| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,521,608 | G→A | 6.6% | intergenic (+548/+18) | pbp2 → / ← USA300HOU_1389 | penicillin‑binding protein 2/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,521,608 | 0 | G | A | 6.6% | 217.0 / 2.8 | 71 | intergenic (+548/+18) | pbp2/USA300HOU_1389 | penicillin‑binding protein 2/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/29); new base A (2/3); total (39/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.52e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.52e-01 | |||||||||||
AGATATCTTAAAGCATATCTCAAGATATCCATTATGATGTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTAAAGGTCTTCATTTGTCGATAGCCCATAAAATGATATTTACGTTCAATCATAT > CP000730/1521470‑1521741 | aGATATCTTAAAGCATATCTCAAGATATCCATTATGATGTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGa > 2:793246/1‑141 (MQ=255) gATATCTTAAAGCATATCTCAAGATATCCATTATGATGTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGaa < 1:434990/141‑1 (MQ=255) atatCTTAAAGCATATCTCAAGATATCCATTATGATGTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGaaa > 1:958905/1‑141 (MQ=255) aGCATATCTCAAGATATCCATTATGATGTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATc > 2:270887/1‑141 (MQ=255) gCATATCTCAAGATATCCATTATGATGTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCt > 1:416126/1‑141 (MQ=255) gCATATCTCAAGATATCCATTATGATGTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCt < 1:69471/141‑1 (MQ=255) cATATCTCAAGATATCCATTATGATGTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCtt > 1:537491/1‑141 (MQ=255) atCTCAAGATATCCATTATGATGTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTc < 1:343124/141‑1 (MQ=255) gctcAAGATATCCATTATGATGTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCt > 2:428475/2‑141 (MQ=255) aGATATCCATTATGATGTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATTGATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATAcc < 1:1062977/141‑1 (MQ=255) aGATATCCATTATGATGTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATAcc > 2:440628/1‑141 (MQ=255) aGATATCCATTATGATGTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATAcc < 1:203260/141‑1 (MQ=255) aGATATCCATTATGATGTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATAcc < 2:842906/141‑1 (MQ=255) tatCCATTATGATGTAGATGGCCAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCCTGTCTATACCTGc < 2:848614/141‑1 (MQ=255) tatCCATTATGATGTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGc > 1:1056377/1‑141 (MQ=255) tatCCATTATGATGTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGc > 2:307415/1‑141 (MQ=255) atCCATTATGATGTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCt < 1:41472/141‑1 (MQ=255) ccATTATGATGTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTa < 1:802144/141‑1 (MQ=255) ccATTATGATGTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATAGTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTa > 1:556016/1‑141 (MQ=255) cATTATGATGTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTAt < 2:282791/141‑1 (MQ=255) ttATGATGTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTc < 2:722250/141‑1 (MQ=255) tATGATGTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATATTGTCTATACCTGCTTATTCt > 2:541031/1‑141 (MQ=255) gTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAAcc > 2:311337/1‑141 (MQ=255) gTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAAATACAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTACATATTTTCAACATTAAGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAAcc < 1:1067006/141‑1 (MQ=255) aGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTATCTATACCTGCTTATTCTTTAACCtt > 2:858556/1‑141 (MQ=255) gATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTg > 1:166476/1‑141 (MQ=255) ggACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGttt > 1:809277/1‑141 (MQ=255) ttttATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACt > 1:609550/1‑141 (MQ=255) tttATATTAAGAAGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTa < 2:1026399/141‑1 (MQ=255) tataTTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGc > 2:770886/1‑141 (MQ=255) atatTAAGACGTTGTAATGCCACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGca < 2:1050074/141‑1 (MQ=255) atTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATACATACAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTAACTATTTTCAACCCTAAGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGcatt < 1:103362/141‑1 (MQ=255) atTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGcatt < 1:465493/141‑1 (MQ=255) atTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGcatt < 1:359501/141‑1 (MQ=255) aaGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGcattcat > 2:355220/1‑141 (MQ=255) aaGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGcattcat > 1:926597/1‑141 (MQ=255) aGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGcattcatt > 2:743735/1‑141 (MQ=255) gACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCAttt < 2:798070/141‑1 (MQ=255) aCGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACATTGTTTGATAACTAGCCTTCAtttt > 2:316796/1‑141 (MQ=255) gTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTaa > 1:964495/1‑141 (MQ=255) gTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTaa > 1:155505/1‑141 (MQ=255) tGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATc < 1:442828/141‑1 (MQ=255) tGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATc > 1:1494/1‑141 (MQ=255) tGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATc < 2:992765/141‑1 (MQ=255) cacgacacCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGt > 1:1001108/1‑141 (MQ=255) gacacCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGtttt > 2:1041179/1‑141 (MQ=255) cacCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTaa < 2:461174/141‑1 (MQ=255) cacCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTaa > 2:723011/1‑141 (MQ=255) acCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGACCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTaaa < 1:60032/141‑1 (MQ=255) aaCATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTAAAGGTc < 1:963467/141‑1 (MQ=255) aaCATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTAAAGGTc > 1:247018/1‑141 (MQ=255) aaCATAAATACAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTACATATTTTCAACATTAAGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTAAAGGTc < 1:29074/141‑1 (MQ=255) cATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTAAAGGTCtt > 2:834149/1‑141 (MQ=255) atttATAATTATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTAAAGGTCTTCAt > 2:349036/3‑141 (MQ=255) aaTTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTAAAGGTCTTCAt < 1:938287/141‑1 (MQ=255) ttATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTAAAGGTCTTCAttt < 2:656203/141‑1 (MQ=255) ataAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTAAAGGTCTTCATTTGt < 1:59270/141‑1 (MQ=255) ataAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTAAAGGTCTTCATTTGt > 2:93586/1‑141 (MQ=255) aaTATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTAAAGGTCTTCATTTGTCGa > 1:948905/1‑141 (MQ=255) aaTATGTGTGCATGAATTAGTTTTACATATTTTCAACATTAAGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTAAAGGTCTTCATTTGTCGa > 1:198461/1‑141 (MQ=255) tatGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTAAAGGTCTTCATTTGTCGATa > 1:996181/1‑141 (MQ=255) atGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTAAAGGTCTTCATTTGTCGATAg < 2:764778/141‑1 (MQ=255) tgtgtgCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTAAAGGTCTTCATTTGTCGATAGc < 2:996181/141‑1 (MQ=255) aTTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTAAAGGTCTTCATTTGTCGATAGCCCATAAAATGa < 1:963440/141‑1 (MQ=255) aGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGGTTTAAAGGTCTTCATTTGTCGATAGCCCATAAAATGatat < 2:935666/141‑1 (MQ=255) ttttCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTAAAGGTCTTCATTTGTCGATAGCCCATAAAATGATATTTACGTTCaat > 1:57667/1‑141 (MQ=255) ttttCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTAAAGGTCTTCATTTGTCGATAGCCCATAAAATGATATTTACGTTCaat > 2:316631/1‑141 (MQ=255) ttCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTAAAGGTCTTCATTTGTCGATAGCCCATAAAATGATATTTACGTTCaatca > 1:188119/1‑141 (MQ=255) ttCAACATTAAGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTCAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTAAAGGTCTTCATTTGTCGATAGCCCATAAAATGATATTTACGTTCaatca > 2:723285/1‑141 (MQ=255) cAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTAAAGGTCTTCATTTGTCGATAGCCCATAAAATGATATTTACGTTCaatcata < 1:131613/141‑1 (MQ=255) aaCATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTAAAGGTCTTCATTTGTCGATAGCCCATAAAATGATATTTACGTTCaatcatat > 2:1058221/1‑141 (MQ=255) | AGATATCTTAAAGCATATCTCAAGATATCCATTATGATGTAGATGGACAGTTTTTATATTAAGACGTTGTAATGACACGACACCTAACATAATTATAAATATGTGTGCATGAATTAGTTTTATATATTTTCAACATTAGGAAATGATCAATCTTGTCTATACCTGCTTATTCTTTAACCTTGTTTGATAACTAGCATTCATTTTAATCAATTCAGTTTTAAAGGTCTTCATTTGTCGATAGCCCATAAAATGATATTTACGTTCAATCATAT > CP000730/1521470‑1521741 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |