| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 2,110,877 | 0 | G | A | 7.3% | 330.4 / 10.8 | 109 | intergenic (‑123/+109) | USA300HOU_1973/USA300HOU_1974 | hypothetical protein/hypothetical bacteriophage protein |
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Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
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catcacatAGTGATGCGCCTCTTGTTCATGCGTCGTATTAGCATTTAATAACTTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGTTTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACtt > 1:968201/1‑141 (MQ=255) atcacatAGTGATGCGCCTCTTGTTCATGCGTCGTATTAGCATTTAATAACTTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGATTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACttt > 2:864270/1‑141 (MQ=255) tcacatAGTGATGCGCCTCTTGTTCATGCGTCGTATTAGCATTTAATAACTTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGTTTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACTTTg < 2:136485/141‑1 (MQ=255) tcacatAGTAATGCGCCTCTTGTTCATGCGTCGTATTAGCATTTAATAACCTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGTTTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACTTTg > 1:406045/1‑141 (MQ=255) cacatAGTGATGCGCCTCTTGTTCATGCGTCGTATTAGCATTTAATAACTTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGTTTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACTTTGc < 2:387104/141‑1 (MQ=255) acatAGTGATGCGCCTCTTGTTCATGCGTCGTATTAGCATTTAATAACTTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGTTTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACTTTGCt < 1:144563/141‑1 (MQ=255) atAGTGATGCGCCTCTTGTTCATGCGTCGTATTAGCATTTAATAACTTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGTTTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACTTTGCTaa > 1:727599/1‑141 (MQ=255) tAGTGATGCGCCTCTTGTTCATGCGTCGTATTAGCATTTAATAACTTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGTTTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACTTTGCTAAc < 2:56048/141‑1 (MQ=255) aGTGATGCGCCTCTTGTTCATGCGTCGTATTAGCATTTAATAACTTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGTTTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACTTTGCTAACt < 1:671672/141‑1 (MQ=255) tGATGCGCCTCTTGTTCATGCGTCGTATTAGCATTTAATAACTTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGTTTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACTTTGCTAACTTa > 1:89774/1‑141 (MQ=255) gATGCGCCTCTTGTTCATGCGTCGTATTAGCATTTAATAACTTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGTTTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACTTTGCTAACTTAt > 1:25875/1‑141 (MQ=255) | TTCGTCTTTAGTCATCATAATGTTTCACCTTATATAACTTAAGTAGTATCAAGACGCATCTATACTTGATGTGTAGTAATGTATTTACTATTAGTTTGAACATGTTCATACCTCATAAATAAAAAGACACATCACATAGTGATGCGCCTCTTGTTCATGCGTCGTATTAGCATTTAATAACTTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGTTTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACTTTGCTAACTTAT > CP000730/2110737‑2111017 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |