| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,346,086 | C→T | 5.9% | intergenic (‑230/+240) | USA300HOU_1259 ← / ← ltaE | hypothetical protein/threonine aldolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,346,086 | 0 | C | T | 5.9% | 260.4 / 3.5 | 84 | intergenic (‑230/+240) | USA300HOU_1259/ltaE | hypothetical protein/threonine aldolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (29/50); new base T (2/3); total (31/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.60e-01 | |||||||||||
TCTTAATCATCGAAAAGTCACAAACATCTCCATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTACCTTGTTTTGGAATAATGTAATTTTATATCATCA > CP000730/1345948‑1346225 | tcctAATCATCGAAAAGTCACAAACATCTCCATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTTCATTTAAACTAAACATAGATATTCTTACAAATATATACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATCACTTTCATAAAATAACTATaa > 2:66421/4‑141 (MQ=255)tCTTAATCATCGAAAAGTCACAAACATCTCCATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACaa < 1:604415/141‑1 (MQ=255)ccatattcatcGAAAAGTCACAAACATCTCCATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACaa < 1:817421/135‑1 (MQ=255) cTTAATCATCGAAAAGTCACAAACATCTCCATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAAc > 2:402476/1‑141 (MQ=255) cTTAATCATCGAAAAGTCACAAACATCTCCATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAAc > 2:433767/1‑141 (MQ=255) tcatcGAAAAGTCACAAACATCTCCATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACcatca < 1:55831/141‑1 (MQ=255) gAAAAGTCACAAACATCTCCATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCataata > 1:559928/1‑141 (MQ=255) aaaaGTCACAAACATCTCCATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATAc < 2:1069780/141‑1 (MQ=255) aGTCCCAACCATATCCATATTACAAACCTAAATAGTGCCTTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATACCCTTAGTAATCCGCTCGCTAAAACATTCCCTCCACAAACTAACTACCACAATCATACTACTtc < 2:270113/141‑1 (MQ=255) aGTCACAAACATCTCCATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTtc < 1:533199/141‑1 (MQ=255) tCACAAACATCTCCATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTtctc > 1:48479/1‑141 (MQ=255) cacaAACATCTCCATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCTATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCa < 1:201497/141‑1 (MQ=255) cacaAACATCTCCATACTACACACATAAATTGTGCATTCCTTTTAGACTAAACATCGATATTCCGACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCa < 1:313913/141‑1 (MQ=255) aaaCATCTCCATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAAt > 2:54466/1‑141 (MQ=255) aaaCATCTCCATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACCTCTCAAAt > 2:54695/1‑141 (MQ=255) cATCTCCATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATgtc < 2:686777/141‑1 (MQ=255) aTCTCCATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATgtcg < 1:843123/141‑1 (MQ=255) tctcCATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATgtcgt < 2:194921/141‑1 (MQ=255) gctcCATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATGTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATgtcgt < 2:894006/140‑1 (MQ=255) tcCATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTTCATTTAAACTAAACATAGATATTCTTACAAATATATACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATCACTTTCATAAAATAACTATAACCATCATAATACTTCTCAAATCTCGTCa < 1:98612/141‑1 (MQ=255) cATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCaaa > 1:321391/1‑141 (MQ=255) cATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCaaa > 1:618470/1‑141 (MQ=255) cATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCaaa > 1:618811/1‑141 (MQ=255) cATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCaaa < 2:138366/141‑1 (MQ=255) atatTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAAt < 2:29488/141‑1 (MQ=255) tatTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAAtt > 1:533758/1‑141 (MQ=255) tatTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAAtt > 1:533612/1‑141 (MQ=255) aaaCTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTa < 2:355721/141‑1 (MQ=255) ttAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTCCCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAATATTTCTTCATCCATTATATTACTTCTCAAATGTCGGCAAATTAAAGTAAATa < 1:285437/141‑1 (MQ=255) tAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATAc > 1:88080/1‑141 (MQ=255) aTAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGc < 2:113192/141‑1 (MQ=255) tAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGca < 2:1082230/141‑1 (MQ=255) cATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAAt < 1:403475/141‑1 (MQ=255) ccATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAAc < 1:6605/141‑1 (MQ=255) ccATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAAc < 1:671758/141‑1 (MQ=255) tttAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCGCAAATGTCTTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACAtt < 1:414640/141‑1 (MQ=255) taaactaaacATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACAtttt > 2:639927/1‑141 (MQ=255) taaactaaacATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACAtttt > 1:927043/1‑141 (MQ=255) actaaacATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTaa > 1:265815/1‑141 (MQ=255) aTCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAAtatata > 2:320232/1‑141 (MQ=255) tCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATataa < 2:85197/141‑1 (MQ=255) cGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATataaa < 1:931818/141‑1 (MQ=255) cGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTAAAATTAATGTAACTCTAACACAAATTAACATTTTTAAATATataaa < 2:48479/141‑1 (MQ=255) tatTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATataaaata > 2:401372/1‑141 (MQ=255) tagtCCGACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATataaaata > 2:482505/4‑141 (MQ=255) atTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATataaaataa < 1:54466/141‑1 (MQ=255) atTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACCTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATataaaataa < 1:54695/141‑1 (MQ=255) tCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATAtaaaataaaa < 2:826789/141‑1 (MQ=255) ccTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAAc < 2:180508/141‑1 (MQ=255) cTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACa < 2:329421/141‑1 (MQ=255) tACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACaa < 1:964809/141‑1 (MQ=255) aaTATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATa > 1:1017898/1‑141 (MQ=255) atatatACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATCACTTTCATAAAATAACTATAACCATCATAATACTTCTCAAATCTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATAc < 2:484242/141‑1 (MQ=255) atatAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATAc > 1:297008/1‑141 (MQ=255) ataGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTc < 2:240360/141‑1 (MQ=255) ataCTTAGTAATTCGATTGTTAATACATCACTTTCATAAAATAACTATAACCATCATAATACTTCTCAAATCTCGTCAAATTAAAGTAAATACGGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACtaca < 1:478743/139‑4 (MQ=255) aGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCaa < 1:453197/141‑1 (MQ=255) cTTAGTAATTCGATTGTTAATACATCACTTTCATAAAATAACTATAACCATCATAATACTTCTCAAATCTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCaataa > 2:671660/1‑141 (MQ=255) tAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAGAATAGCTACGACCATCATAATAGTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATc < 1:644260/141‑1 (MQ=255) gTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTg > 1:458594/1‑141 (MQ=255) cGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTAc < 1:371647/141‑1 (MQ=255) cGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTAc < 2:438336/141‑1 (MQ=255) cGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTCCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTAc < 1:695818/141‑1 (MQ=255) gTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTACCTTGt < 2:1042032/141‑1 (MQ=255) aaTACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTACCTTGtttt < 2:599781/141‑1 (MQ=255) aCATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTACCTTGTTTTGGa > 1:4469/1‑141 (MQ=255) aTTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTACCTTGTTTTGGaat < 2:168663/141‑1 (MQ=255) cTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTACCTTGTTTTGGAATAATg < 2:33292/141‑1 (MQ=255) tCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTACCTTGTTTTGGAATAATGTaa > 2:442035/1‑141 (MQ=255) tCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTACCTTGTTTTGGAATAATGTaa > 2:958232/1‑141 (MQ=255) tCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAAGACGGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTACCTTGTTTTGGAATAATGTaa < 1:373613/141‑1 (MQ=255) cATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTATCAGTTTTTGGAATAATGTAAt > 1:826313/1‑141 (MQ=255) cATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTACCTTGTTTTGGAATAATGTAAt < 2:720922/141‑1 (MQ=255) aTAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTACCTTGTTTTGGAATAATGTAAtt > 1:395875/1‑141 (MQ=255) aTAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTACCTTGTTTTGGAATAATGTAAtt > 1:29468/1‑141 (MQ=255) tAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTACCTTGTTTTGGAATAATGTAAttt < 2:941331/141‑1 (MQ=255) aaaTAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTACCTTGTTTTGGAATAATGTAATTTta < 1:330212/141‑1 (MQ=255) aTAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTACCTTGTTTTGGAATAATGTAATTTtata > 1:731298/1‑141 (MQ=255) tAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTACCTTGTTTTGGAATAATGTAATTTTatat < 1:1006269/141‑1 (MQ=255) tAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTACCTTGTTTTGGAATAATGTAATTTTatat < 1:547845/141‑1 (MQ=255) tAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTACCTTGTTTTGGAATAATGTAATTTTatat < 1:665753/141‑1 (MQ=255) aaCTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTACCTTGTTTTGGAATAATGTAATTTTATatc < 2:1067895/141‑1 (MQ=255) cTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTACCTTGTTTTGGAATAATGTAATTTTATatcat > 1:868818/1‑141 (MQ=255) aCAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGAAAATACAGCACACATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTACCTTGTTTTGGAATAATGTAATTTTATAtcatca < 2:933889/141‑1 (MQ=255) | TCTTAATCATCGAAAAGTCACAAACATCTCCATATTAAAAACTTAAATAGTGCATTCCATTTAAACTAAACATCGATATTCCTACCAATATAGACTTAGTAATTCGATTGTTAATACATTACTTTCATAAAATAACTACAACCATCATAATACTTCTCAAATGTCGTCAAATTAAAGTAAATACAGCACAAATTAACATTTTTAAATATATAAAATAAAACAAGATACTCAATAATCTGTAGTACCTTGTTTTGGAATAATGTAATTTTATATCATCA > CP000730/1345948‑1346225 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |