| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 1,353,873 | 0 | A | C | 5.8% | 262.6 / 9.0 | 87 | intergenic (+66/+77) | nucA/USA300HOU_1269 | micrococcal nuclease A/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/44); new base C (3/2); total (41/46) | |||||||||||
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CAAATATAGAAATGTATTTATAGAAGCACAAAATAAAGCTAAACAACAGAAATTAAATATTTGGAGTAAATAATTAAATAGGTGATTATATATATTAAAGTAAAATATACTTGAAGCATCGATTTATTATTACCATAAATTTATATAT‑‑A‑‑GAAATAATTTAAAGGCATAATAACCATAGTGCGTATCGAGCGTAATGGATTATTATGCCTTTGATTTTACTTGAATATAGCTGTGATTTGATCAACCTGTTCTTTATTTAAAGGGTGTTTAGATAGCTCT > CP000730/1353735‑1354013 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |