| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 946,579 | A→C | 5.4% | F488L (TTT→TTG) | mnhA2 ← | CPA3 family monovalent cation:proton (H+) antiporter‑3 subunit A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 946,579 | 0 | A | C | 5.4% | 302.5 / 8.1 | 93 | F488L (TTT→TTG) | mnhA2 | CPA3 family monovalent cation:proton (H+) antiporter‑3 subunit A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (55/33); new base C (2/3); total (57/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.72e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
ATATAAATCACTAATGTTGATAAAAAGGCAGGCGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAATATATGCATTATAAATTTAATTGAATATACAAATGT > CP000730/946439‑946719 | atatAAATCACTAATGTTGATAAAAAGGCAGGCGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCa < 1:665416/141‑1 (MQ=255) ataAATCACTAATGTTGATAAAAAGGCAGGCGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCaaa > 2:265735/1‑141 (MQ=255) aaaTCACTAATGTTGATAAAAAGGCAGGCGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATa < 1:274525/141‑1 (MQ=255) aaTCACTAATGTTGATAAAAAGGCAGGCGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATAc > 2:508412/1‑141 (MQ=255) aaTCACTAATGTTGATAAAAAGGCAGGCGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATAc > 1:156211/1‑141 (MQ=255) tCACTAATGTTGATAAAAAGGCAGGCGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACaa < 2:50440/141‑1 (MQ=255) tAATGTTGATAAAAAGGCAGGCGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTAc > 1:700248/1‑141 (MQ=255) ttGATAAAAAGGCAGGCGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATg < 1:480984/141‑1 (MQ=255) ttGATAAAAAGGCAGGCGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATg < 1:319702/141‑1 (MQ=255) aaaaaaaaaaGGCAGGCGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATg < 2:1014233/136‑1 (MQ=255) tGATAAAAAGGCAGGCGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGt < 2:689694/141‑1 (MQ=255) gATAAAAAGGCAGGCGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTa > 2:469613/1‑141 (MQ=255) aTAAAAAGGCAGGCGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAg > 1:774663/1‑141 (MQ=255) aaaaaGGCAGGCGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCt < 1:53535/141‑1 (MQ=255) aaaaaGGCAGGCGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCt < 1:857056/141‑1 (MQ=255) aggcaggcGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTaaaa > 1:153000/1‑141 (MQ=255) aggcaggcGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTaaaa < 1:180068/141‑1 (MQ=255) gcaggcGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATa > 1:1031279/1‑141 (MQ=255) gcaggcGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATa > 1:1026396/1‑141 (MQ=255) gcaggcGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATa > 1:776804/1‑141 (MQ=255) aggcGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGc < 1:691257/141‑1 (MQ=255) aggcGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGc > 2:20833/1‑141 (MQ=255) tCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATaa > 1:353289/1‑141 (MQ=255) aTGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAg < 2:106970/141‑1 (MQ=255) gAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCAt < 2:525341/141‑1 (MQ=255) gAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCAt < 1:707460/141‑1 (MQ=255) tatGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAata > 1:653497/1‑141 (MQ=255) atGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAatat > 1:327398/1‑141 (MQ=255) tGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATAtt > 1:63490/1‑141 (MQ=255) ggAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTg > 1:742192/1‑141 (MQ=255) ggAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTg > 1:742187/1‑141 (MQ=255) aCATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCg > 2:285960/1‑141 (MQ=255) aCATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCg > 1:386142/1‑141 (MQ=255) tcatcaATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCgtgt > 2:1083228/1‑141 (MQ=255) tcatcaATTACAGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAACGCATAAATATTGATATTTCgtgt > 2:973303/1‑141 (MQ=255) atcaATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGc > 1:369188/1‑141 (MQ=255) atcaATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGAAATCATATTGATACTTCGTGTGc > 1:9763/1‑141 (MQ=255) aaTTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCCAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCttt > 2:435562/1‑141 (MQ=255) aaTTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCttt > 2:428288/1‑141 (MQ=255) ccGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAg < 2:582756/141‑1 (MQ=255) gTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGt > 2:147530/1‑141 (MQ=255) tATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTa < 2:296276/141‑1 (MQ=255) aTGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTaa > 1:854416/1‑141 (MQ=255) gATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAAtt < 1:572662/141‑1 (MQ=255) gATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAAtt < 1:282955/141‑1 (MQ=255) ttAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAATCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGt < 2:316401/141‑1 (MQ=255) ttAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGt < 2:451028/141‑1 (MQ=255) ttAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGt < 1:952832/141‑1 (MQ=255) tAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGtt < 1:808919/141‑1 (MQ=255) tCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAg > 2:127462/1‑141 (MQ=255) tCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAg > 2:413856/1‑141 (MQ=255) gAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAACCCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGt < 2:827541/141‑1 (MQ=255) aaGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGtt < 2:34753/141‑1 (MQ=255) aaGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGtt < 2:946278/141‑1 (MQ=255) aGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGttt > 1:871225/1‑141 (MQ=255) aGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGttt < 1:56985/141‑1 (MQ=255) gATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTta > 2:932375/1‑141 (MQ=255) gATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTta < 1:138782/141‑1 (MQ=255) aTGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTtat > 2:386312/1‑141 (MQ=255) tAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATGCTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATAtt > 1:800289/1‑141 (MQ=255) tAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATAtt > 2:733473/1‑141 (MQ=255) tAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATAtt > 1:453925/1‑141 (MQ=255) gCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGt < 2:732901/141‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGt > 1:742100/1‑141 (MQ=255) gCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGCGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGt < 1:1007354/141‑1 (MQ=255) tGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTcc > 1:693752/1‑141 (MQ=255) gTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGa < 1:138685/141‑1 (MQ=255) gTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGa > 2:529697/1‑141 (MQ=255) aataatCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGaaaaa > 2:998601/1‑141 (MQ=255) aataatCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGaaaaa > 2:565695/1‑141 (MQ=255) aataatCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGaaaaa > 2:1975/1‑141 (MQ=255) taatCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAata > 1:49638/1‑141 (MQ=255) aatCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAatat > 1:25144/1‑141 (MQ=255) aatCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAatat > 2:429862/1‑141 (MQ=255) atCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAatata > 2:287655/1‑141 (MQ=255) aTTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAATATATGCAt < 1:111825/141‑1 (MQ=255) aTTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAATATATGCAt < 1:199771/141‑1 (MQ=255) aTTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAATATATGCAt > 1:438509/1‑141 (MQ=255) aTTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAATATATGCAt > 1:263654/1‑141 (MQ=255) tAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCCAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAATATATGCATta < 1:498248/141‑1 (MQ=255) aGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCCAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAATATATGCATtat > 2:261490/1‑141 (MQ=255) aGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAATATATGCATtat > 1:196206/1‑141 (MQ=255) gTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAATATATGCATtata < 1:916206/141‑1 (MQ=255) gTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAATATATGCATtata > 2:449328/1‑141 (MQ=255) ttAAAATGCCAGGGAATAAACCCAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAATATATGCATTATaa < 1:45847/141‑1 (MQ=255) ttAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAATATATGCATTATaa > 1:585827/1‑141 (MQ=255) ttAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAATATATGCATTATaa > 1:885237/1‑141 (MQ=255) aaaaTGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAATATATGCATTATAAAt > 2:77791/1‑141 (MQ=255) aaaaTGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAATATATGCATTATAAAt < 1:91874/141‑1 (MQ=255) gggAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAATATATGCATTATAAATTTAATTGaa > 2:162388/1‑141 (MQ=255) tAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAATATATGCATTATAAATTTAATTGAATATAc > 1:498141/1‑141 (MQ=255) aaCCCAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAATATATGCATTATAAATTTAATTGAATATACaa < 1:84151/141‑1 (MQ=255) aCCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAATATATGCATTATAAATTTAATTGAATATACaaa > 1:167751/1‑141 (MQ=255) aCCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAATATATGCATTATAAATTTAATTGAATATACaaa > 2:79594/1‑141 (MQ=255) cAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAATATATGCATTATAAATTTAATTGAATATACAAAtg > 1:445145/1‑141 (MQ=255) aaaTACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAATATATGCATTATAAATTTAATTGAATATACAAAtgt < 2:156211/141‑1 (MQ=255) | ATATAAATCACTAATGTTGATAAAAAGGCAGGCGTTAATCCATGGAACATATGGAATTCAACATCATCAATTACCGTATGATTAATCGAAGATGTAGCTGGTTCAATAATCGAATTAGTTAAAATGCCAGGGAATAAACCAAATACAATTACTAATGTAGCTAAAATAGCTGGTGATAAAAGCATTAATATTGATACTTCGTGTGCTTTTTTAGGTAATTGTTCAGGTTTATATTGTCCGAAAAATATATGCATTATAAATTTAATTGAATATACAAATGT > CP000730/946439‑946719 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |