| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,027,805 | C→A | 5.2% | V48F (GTT→TTT) | vraS ← | sensor histidine kinase VraS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,027,805 | 0 | C | A | 5.2% | 288.4 / 3.8 | 86 | V48F (GTT→TTT) | vraS | sensor histidine kinase VraS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/45); new base A (3/2); total (39/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.55e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.67e-01 | |||||||||||
ATTAATGCCAACTGTTTCGCCTTCCATTGAACGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCTATATACTAAGATGAGCATTGAACCAATTGTTCTAATGTAGTGGTTCA > CP000730/2027665‑2027945 | aTTAATGCCAACTGTTTCGCCTTCCATTGAACGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAAc > 2:195995/1‑141 (MQ=255) ttAATGCCAACTGTTTCGCCTTCCATTGAACGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACt > 2:255100/1‑141 (MQ=255) ttAATGCCAACTGTTTCGCCTTCCATTGAACGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATATAAAAATAAAAAAACt > 2:949887/1‑141 (MQ=255) gCCAACTGTTTCGCCTTCCATTGAACGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTAt > 2:779385/1‑141 (MQ=255) ccAACTGTTTCGCCTTCCATTGATCGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAAATGGTAtt < 1:246224/141‑1 (MQ=255) ccAACTGTTTCGCCTTCCATTGAACGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTAtt < 1:191874/141‑1 (MQ=255) ccAACTGTTTCGCCTTCCATTGAACGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTAtt < 2:1049835/141‑1 (MQ=255) aaCTGTTTCGCCTTCCATTGAACGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTcc > 2:671930/1‑141 (MQ=255) aaCTGTTTCGCCTTCCATTGAACGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTcc > 1:697763/1‑141 (MQ=255) aCTGTTTCGCCTTCCATTGAACGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCg < 1:594073/141‑1 (MQ=255) aCTGTTTCGCCTTCCATTGAACGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAAGCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCg < 1:827573/141‑1 (MQ=255) gCCTTCCATTGAACGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACACTAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATAtttt > 2:315490/1‑140 (MQ=255) ccTTCCATTGAACGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTtgt > 2:531283/1‑141 (MQ=255) tCCATTGAACTCTCTATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGta < 2:209648/141‑1 (MQ=255) tCCATTGAACGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGta < 2:4376/141‑1 (MQ=255) ccATTGAACGCTCGATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATACTATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGtat < 2:326443/141‑1 (MQ=255) ccATTGAACGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGtat > 2:105543/1‑141 (MQ=255) ccATTGAACGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGtat > 2:792338/1‑141 (MQ=255) cATTGAACGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGtata < 1:579718/141‑1 (MQ=255) cATTGAACGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGtata < 1:830184/141‑1 (MQ=255) cATTGAACGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCACTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGtata < 1:1007105/141‑1 (MQ=255) ttGAACGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATACTACACAATAATATGATGATGCGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATaaa > 2:1039030/1‑141 (MQ=255) ttGAACGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATaaa > 2:393225/1‑141 (MQ=255) tGAACGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATaaaa > 1:529203/1‑141 (MQ=255) aaCGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACa < 1:371505/141‑1 (MQ=255) aCGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACAt > 2:543378/1‑141 (MQ=255) cTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAACATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATAcc > 1:852911/1‑141 (MQ=255) cTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATAcc < 2:1047753/141‑1 (MQ=255) tCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATATAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCt < 2:477202/141‑1 (MQ=255) aaTTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTg < 1:1013884/141‑1 (MQ=255) tttGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGaa > 1:733353/1‑141 (MQ=255) tttGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACACACCTTGaa > 2:341560/1‑141 (MQ=255) tttGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAAATGGTATTCAGAATATTTATGTATACAACATACCTTGaa > 2:534580/1‑141 (MQ=255) ttGCGTCTTAATCCAATCATTTTGATGATTGCTTTTGTAGGCGAGTACCGAACTAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAAAAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGaaa < 2:479329/141‑1 (MQ=255) gCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAAt < 1:16972/141‑1 (MQ=255) gCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAAt > 1:774572/1‑141 (MQ=255) gCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTCAAAAt > 2:17602/1‑141 (MQ=255) cTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAgat > 2:727060/1‑141 (MQ=255) cTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTAAAAAAAAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAgat < 2:1087403/141‑1 (MQ=255) aTCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTAc > 1:810013/1‑141 (MQ=255) aTCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTAc < 1:949887/141‑1 (MQ=255) aTCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTAc < 2:659531/141‑1 (MQ=255) tttGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACaaaaa > 2:6873/1‑141 (MQ=255) tttGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACaaaaa < 2:526986/141‑1 (MQ=255) gCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACtt > 1:94763/1‑141 (MQ=255) gCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACtt > 2:417226/1‑141 (MQ=255) cTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACttt < 1:1073291/141‑1 (MQ=255) cTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACttt > 1:600522/1‑141 (MQ=255) cTGATTGATTATGTAAGCGAGTACAGAACCAACAATAATACAAAATAATATGATGATAAAATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACttt < 2:1013119/141‑1 (MQ=255) tgattgatTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAAATGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTa > 2:360951/1‑141 (MQ=255) ttGTATGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAGACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGaat > 2:680311/1‑140 (MQ=255) gTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAg > 1:979872/1‑141 (MQ=255) gAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGc < 1:259728/141‑1 (MQ=255) aGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCa < 1:619725/141‑1 (MQ=255) aGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCa < 2:970011/141‑1 (MQ=255) aaCCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCa < 2:47209/141‑1 (MQ=255) aaCCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCa < 2:323615/141‑1 (MQ=255) aaCCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCa > 2:728822/1‑141 (MQ=255) ccAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATg < 1:564296/141‑1 (MQ=255) aacaaTAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCt < 1:375299/141‑1 (MQ=255) acaaTAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCta < 1:1003028/141‑1 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2:695882/141‑1 (MQ=255) acaATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCTATATACTAAGa > 1:804620/1‑141 (MQ=255) aataatATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCTATATACTAAGATg < 2:628423/141‑1 (MQ=255) atatGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCTATATACTAAGATGAGCa < 1:1016235/141‑1 (MQ=255) atatGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAAATGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCTATATACTAAGATGAGCa > 1:925236/1‑141 (MQ=255) tatGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCTATATACTAAGATGAGCAt < 1:778807/141‑1 (MQ=255) atgatgatgAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCTATATACTAAGATGAGCAtt < 2:106298/141‑1 (MQ=255) atgatgaGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCTATATACTAAGATGAGCATTGaa < 2:331156/141‑1 (MQ=255) tgaGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCTATATACTAAGATGAGCATTGAACCaa < 2:228284/141‑1 (MQ=255) gaTTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCTATATACTAAGATGAGCATTGAACCAATTg > 1:350478/1‑141 (MQ=255) agttATAAATAAAATAACTGGTGTTGCGAATATTTTTTTATTTAACATACCTTGAAAATGGCTGATATTTACAAAAACTTTACCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCAGGCTGTATACTAAGATGAGCATTGAACCAATTGt > 2:270487/3‑141 (MQ=255) aTTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCTATATACTAAGATGAGCATTGAACCAATTGt < 2:774572/141‑1 (MQ=255) ttAAAAATAAAAAAAATGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCTATATACTAAGATGAGCATTGAACCAATTGTTc < 1:293082/141‑1 (MQ=255) aaaataaaaaAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCTATATACTAAGATGAGCATTGAACCAATTGTTCTaa < 2:478414/141‑1 (MQ=255) aaaataaaaaAACTGGAAGTCCGAATATATGAGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATAAAATAAAAAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCTATATACTAAGATGAGCATTGAACCAATTGTTCTaa < 2:104748/141‑1 (MQ=255) taaaaaAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCTATATACTAAGATGAGCATTGAACCAATTGTTCTAATGTa < 1:97554/141‑1 (MQ=255) aaaaaaaCTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCTATATACTAAGATGAGCATTGAACCAATTGTTCTAATGTAg > 1:412033/1‑141 (MQ=255) aaaaaaaCTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCTATATACTAAGATGAGCATTGAACCAATTGTTCTAATGTAg < 2:852911/141‑1 (MQ=255) aaaaaaaCTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCTATATACTAAGATGAGCATTGAACCAATTGTTCTAATGTAg > 2:119196/1‑141 (MQ=255) aaaaCTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCTATATACTAAGATGAGCATTGAACCAATTGTTCTAATGTAGTgg < 2:153632/141‑1 (MQ=255) aaaCTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCTATATACTAAGATGAGCATTGAACCAATTGTTCTAATGTAGTGGt < 1:86138/141‑1 (MQ=255) cTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATAGTTATAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCTATATACTAAGATGAGCATTGAACCAATTGTTCTAATGTAGTGGTTCa < 1:972567/141‑1 (MQ=255) | ATTAATGCCAACTGTTTCGCCTTCCATTGAACGCTCAATTTGCGTCTTAATCCAATCATTTTGCTGATTGATTTTGTAAGCGAGTACCGAACCAACAATAATACACAATAATATGATGATGAGATTTAAAAATAAAAAAACTGGTATTCCGAATATTTGTGTATAAAACATACCTTGAAAATAGATGATATTTACAAAAACTTTATCGATGAACAGAAATGCAGCTAGCATGCTATATACTAAGATGAGCATTGAACCAATTGTTCTAATGTAGTGGTTCA > CP000730/2027665‑2027945 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |