTGTTTTTGGTAATTTATGATTGaa < 2:118067/141‑1 (MQ=255) tttCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGATTGTTTTTGGTAATTTATGATTGaaa > 1:119458/1‑141 (MQ=255) ttCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGATTGTTTTTGGTAATTTATGATTGaaaa < 1:774846/141‑1 (MQ=255) | AAATCACAATAGCTGTTGAGGATTTGATTACAATAACTAAAGGCAAAATTGGAGCAGTTATCCATGAATGATTAATAACAACAAAAAGTATGGGGCAAGATTAGGAGTGTGACAGAGATGAAATTTTTATAAAA‑‑TTCATTTCTGCCACACTCCTTTTTGATTGAATTAGCATTTTACGATCATAAACAGTCATTATAATTGAGTATTTGAACATAAAAATGTAATTTTATCGTCACAATTTGAGTGTTTGTGATTGTTTTTGGTAATTTATGATTGAAAA > CP000730/770744‑771023 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |