| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,038,235 | A→T | 5.0% | intergenic (‑4652/‑3054) | USA300HOU_0983 ← / → USA300HOU_0984 | competence protein/glycosyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,038,235 | 0 | A | T | 5.0% | 295.2 / 4.3 | 95 | intergenic (‑4652/‑3054) | USA300HOU_0983/USA300HOU_0984 | competence protein/glycosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (43/46); new base T (2/3); total (46/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AGTGTACTTTGGATATTAAATTACACGGGTAATTTAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGAAAATACTAGTGTTATTAAAGATTTGAATAAAATAAAAGAA > CP000730/1038095‑1038373 | aGTGTACTTTGGATATTAAATTACACGGGTAATTTAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCa > 1:675852/1‑141 (MQ=255) tACTTGGGACATTAATGTACACGGGTAATTTAGATTTATTCATCTTCAGAATAGTTCTGCTTTCCTGTCTTTTCATTTTACCGATTAGGGTTGATAATTTATGGACTTTCTTAATGTTAGTAAATTTAAATGTTGCAAata > 2:694077/1‑141 (MQ=255) cTTTGGATATTAAATTACACGGGTAATTTAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATg < 2:28303/141‑1 (MQ=255) ttGGATATTAAATTACACGGGTAATTTAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGAt > 1:508852/1‑141 (MQ=255) ttGGATATTAAATTACACGGGTAATTTAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGAt < 2:907989/141‑1 (MQ=255) tGGATATTAAATTACACGGGTAATTTAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGAtt < 1:373006/141‑1 (MQ=255) ggATATTAAATTACACGGGTAATTTAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTa > 1:1056387/1‑141 (MQ=255) gATATTAAATTACACGGGTAATTTAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTaa < 2:209749/141‑1 (MQ=255) gATATTAAATTACACGGGTAATTTAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTaa < 2:209743/141‑1 (MQ=255) gATATTAAATTACACGGGTAATTTAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTaa < 2:209998/141‑1 (MQ=255) gATATTAAATTACACGGGTAATTTAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTaa < 2:74430/141‑1 (MQ=255) gATATTAAATTACACGGGTAATTTAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCACGTCTTTTCATTTTAACGATTAGGGTTATTAATTAATAGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTTCAAATATGATTaa > 1:904420/1‑141 (MQ=255) atTAAATTACACGGGTAATTTAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAgg < 1:116047/141‑1 (MQ=255) ttAAATTACACGGGTAATTTAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAA‑TTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTa > 2:744392/1‑141 (MQ=255) aaTTACACGGGTAATTTAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAag < 1:559238/141‑1 (MQ=255) aaTTACACGGGTAATTTAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAag < 1:1070212/141‑1 (MQ=255) aaTTACACGGGTAATTTAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAag < 2:663543/141‑1 (MQ=255) tACACGGGTAATTTAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAagcag < 2:174351/141‑1 (MQ=255) tACACGGGTAATTTAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAagcag < 2:542791/141‑1 (MQ=255) acacGGGTAATTTAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAagcagc < 2:155550/141‑1 (MQ=255) ggTAATTTAGATTTATTCATATTAAGAATAGCTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACttt > 1:223031/1‑141 (MQ=255) gTAATTTAGTTTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTCATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTa < 1:254653/141‑1 (MQ=255) aaTTTAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTaaa > 1:629978/1‑141 (MQ=255) tAGATTTATTCATATTAAGATTAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCTAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACaa < 2:1032087/141‑1 (MQ=255) tAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACaa > 2:92954/1‑141 (MQ=255) tAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACaa < 1:772451/141‑1 (MQ=255) aGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAAt > 2:179029/1‑141 (MQ=255) gATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAAtt > 2:74214/1‑141 (MQ=255) aTTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTc < 2:84528/141‑1 (MQ=255) tATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGtt > 1:1047785/1‑141 (MQ=255) aTTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATCTGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGttt > 1:1039894/1‑141 (MQ=255) tatatTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTttat < 1:896153/140‑1 (MQ=255) atatTAAGATTAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCTAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTttatt < 2:259671/141‑1 (MQ=255) atatTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTttatt > 1:363449/1‑141 (MQ=255) atatTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTttatt > 1:363487/1‑141 (MQ=255) tatTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTttatta < 2:24971/141‑1 (MQ=255) tatTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTttatta > 2:693596/1‑141 (MQ=255) atTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTaa > 1:443339/1‑141 (MQ=255) gAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAg < 1:148864/141‑1 (MQ=255) aGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCTAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTg < 2:111748/141‑1 (MQ=255) aGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTg > 1:1024010/1‑141 (MQ=255) cTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTaaa > 2:869484/1‑141 (MQ=255) gCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAg < 1:131751/141‑1 (MQ=255) cTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGt > 2:1081146/1‑141 (MQ=255) tttCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTa < 1:40186/141‑1 (MQ=255) tCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTAtt < 2:1014881/141‑1 (MQ=255) cATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATtc > 2:438825/1‑141 (MQ=255) cATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTGAATGTTATTAAATTTATATGTTTGTAAGATGATTTAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTGGTGTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATtc > 1:648013/1‑141 (MQ=255) cATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTGATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATtc > 2:108378/1‑141 (MQ=255) tCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCtt < 2:1003827/141‑1 (MQ=255) tCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCtt < 2:1003834/141‑1 (MQ=255) ttttCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATTGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAATACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAg > 2:1008765/1‑141 (MQ=255) ttttCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACCAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATACGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAg > 2:662703/1‑141 (MQ=255) ttttCATTTTAACGATCAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAg > 1:512398/1‑141 (MQ=255) ttCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTa < 2:70839/141‑1 (MQ=255) ttCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTa > 2:425603/1‑141 (MQ=255) cATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACt < 1:587837/141‑1 (MQ=255) tttAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAAt < 1:932969/141‑1 (MQ=255) tAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTATTAg > 2:207882/1‑141 (MQ=255) aaCGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGc < 1:190813/141‑1 (MQ=255) aaCGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGc > 1:104886/1‑141 (MQ=255) aaCGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGc > 1:5767/1‑141 (MQ=255) gATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCtaa < 1:833427/141‑1 (MQ=255) ttattaATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGa < 2:703673/141‑1 (MQ=255) ttattaATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGa < 1:258265/141‑1 (MQ=255) tattaATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATGATCTTAGTATTAATAGCTAATGTAATGAt > 2:458858/1‑141 (MQ=255) attaATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATa > 1:682581/1‑141 (MQ=255) ttaATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAg < 2:559863/141‑1 (MQ=255) ttaATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAg < 1:179029/141‑1 (MQ=255) aTTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGaaa > 1:43300/1‑141 (MQ=255) tttATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCGAATCTGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATATaaaa > 2:1066805/1‑141 (MQ=255) tttATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGaaaa > 2:448671/1‑141 (MQ=255) tATGGACTTTCCTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGAAAATa > 2:627193/1‑141 (MQ=255) aTGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAACTATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTGATGATAGAAAATAc > 1:571763/1‑141 (MQ=255) aTGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGAAAATAc > 2:109187/1‑141 (MQ=255) aCTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGAAAATACTAgt < 1:1057850/141‑1 (MQ=255) cTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACTATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGAAAATACTAGTGttat < 1:429307/141‑1 (MQ=255) cTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGAAAATACTAGTGttat < 2:796937/141‑1 (MQ=255) cTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGAAAATACTAGTGttat < 1:805727/141‑1 (MQ=255) cTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGAAAATACTAGTGttat > 1:772878/1‑141 (MQ=255) aaTGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGAAAATACTAGTGTTATTaa > 2:530829/1‑141 (MQ=255) tGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTCGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGAAAATACTAGTGTTATTAAAg < 2:700296/141‑1 (MQ=255) ttACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGAAAATACTAGTGTTATTAAAGAt < 1:379048/141‑1 (MQ=255) tACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGAAAATACTAGTGTTATTAAAGAtt < 1:70375/141‑1 (MQ=255) aagtttAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGAAAATACTAGTGTTATTAAAGATTTGaa < 1:226634/138‑1 (MQ=255) aaaTTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGAAAATACTAGTGTTATTAAAGATTTGaa > 2:930764/1‑141 (MQ=255) ttAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGAAAATACTAGTGTTATTAAAGATTTGaataaa < 1:629765/141‑1 (MQ=255) agtatTGCAAATATGATTATAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTATTAGCTAATGTAATTATAGAAAATACTAGTGTTATTAAAGATTTGaataaaata < 2:1036995/139‑1 (MQ=255) aaTATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGAAAATACTAGTGTTATTAAAGATTTGaataaaata > 1:883994/1‑141 (MQ=255) atatTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGAAAATACTAGTGTTATTAAAGATTTGaataaaataa > 2:868145/1‑141 (MQ=255) atatTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGAAAATACTAGTGTTATTAAAGATTTGaataaaataa > 1:572345/1‑141 (MQ=255) atTGCTAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAGTGTAATGATAGAAAATACTAGTGTTATTAAAGATTTGAataaaataaag > 1:886523/1‑140 (MQ=255) tGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGAAAATACTAGTGTTATTAAAGATTTGAATAAAATAAAAGa > 1:1100/1‑141 (MQ=255) tGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGAAAATACTAGTGTTATTAAAGATTTGAATAAAATAAAAGa < 2:433488/141‑1 (MQ=255) gCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGAAAATACTAGTGTTATTAAAGATTTGAATAAAATAAAAGaa < 1:635324/141‑1 (MQ=255) gCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGAAAATACTAGTGTTATTAAAGATTTGAATAAAATAAAAGaa > 1:636610/1‑141 (MQ=255) | AGTGTACTTTGGATATTAAATTACACGGGTAATTTAGATTTATTCATATTAAGAATAGTTCTGCTTTCATGTCTTTTCATTTTAACGATTAGTGTTATTAATTTATGGACTTTCTTAATGTTACTAAATTTAAATATTGCAAATATGATTAAAGGTAAGCAGCACTTTAAAACAATTCGTTTTATTAATACAGTTTGTAAAAGTATTCTCTTAGTACTAATAGCTAATGTAATGATAGAAAATACTAGTGTTATTAAAGATTTGAATAAAATAAAAGAA > CP000730/1038095‑1038373 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |