| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,306,597 | T→C | 5.9% | S220S (AGT→AGC) | fabG → | short chain dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,306,597 | 0 | T | C | 5.9% | 221.7 / 3.4 | 80 | S220S (AGT→AGC) | fabG | short chain dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (46/29); new base C (2/3); total (48/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.84e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.59e-01 | |||||||||||
TTTGTAGCCGGTAATATGGCAAGTGAGTGGCAAGAAGATGAACTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTACAATGAATCATAATTTGTTAATTAAACAAGGGGTG > CP000730/1306457‑1306737 | tttGTAGCCGGTAATATGGCAAGTGAGTGGCAAGAAGATGAACTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGCGCGCGCCTCCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAgt > 1:284392/1‑141 (MQ=255) tGTAGCCGGTAATATGGCAAGTGAGTGGCAAGAAGATGAACTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAgtgt < 1:765980/141‑1 (MQ=255) tAGCCGGTAATATGGCAAGTGAGTGGCAAGAAGATGAACTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTa < 1:936843/141‑1 (MQ=255) tAGCCGGTAATATGGCAAGTGAGTGGCAAGAAGATGAACTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTa > 1:540848/1‑141 (MQ=255) tAGCCGGTAATATGGCAAGGGAGTGGCAAGAAGATGAACTTCAAGCAATGACAACTGAGTTACCACAACAGCGAATGGCTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATAAATGGGCCTATGTATATCACTCAATAGCTAGAAGCGTTa > 2:684482/1‑141 (MQ=255) atatGGCAAGTGAGTGGCAAGAAGATGAACTTCAAGCAATGATAACTGACTTACCACAACAGCGAGTGGGTGTACCGAGTGTGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACta > 1:319457/1‑141 (MQ=255) atatGGCAAGTGAGTGGCAAGAAGATGAACTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACta > 2:375113/1‑141 (MQ=255) atatGGCAAGTGAGTGGCAAGAAGATGAACTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACta > 2:973600/1‑141 (MQ=255) ggCAAGTGAGTGGCAAGAAGATGAACTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACa > 2:567712/1‑141 (MQ=255) ggCAAGTGAGTGGCAAGAAGATGAACTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACa < 1:380711/141‑1 (MQ=255) gCAAGTGAGTGGCAAGAAGATGAACTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAg < 2:944064/141‑1 (MQ=255) agtgagtgGCAAGAAGATGAACTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGaaa < 1:790453/141‑1 (MQ=255) gtgagtgGCAAGAAGATGAACTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAg > 2:969494/1‑141 (MQ=255) gagtgGCAAGAAGATGAACTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGtt > 2:108504/1‑141 (MQ=255) ggcaggaataagaTGAACTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTa < 2:585042/132‑1 (MQ=255) agtgGCAAGAAGATGAACTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTa < 2:170679/141‑1 (MQ=255) tGAACTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGta < 2:874577/141‑1 (MQ=255) tGAACTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGta > 1:57012/1‑141 (MQ=255) gAACTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGtat > 2:190013/1‑141 (MQ=255) aaCTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACTCAAATGCTAGAAGCGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGtata < 1:677556/141‑1 (MQ=255) aaCTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGtata < 1:15042/141‑1 (MQ=255) aaCTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGtata > 1:489955/1‑141 (MQ=255) aaCTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGtata > 2:1019494/1‑141 (MQ=255) aaCTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGG‑TTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTCTACCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTatat > 1:18934/1‑141 (MQ=255) cAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTaa > 2:720479/1‑141 (MQ=255) cAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTaa < 1:37042/141‑1 (MQ=255) aaGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTaaa > 2:29396/1‑141 (MQ=255) tGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAg < 1:145736/141‑1 (MQ=255) tGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAg > 2:968674/1‑141 (MQ=255) gATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGa < 1:137233/141‑1 (MQ=255) aTAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGATTTACCGAGTGATGTTGCTCATCCAGGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGaa > 2:311822/1‑141 (MQ=255) tAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAAc > 1:137871/1‑141 (MQ=255) tAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAAc > 1:45460/1‑141 (MQ=255) aCTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACCTGCGCCAATTTATATCAACCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTa < 1:917988/141‑1 (MQ=255) aaTTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTAtttt < 2:187773/141‑1 (MQ=255) cacaACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAg > 2:666515/1‑141 (MQ=255) caacaGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCa < 1:2602/141‑1 (MQ=255) gATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAACTGttt > 2:215619/1‑141 (MQ=255) ttGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGTAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAGCTATTTTTATTAGCAAATGttttt < 2:914314/141‑1 (MQ=255) ttGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGttttt < 1:479477/141‑1 (MQ=255) ttGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGttttt < 2:356524/141‑1 (MQ=255) tGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTa < 1:567712/141‑1 (MQ=255) ggTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCTCCCACATGCTAGCCGTGTTCCAGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTac < 1:1029169/141‑2 (MQ=255) ttttACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACTCAAATGCTAGAAGCGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTAtga < 2:575272/141‑1 (MQ=255) tACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAGATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTAtgattg < 2:107224/141‑1 (MQ=255) tACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTAtgattg < 1:637513/141‑1 (MQ=255) ccGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTAtgattgat > 2:89544/1‑141 (MQ=255) cGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACTCAAATGCTAGAAGCGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATg < 2:805180/141‑1 (MQ=255) cGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATg < 2:817969/141‑1 (MQ=255) gTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTta > 2:678695/1‑141 (MQ=255) aGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTataa > 1:980572/1‑141 (MQ=255) ggTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTataat > 2:625311/1‑141 (MQ=255) gTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTataata < 2:744705/141‑1 (MQ=255) tGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATg > 2:971732/1‑141 (MQ=255) tGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGATAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAAAGTTTTTTTGATTGATGTTATAatatt > 2:507928/1‑140 (MQ=255) gCTCATACATGCGCCTATTTATATCACTCAAATGCTAGAAGCGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGa > 1:980406/1‑141 (MQ=255) gCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTAtgattgat < 1:225080/129‑1 (MQ=255) gCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTAtgattgat > 2:225080/1‑129 (MQ=255) tCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAat > 1:78048/1‑141 (MQ=255) cATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTAc > 2:239854/1‑141 (MQ=255) cATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTAc > 1:556468/1‑141 (MQ=255) cgcCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTACAATg > 1:995070/1‑141 (MQ=255) cgcCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTACAATg > 1:253619/1‑141 (MQ=255) cgcCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTACAATg > 2:32014/1‑141 (MQ=255) cgcCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTACAATg > 1:675943/1‑141 (MQ=255) cgcCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTACAATg > 2:1031563/1‑141 (MQ=255) ccTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTACAATGaa > 2:688183/1‑141 (MQ=255) ccTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTACAATGaa > 2:300217/1‑141 (MQ=255) ccTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTACAATGaa > 1:801642/1‑141 (MQ=255) cTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTACAATGAAt < 2:550882/141‑1 (MQ=255) cTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTACAATGAAt < 1:952735/141‑1 (MQ=255) aTTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAGCTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTACAATGAATCa < 2:325213/141‑1 (MQ=255) tatCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTACAATGAATCATAAtt > 2:199517/1‑141 (MQ=255) tCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTACAATGAATCATAATTTg > 2:685766/1‑141 (MQ=255) tCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTACAATGAATCATAATTTg > 2:866068/1‑141 (MQ=255) tCACCCAAACGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACATAAAGTAACTGGTGCGTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGCTTTTATGATTGATGTTCTAATATGAATATTACGATGAATCATaactcg > 2:805067/1‑137 (MQ=255) tGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTACAATGAATCATAATTTGTTAATTaaa > 1:921965/1‑141 (MQ=255) tGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTACAATGAATCATAATTTGTTAATTaaa < 1:205156/141‑1 (MQ=255) aGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTACAATGAATCATAATTTGTTAATTAAACAAg > 1:878141/1‑141 (MQ=255) aGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTACAATGAATCATAATTTGTTAATTAAACAAg > 2:692959/1‑141 (MQ=255) gAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTACAATGAATCATAATTTGTTAATTAAACAAgg < 1:1055261/141‑1 (MQ=255) aaGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTACAATGAATCATAATTTGTTAATTAAACAAggg > 1:372748/1‑141 (MQ=255) tgtTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTACAATGAATCATAATTTGTTAATTAAACAAGGGGTg < 2:532523/141‑1 (MQ=255) | TTTGTAGCCGGTAATATGGCAAGTGAGTGGCAAGAAGATGAACTTCAAGCAATGATAACTGAATTACCACAACAGCGATTGGTTTTACCGAGTGAGGTTGCTCATACATGCGCCTATTTATATCACCCAAATGCTAGAAGTGTTACTGGAACTATACAGAAAGTTAATGGTGCTTGGTATATTTAAAATATAGAACTATTTTTATGAGCAAATGTTTTTATGATTGATGTTATAATATGAATATTACAATGAATCATAATTTGTTAATTAAACAAGGGGTG > CP000730/1306457‑1306737 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |