| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 2,012,683 | 0 | G | A | 5.5% | 339.1 / 6.0 | 110 | H97Y (CAT→TAT) | mutY | A/G‑specific DNA glycosylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (49/54); new base A (4/2); total (53/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.29e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.58e-01 | |||||||||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
TCGAAAAACATTTCCGTCTACAGTTGCTAGTGGTACATTATATGCAATGCTCATTACTGCAGCTTGTGTGTATGGGCCAACACCTTTTAACGCTTTAAATTGATCAGGATCTTTGGGAACTAAGCCTTCATATTTATCATGAACTTCTTTAATCGCCGTATGAAAATTTCGAGCTCTACTATAATATCCTAAGCCTTCCCAATACTTTAACACTTCATCTTCCGAAGCTTGACTCAAAACTTCCACAGTTGGAAATCGTTCAACAAAACGATGATAATAGT > CP000730/2012543‑2012823 | tCGAAAAACATTTCCGTCTACAGTTGCTAGTGGTACATTATATGCAATGCTCATTACTGCAGCTTGTGTGTATGGGCCAACACCTTTTAACGCTTTAAATTGATCAGGATCTTTGGGAACTAAGCCTTCATATTTATCATg > 1:76443/1‑141 (MQ=255) aaaaCATTTCCGTCTACAGTTGCTAGTGGTACATTATATGCAATGCTCATTACTGCAGCTTGTGTGTATGGGCCAACACCTTTTAACGCTTTAAATTGATCAGGATCTTTGGGAACTAAGCCTTCATATTTATCATGAAct < 1:243141/141‑1 (MQ=255) aCATTTCCGTCTACAGTTGCTAGTGGTACATTATATGCAATGCTCATTACTGCAGCTTGTGTGTATGGGCCAACACCTTTTAACGCTTTAAATTGATCAGGATCTTTGGGAACTAAGCCTTCATATTTATCATGAActtct < 2:583886/141‑1 (MQ=255) aTTTCCGTCTACAGTTGCTAGTGGTACATTATATGCAATGCTCATTACTGCAGCTTGTGTGTATGGGCCAACACCTTTTAACGCTTTAAATTGATCAGGATCTTTGGGAACTAAGCCTTCATATTTATCATGAACTTCttt < 2:533140/141‑1 (MQ=255) 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cTTCATATTTATCATGAACTTCTTTAATCGCCGTATGAAAATTTCGAGCTCTACTATAATATCCTAAGCCTTCCCAATACTTTAACACTTCATCTTCCGAAGCTTGACTCAAAACTTCCACAGTTGGAAATCGTTcaacaa < 2:773342/141‑1 (MQ=255) ttCATATTTATCATAAACTTCTTTAATCGCCGTATGAAAATTTCGAGCTCTACTATAATATCCTAAGCCTTCCCAATACTTTAACACTTCATCTTCCGAAGCTTGACTCAAAACTTCCACAGTTGGAAATCGttttgttga < 1:601821/141‑8 (MQ=255) atatTTATCATGAACTTCTTTAATCGCCGTATGAAAATTTCGAGCTCTACTATAATATCCTAAGCCTTCCCAATACTTTAACACTTCATCTTCCGAAGCTTGACTCAAAACTTCCACAGTTGGAAATCGTTCAACAAAACg < 2:107560/141‑1 (MQ=255) tatTTATCATGAACTTCTTTAATCGCCGTATGAAAATTTCGAGCTCTACTATAATATCCTAAGCCTTCCCAATACTTTAACACTTCATCTTCCGAAGCTTGACTCAAAACTTCCACAGTTGGAAATCGTTCAACAAAACga > 2:56574/1‑141 (MQ=255) tatTTATCATGAACTTCTTTAATCGCCGTATGAAAATTTCGAGCTCTACTATAATATCCTAAGCCTTCCCAATACTTTAACACTTCATCTTCCGAAGCTTGACTCAAAACTTCCACAGTTGGAAATCGTTCAACAAAACga > 2:969155/1‑141 (MQ=255) tatTTATCATGAACTTCTTTAATCGCCGTATGAAAATTTCGAGCTCTACTATAATATCCTAAGCCTTCCCAATACTTTAACACTTCATCTTCCGAAGCTTGACTCAAAACTTCCACAGTTGGAAATCGTTCAACAAAACga > 1:625353/1‑141 (MQ=255) tatTTATCATGAACTTCTTTAATCGCCGTATGAAAATTTCGAGCTCTACTATAATATCCTAAGCCTTCCCAATACTTTAACACTTCATCTTCCGAAGCTTGACTCAAAACTTCCACAGTTGGAAATCGTTCAACAAAACga > 1:126742/1‑141 (MQ=255) ttATCAGGAACTTCTTTAATCGCCGTATGAAAATTTCGAGCTCTACTATAATATCCTAAGCCTTCCCAATACTTTAACACTTCATCTTCCGAAGCTTGACTCAAAACTTCCACAGTTGGAAATCGTTCAACAAAACgatga > 2:189067/1‑141 (MQ=255) tCATGAACTTCTTTAATCGCCGTATGAAAATTTCGAGCTCTACTATAATATCCTAAGCCTTCCCAATACTTTAACACTTCATCTTCCGAAGCTTGACTCAAAACTTCCACAGTTGGAAATCGTTCAACAAAACGATGataa > 2:716483/1‑141 (MQ=255) cATGAACTTCTTTAATCGCCGTATGAAAATTTCGAGCTCTACTATAATATCCTAAGCCTTCCCAATACTTTAACACTTCATCTTCCGAAGCTTGACTCAAAACTTCCACAGTTGGAAATCGTTCAACAAAACGATGataat < 2:27412/141‑1 (MQ=255) gAACTTCTTTAATCGCCGTATGAAAATTTCGAGCTCTACTATAATATCCTAAGCCTTCCCAATACTTTAACACTTCATCTTCCGAAGCTTGACTCAAAACTTCCACAGTTGGAAATCGTTCAACAAAACGATGATAATAGt < 2:149760/141‑1 (MQ=255) | TCGAAAAACATTTCCGTCTACAGTTGCTAGTGGTACATTATATGCAATGCTCATTACTGCAGCTTGTGTGTATGGGCCAACACCTTTTAACGCTTTAAATTGATCAGGATCTTTGGGAACTAAGCCTTCATATTTATCATGAACTTCTTTAATCGCCGTATGAAAATTTCGAGCTCTACTATAATATCCTAAGCCTTCCCAATACTTTAACACTTCATCTTCCGAAGCTTGACTCAAAACTTCCACAGTTGGAAATCGTTCAACAAAACGATGATAATAGT > CP000730/2012543‑2012823 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |