| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,016,103 | G→A | 6.2% | Y207Y (TAC→TAT) | rgpD ← | teichoic acid ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,016,103 | 0 | G | A | 6.2% | 294.7 / 5.8 | 96 | Y207Y (TAC→TAT) | rgpD | teichoic acid ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (50/40); new base A (4/2); total (54/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.93e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.51e-01 | |||||||||||
TTTTTCCAATCTAAATCAAAGTTTTCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAATTGTGGTGTTAAATAGTCAATAACATGATTTA > CP000730/2015963‑2016239 | gcacgctcaTCTAAATCAAAGTTTTCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATg > 2:190775/9‑141 (MQ=255) ttttCCAATCTAAATCAAAGTTTTCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGt < 1:904254/141‑1 (MQ=255) ttttCCAATCTAAATCAAAGTTTTCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGt < 1:415448/141‑1 (MQ=255) gttCCAAACGAAAGCAAAGTTTTCAATTTCTTCTTTTGTGATTAGACTTAAGCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTATTAAAAAAACATGTGAAAACAAAGCTATGTa > 2:976784/2‑141 (MQ=255) tCCAATCTAAATCAAAGTTTTCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGt > 2:467897/1‑141 (MQ=255) tCCAATCTAAATCAAAGTTTTCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAAACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATATAGt < 2:834174/141‑1 (MQ=255) cttttCTATATCAAAGTTTTCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGtt > 2:331506/5‑141 (MQ=255) ccAATCTAAATCAAAGTTTTCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGtt > 2:402094/1‑141 (MQ=255) cAATCTAAATCAAAGTTTTCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTa < 2:317266/141‑1 (MQ=255) ttttttCAAAGTTTTGAATTTCTTCTATTTAGTTTACACTTACTCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGTTTTATTTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACAAAGCTATGTAGTTACTCa > 2:53872/6‑141 (MQ=255) aaaTCAAAGTTTTCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCTCGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACt < 2:578182/141‑1 (MQ=255) aaaTCAAAGTTTTCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACt < 1:638347/141‑1 (MQ=255) cAAATTTTTCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTtgtg < 2:541037/141‑1 (MQ=255) cAAAGTTTTCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTtgtg > 2:301943/1‑141 (MQ=255) cAAAGTTTTCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTtgtg < 2:1045798/141‑1 (MQ=255) aGTTTTCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGaaa > 2:543902/1‑141 (MQ=255) aGTTTTCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGaaa < 2:401074/141‑1 (MQ=255) gTTTTCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAAt > 1:747676/1‑141 (MQ=255) gTTTTCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATAACGTTCATGTTCTTTAACAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAAt < 2:60716/141‑1 (MQ=255) ttttCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAAtt > 2:466241/1‑141 (MQ=255) ttttCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAAtt > 2:175416/1‑141 (MQ=255) tttCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAAttt < 1:774565/141‑1 (MQ=255) ttCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAAtttt < 2:778673/141‑1 (MQ=255) tCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTa < 1:616066/141‑1 (MQ=255) tCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTa > 1:1054354/1‑141 (MQ=255) tCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTa > 2:609535/1‑141 (MQ=255) tCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTa > 1:934856/1‑141 (MQ=255) tCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTa > 1:741948/1‑141 (MQ=255) cAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTAt > 2:7202/1‑141 (MQ=255) cAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTAt < 1:252576/141‑1 (MQ=255) aaTTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATc > 1:437911/1‑141 (MQ=255) tcttctTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAata > 2:900852/1‑141 (MQ=255) tttttttTATTTTAGCCTTAATCGTTCACGTTCATGTTCTTTAAAAGAGGGAATAACTTTTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTTTTCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATatc < 2:331546/138‑1 (MQ=255) ttcttTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATatc > 2:480367/1‑141 (MQ=255) tttGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATAtcatca > 2:736329/1‑141 (MQ=255) tttAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAAtt < 1:463638/141‑1 (MQ=255) tttAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAAtt < 1:463590/141‑1 (MQ=255) aGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGac > 1:280873/1‑141 (MQ=255) aCTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGacac > 1:308859/1‑141 (MQ=255) aCTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGacac < 2:570899/141‑1 (MQ=255) aaTCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATc > 2:836586/1‑141 (MQ=255) gATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTa < 1:2020/141‑1 (MQ=255) aTCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTGAATTGACCATTTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTaa > 1:702864/1‑141 (MQ=255) cACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAat < 1:87346/141‑1 (MQ=255) cACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAat < 1:985089/141‑1 (MQ=255) cACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAat < 2:264123/141‑1 (MQ=255) cACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAat < 2:217857/141‑1 (MQ=255) cACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAat > 2:217408/1‑141 (MQ=255) cGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAatta > 1:1075915/1‑141 (MQ=255) ttCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAat > 1:95922/1‑141 (MQ=255) cTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAatat > 1:576861/1‑141 (MQ=255) aaaaGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATc < 1:84108/141‑1 (MQ=255) aaGATGGAATATCTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCAt < 2:431546/141‑1 (MQ=255) aaGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCAt > 1:624337/1‑141 (MQ=255) gATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCAttt > 1:937166/1‑141 (MQ=255) gATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAAAGATGCTATATAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCAttt > 1:565856/1‑141 (MQ=255) tGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGt < 1:981561/141‑1 (MQ=255) ggAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGtt > 1:121504/1‑141 (MQ=255) ttGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATATAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAAt > 1:27907/1‑141 (MQ=255) tGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATc < 1:1021718/141‑1 (MQ=255) gTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTCTCAATCTCCTAACCAATAGACACACTCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCg > 1:99180/1‑141 (MQ=255) gTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCg > 2:409707/1‑141 (MQ=255) tttAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTa < 2:1005021/104‑1 (MQ=255) tttAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTa > 1:1005021/1‑104 (MQ=255) tttAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGc > 2:1041286/1‑141 (MQ=255) tttAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGc > 2:285935/1‑141 (MQ=255) tttAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGc < 2:987308/141‑1 (MQ=255) aaGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACg > 2:991219/1‑141 (MQ=255) aCCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCa < 2:1029522/141‑1 (MQ=255) aCCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCa < 1:107978/141‑1 (MQ=255) aCCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCa < 1:900852/141‑1 (MQ=255) ttCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATaaa > 2:876845/1‑141 (MQ=255) tCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAAt < 2:904723/141‑1 (MQ=255) cATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAATtg < 1:1007740/141‑1 (MQ=255) cATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAATtg < 1:282049/141‑1 (MQ=255) cTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAATTgtggt > 2:793282/1‑141 (MQ=255) ttAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAATTgtggtg < 2:521925/141‑1 (MQ=255) tGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAATTGTGGTGTTaaa > 2:406026/1‑141 (MQ=255) tGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGAGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAATTGTGGTGTTaaa > 1:573267/1‑141 (MQ=255) gACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAATTGTGGTGTTAAAt < 1:335706/141‑1 (MQ=255) gACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAATTGTGGTGTTAAAt > 1:586902/1‑141 (MQ=255) gACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATAGCACGTTCCATAAATTGTGGTGTTAAAt > 2:874678/1‑141 (MQ=255) cATGTGAAAACCATGCTATATAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTTTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAATTGTGGTGTTCAATAGt > 2:1038473/1‑141 (MQ=255) cATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAATTGTGGTGTTAAATAGt > 1:990851/1‑141 (MQ=255) tgtgAAAACCAAGCTATATAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAAt > 2:35717/1‑123 (MQ=255) tgtgAAAACCAAGCTATATAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAAt < 1:35717/123‑1 (MQ=255) gtgAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAATTGTGGTGTTAAATAGTCaa > 1:999280/1‑141 (MQ=255) gtgAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAATTGTGGTGTTAAATAGTCaa < 2:299236/141‑1 (MQ=255) tgAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAATTGTGGTGTTAAATAGTCAAt < 2:265019/141‑1 (MQ=255) aaaCCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAATTGTGGTGTTAAATAGTCAATAAc > 1:479232/1‑141 (MQ=255) aCCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAATTGTGGTGTTAAATAGTCAATAACAt > 2:645965/1‑141 (MQ=255) ccAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAATTGTGGTGTTAAATAGTCAATAACATg < 1:649627/141‑1 (MQ=255) ccAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAACTGTGGTGTTAAATAGTCAATAACATg > 2:860944/1‑141 (MQ=255) aaGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAATTGTGGTGTTAAATAGTCAATAACATGAt < 2:1006745/141‑1 (MQ=255) aaGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAATTGTGGTGTTAAATAGTCAATAACATGAt > 2:699262/1‑141 (MQ=255) gCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAATTGTGGTGTTAAATAGTCAATAACATGAttt > 2:696538/1‑141 (MQ=255) cTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCGCGTTCCATAAATTGTGGTGTTAAATAGTAAATAACATGATTTa > 1:854453/1‑141 (MQ=255) | TTTTTCCAATCTAAATCAAAGTTTTCAATTTCTTCTTTTGAGTTTAGACTTAATCGATCACGTTCATGTTCTTTAAAAGATGGAATAACTTGTTTAAGTGACCCTTCCATTCTTAATTGACCATGTGAAAACCAAGCTATGTAGTTACTCACTTGTGAAATTTTATCAATATCATCACCAATTGACACAATCGTTAAATTATTTTCAATATAATCATTTGTTAATTCAATCGCACGTTCCATAAATTGTGGTGTTAAATAGTCAATAACATGATTTA > CP000730/2015963‑2016239 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |