| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,627,378 | G→T | 5.9% | I365I (ATC→ATA) | pgd ← | phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,627,378 | 0 | G | T | 5.9% | 279.5 / 4.8 | 83 | I365I (ATC→ATA) | pgd | phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/45); new base T (3/2); total (36/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.48e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
GAACACCAGTTGCGACAACATCACGTAACGCATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAATTTTACTCATATATAATGCTTTACGAATTTT > CP000730/1627239‑1627518 | gAACACCAGTTGCGACAACATCACGTAACGCATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGa < 1:448475/141‑1 (MQ=255)gAACACCAGTTGCGACAACATCACGTAACGCATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGa < 2:251498/141‑1 (MQ=255)gAACACCAGTTGCGACAACATCACGTAACGCATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGa < 1:624481/141‑1 (MQ=255)gAACACCAGTTGCGACAACATCACGTAACGCATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGa < 2:70437/141‑1 (MQ=255) cacCAGTTGCGACAACATCACGTAACGCATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATaa > 2:591329/1‑141 (MQ=255) cacCAGTTGCGACAACATCACGTAACGCATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATaa > 2:584796/1‑141 (MQ=255) cacCAGTTGCGACAACATCACGTAACGCATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATaa < 1:142547/141‑1 (MQ=255) ccAGTTGCGACAACATCACGTAACGCATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATg < 2:1058891/141‑1 (MQ=255) ccAGTTGCGACAACATCACGTAACGCATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATg > 1:265157/1‑141 (MQ=255) gCGACAACATCACGTAACGCATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCt < 1:862618/141‑1 (MQ=255) cGACAACATCACGTAACGCATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCtt > 2:807086/1‑141 (MQ=255) acaacaTCACGTAACGCATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTtct > 1:37946/1‑141 (MQ=255) caacaTCACGTAACGCATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTtctc > 2:856462/1‑141 (MQ=255) acaTCACGTAACGCATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTtctctc < 2:984807/141‑1 (MQ=255) aTCACGTAACGCATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCa < 1:108480/141‑1 (MQ=255) tCACGTAACGCATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCaa < 1:968361/141‑1 (MQ=255) tAACGCATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCAt > 1:889926/1‑141 (MQ=255) aCGCATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAg > 2:350796/1‑141 (MQ=255) cGCATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGc > 1:364332/1‑141 (MQ=255) cATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTa < 2:307819/141‑1 (MQ=255) cATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTa > 1:447674/1‑141 (MQ=255) cATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTa > 1:448087/1‑141 (MQ=255) cTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAAt > 2:516440/1‑141 (MQ=255) cTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAAt < 2:753146/141‑1 (MQ=255) tGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCa < 2:687961/141‑1 (MQ=255) cAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGTATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGtt > 1:992741/1‑141 (MQ=255) aaCGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGTATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTaa > 1:81600/1‑141 (MQ=255) aaCGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTaa < 1:680602/141‑1 (MQ=255) gATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATCAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAAtt < 2:788997/141‑1 (MQ=255) gATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAAtt > 1:335785/1‑141 (MQ=255) tttAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGTATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCcattc < 2:526820/141‑1 (MQ=255) tAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCACGTTTTAAATTCcattcat > 2:69331/1‑141 (MQ=255) gTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATc < 2:651545/141‑1 (MQ=255) gATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCAc < 1:86398/141‑1 (MQ=255) gATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCAc < 1:85962/141‑1 (MQ=255) gATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCAc > 1:984073/1‑141 (MQ=255) tCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACtt < 1:990026/141‑1 (MQ=255) tCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACtt < 1:269324/141‑1 (MQ=255) tCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACtt < 1:269410/141‑1 (MQ=255) tCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACtt > 1:528614/1‑141 (MQ=255) tAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTGTCCAAGTCGGAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGc > 1:213690/1‑141 (MQ=255) aGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCt > 2:294075/1‑141 (MQ=255) aGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCt > 1:673446/1‑141 (MQ=255) aTAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTAc < 2:489170/141‑1 (MQ=255) tttGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCAttt > 1:716253/1‑141 (MQ=255) tttGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCAttt < 2:460038/141‑1 (MQ=255) gTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTgcg < 1:961110/141‑1 (MQ=255) gTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTgcg < 1:6944/141‑1 (MQ=255) gTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTgcg < 1:253875/141‑1 (MQ=255) gTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTgcg < 1:491917/141‑1 (MQ=255) gTAATCCTGGATTATTAGCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAAGCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTgcg < 1:449574/141‑1 (MQ=255) tAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTgcgc > 2:208132/1‑141 (MQ=255) aaTCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGcgcg < 2:240190/141‑1 (MQ=255) aaTCCTGGATTATTATCATAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGcgcg < 2:485559/141‑1 (MQ=255) aTCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTGCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGa < 1:785877/141‑1 (MQ=255) ccTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGaaa > 2:1040600/1‑141 (MQ=255) tgATTATTATCGTAATCATCTTTGATCTGTTGTAAGAATTGGTCACGTAGAATTCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCt < 1:99013/140‑1 (MQ=255) ggATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCt < 1:1056870/141‑1 (MQ=255) ttattaTCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTtgt < 1:307879/141‑1 (MQ=255) tatCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTAGACGATACCTTGTGCAt > 1:332437/1‑141 (MQ=255) tAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGaa < 2:826995/141‑1 (MQ=255) aGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACa < 1:796792/141‑1 (MQ=255) aGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACa < 2:889926/141‑1 (MQ=255) cATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACaaa > 2:255336/1‑141 (MQ=255) aTCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAAt < 2:885916/141‑1 (MQ=255) aTCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAAt < 1:14992/141‑1 (MQ=255) tCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAAtt > 1:267651/1‑141 (MQ=255) ttGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAATTTTa > 1:7326/1‑141 (MQ=255) aTCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAATTTTACTc < 2:1051292/141‑1 (MQ=255) cTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAATTTTACTCat > 2:500037/1‑141 (MQ=255) ttttGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAATTTTACTCata < 1:350796/141‑1 (MQ=255) tttGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAATTTTACTCatat > 1:387827/1‑141 (MQ=255) ttGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAATTTTACTCatata < 1:1086280/141‑1 (MQ=255) tGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCCAGTTTTAAATTCCGTTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAATTTTACTCatatat < 1:860772/141‑1 (MQ=255) aTTGTGCACGTATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAATTTTACTCATATATAATGCtt > 1:471827/1‑141 (MQ=255) tgtgCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAGATCATATCTAAATCACCAAGTTTTATATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAATTTTACTCATATATAATGCTTTa < 2:103463/141‑1 (MQ=255) gtgCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAATTTTACTCATATCTAATGCTTTAc > 1:735628/1‑141 (MQ=255) gtgCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAATTTTACTCATATATAATGCTTTAc < 2:827979/141‑1 (MQ=255) gtgCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAATTTTACTCATATATAATGCTTTAc < 1:675982/141‑1 (MQ=255) tgCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAATTTTACTCATATATAATGCTTTACg > 1:144269/1‑141 (MQ=255) tgCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAATTTTACTCATATATAATGCTTTACg > 1:467519/1‑141 (MQ=255) cACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAATTTTACTCATATATAATGCTTTACGaa > 1:206238/1‑141 (MQ=255) cGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAATTTTACTCATATATAATGCTTTACGAAtt > 2:716780/1‑141 (MQ=255) gATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAATTTTACTCATATATAATGCTTTACGAAtttt < 1:741987/141‑1 (MQ=255) gATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAATTTTACTCATATATAATGCTTTACGAAtttt < 2:448087/141‑1 (MQ=255) gATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAATTTTACTCATATATAATGCTTTACGAAtttt < 2:447674/141‑1 (MQ=255) | GAACACCAGTTGCGACAACATCACGTAACGCATCTTGATATTCAGTAACGATGTTTTTAAAGTAAGGATCTAGCAATAAGTTTTGTAATCCTGGATTATTATCGTAAGCATCTTTGATCTTTTGTAAGAATTGTGCACGGATAATGCAACCTTCTCTCCAAATCATAGCTAAATCACCAAGTTTTAAATTCCATTCATTATCTTCACTTGCTTTACGCATTTGCGCGAAACCTTGTGCATAAGAACAAATTTTACTCATATATAATGCTTTACGAATTTT > CP000730/1627239‑1627518 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |