| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,489,391 | C→T | 7.3% | P4211P (CCG→CCA) | ebh ← | extracellular matrix binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,489,391 | 0 | C | T | 7.3% | 274.0 / 8.1 | 95 | P4211P (CCG→CCA) | ebh | extracellular matrix binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (42/45); new base T (4/3); total (47/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.11e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.74e-01 | |||||||||||
TTTGTTAAGTGTGATAATGTATTTAAGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACTTGTTTTGACTGTTGTTTCGTTAGCAATACTATCTCTTAAGCCTTT > CP000730/1489254‑1489531 | tttGTTAAGTGTGATAATGTATTTAAGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGa < 1:298566/141‑1 (MQ=255) ttGTTAAGTGTGATAATGTATTTAAGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGAt > 2:132736/1‑141 (MQ=255) tGTTAAGTGTGATAATGTATTTAAGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGAtt > 2:502054/1‑141 (MQ=255) gTTAAGTGTGATAATGTATTTAAGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTg < 1:894501/141‑1 (MQ=255) tAAGTGTGATAATGTATTTAAGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGtt > 2:449856/1‑141 (MQ=255) aaGTGTGATAATGTATTTAAGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTa > 1:80862/1‑141 (MQ=255) aGTGTGATAATGTATTTAAGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGGTTGTTAg > 2:489034/1‑141 (MQ=255) aGTGTGATAATGTATTTAAGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAg < 1:132736/141‑1 (MQ=255) gtgtGATAATGTATTTAAGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGt < 1:131821/141‑1 (MQ=255) gtgATAATGTATTTAAGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGttt > 1:996109/1‑141 (MQ=255) tgATAATGTATTTAAGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTTGTTTTTTTTACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTg > 2:200000/1‑141 (MQ=255) gATAATGTATTTAAGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGa > 1:795747/1‑141 (MQ=255) gATAATGTATTTAAGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGa > 1:250613/1‑141 (MQ=255) aTAATGTATTTAAGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGAt > 2:198955/1‑141 (MQ=255) tGTAATTAAGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCTCCGTTTCATCCATTTTTAGCATTGTTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTatt < 2:630958/141‑3 (MQ=255) aTTTAAGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCTTTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGAt > 2:1049592/1‑141 (MQ=255) tttAAGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATa < 2:608971/141‑1 (MQ=255) tttAAGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATa > 1:700230/1‑141 (MQ=255) tttAAGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATa > 1:922750/1‑141 (MQ=255) tttAAGTTTTGCTTAGCAGGGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCTCCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCTCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATa > 2:1084121/1‑141 (MQ=255) tAAGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATAcc < 2:577966/141‑1 (MQ=255) aaGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTTGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCt > 1:1009677/1‑141 (MQ=255) aaGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTTGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCt > 1:1009653/1‑141 (MQ=255) gTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCttt < 2:28680/141‑1 (MQ=255) gTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCttt < 1:363510/141‑1 (MQ=255) tttGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCg < 2:996653/141‑1 (MQ=255) tGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCa > 1:1007765/1‑141 (MQ=255) tGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCa > 2:50026/1‑141 (MQ=255) gCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCAt > 2:615500/1‑141 (MQ=255) gCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCAt > 2:591253/1‑141 (MQ=255) ttAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCAttt > 1:220269/1‑141 (MQ=255) gCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTTGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGac < 2:370310/141‑1 (MQ=255) gCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGac > 1:791487/1‑141 (MQ=255) aGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGacac < 2:806570/141‑1 (MQ=255) gtgtTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGAcaca < 2:692405/141‑1 (MQ=255) tgtgCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCta < 1:299163/141‑1 (MQ=255) tgCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTCCTATATATAGTAGGACCGTTAGTATGCTTAAAGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCtatt > 1:644311/1‑141 (MQ=255) gCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCtatta < 2:88533/141‑1 (MQ=255) cATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCtattat < 1:454664/141‑1 (MQ=255) tttCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTatat < 2:547834/141‑1 (MQ=255) tttCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTatat < 2:521737/141‑1 (MQ=255) cTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTTGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGtt < 2:372649/141‑1 (MQ=255) tAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGa > 2:434223/1‑141 (MQ=255) ttttCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTgg < 1:330556/141‑1 (MQ=255) ttttCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTgg < 1:132048/141‑1 (MQ=255) tttCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGt > 2:312795/1‑141 (MQ=255) ttCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGtt < 1:406205/141‑1 (MQ=255) ttCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGtt > 1:985291/1‑141 (MQ=255) tCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTa > 1:902973/1‑141 (MQ=255) tCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTa > 1:205273/1‑141 (MQ=255) cAGCACCGTTTAAACCATTTTTTTTTTTTTTTTCTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTATTGATACCTTTCGCTTTTGACACAGCTCTATTATATTTTGttttttttt > 2:364672/1‑135 (MQ=255) aGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGGCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTAtt > 2:739104/1‑141 (MQ=255) ccGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGTTTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGa > 2:805834/1‑141 (MQ=255) ccGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGa > 1:691646/1‑141 (MQ=255) ttAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGA‑TGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGc < 2:502747/141‑1 (MQ=255) tAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGc < 2:588295/141‑1 (MQ=255) tAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGc > 1:767494/1‑141 (MQ=255) aaaCCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTTGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCg > 2:307697/1‑141 (MQ=255) aaaCCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTTGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCg > 2:307709/1‑141 (MQ=255) cATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGTGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTg < 1:573004/141‑1 (MQ=255) cATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTg < 2:212050/141‑1 (MQ=255) cATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTg < 1:126965/141‑1 (MQ=255) tttttAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTTGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGta < 2:341341/141‑1 (MQ=255) tttttAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGta < 1:1017115/141‑1 (MQ=255) ttAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAg > 1:237463/1‑141 (MQ=255) tttttttttttcTTGTGTTGTAGCCTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTTTCATATCGCTTTTATATGTTGATTGGTTATTCGGCCTTGCTTCTGTATAGtt > 2:879003/12‑141 (MQ=255) cATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATTTGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGtttt < 2:224639/141‑1 (MQ=255) cATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGtttt < 2:119589/141‑1 (MQ=255) cATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGtttt < 2:372963/141‑1 (MQ=255) ttattCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGa > 1:761695/1‑141 (MQ=255) tattCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGAc < 1:732810/141‑1 (MQ=255) attCACTTGTGTTGGAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCGTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACt < 1:181971/141‑1 (MQ=255) tCACTTGTGTTCGAGGTTGGGTACTCGATCTACTATCCATAGTCGGATTGTTAGTGTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTCATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATATTTTTGACTTg < 2:1029944/141‑1 (MQ=255) cTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACTTGttt > 1:677002/1‑141 (MQ=255) tgtgTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGCATTGCGAATGTACATGTCTGACTTGTTTTg < 2:273849/141‑1 (MQ=255) tgtgTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACTTGTTTTg > 1:163505/1‑141 (MQ=255) ttgtAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACTTGTTTTGACtg < 2:604934/141‑1 (MQ=255) tgtAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACTTGTTTTGACtgt < 2:191137/141‑1 (MQ=255) gtAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTTTATAGTTTTGACTTGTTTTGACtgtt > 2:33366/1‑141 (MQ=255) gtAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACTTGTTTTGACtgtt < 2:911254/141‑1 (MQ=255) gtAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACTTGTTTTGACtgtt > 1:333759/1‑141 (MQ=255) aGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACTTGTTTTGACtgttgt > 2:478721/1‑141 (MQ=255) cTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACTTGTTTTGACTGTTGttt > 1:277105/1‑141 (MQ=255) cTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACTTGTTTTGACTGTTGttt > 1:1019934/1‑141 (MQ=255) gggTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACTTGTTTTGACTGTTGTTTCGt < 1:500263/141‑1 (MQ=255) gggTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACTTGTTTTGACTGTTGTTTCGt < 1:629605/141‑1 (MQ=255) ggTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACTTGTTTTGACTGTTGTTTCGtt < 2:626071/141‑1 (MQ=255) aaTCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACTTGTTTTGACTGTTGTTTCGTTAGc < 2:457466/141‑1 (MQ=255) gCACTAGTCTCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACTTGTTTTGACTGTTGTTTCGTTAGCAATa < 2:36666/141‑1 (MQ=255) aCTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACTTGTTTTGACTGTTGTTTCGTTAGCAATACt < 2:90728/141‑1 (MQ=255) cTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACTTGTTTTGACTGTTGTTTCGTTAGCAATACTa < 1:901818/141‑1 (MQ=255) aGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACCGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACTTGTTTTGACTGTTGTTTCGTTAGCAATACTAtc > 1:246974/1‑141 (MQ=255) tATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACTTGTTTTGACTGTTGTTTCGTTAGCAATACTAtctc > 1:704187/1‑141 (MQ=255) aTCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACTTGTTTTGACTGTTGTTTCGTTAGCAATACTATctct < 1:1065408/141‑1 (MQ=255) cATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACTTGTTTTGACTGTTGTTTCGTTAGCAATACTATCTCTTaa < 1:85279/141‑1 (MQ=255) cGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACTTGTTTTGACTGTTGTTTCGTTAGCAATACTATCTCTTAAGCCttt > 1:37659/1‑141 (MQ=255) | TTTGTTAAGTGTGATAATGTATTTAAGTTTTGCTTAGCAGTGTTTTGTGCATTTCTTAAGTTTTCAGCACCGTTTAAACCATTTTTAGCATTATTCACTTGTGTTGTAGCTTGGGTAATCGCACTAGTATCCATAGTCGGATTGTTAGTTTGATTAATGATACCTTTCGCATTTGACACAGCGCTATTATATGTTGATTGGTTATTCGGACTTGCGTCTGTATAGTTTTGACTTGTTTTGACTGTTGTTTCGTTAGCAATACTATCTCTTAAGCCTTT > CP000730/1489254‑1489531 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |