| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,257,029 | C→A | 5.4% | intergenic (‑118/+82) | dps ← / ← yuxK | Dps family stress protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,257,029 | 0 | C | A | 5.4% | 324.1 / 4.8 | 101 | intergenic (‑118/+82) | dps/yuxK | Dps family stress protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (58/37); new base A (3/3); total (61/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.41e-01 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
AACATCTTGTTGATTACTCATATTTAATACACTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACTTTCGCATTATCATCTAAAAAGAACGATTTTTCATAATCAT > CP000730/2256891‑2257169 | aacaTCTTGTTGATTACTCATATTTAATACACTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCg > 1:675724/1‑141 (MQ=255) tgttgATTACTCATATTTAATACACTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTaa < 2:1082944/137‑1 (MQ=255) tgttgATTACTCATATTTAATACACTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTaa > 1:1082944/1‑137 (MQ=255) ttgATTACTCATATTTAATACACTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTTTAATCTAACCGCAAAGTGtt > 2:900244/1‑141 (MQ=255) ttgATGAATCATATTTAATACACTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTTTAAGCTAACAGTAACGTGtt > 2:613571/1‑141 (MQ=255) gATTACTCATATTTAATACACTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTTTTTTTTATTATTATTTTAATCTAAACTTAAAGTGttat > 2:335258/1‑139 (MQ=255) gATTACTCATATTTAATACACTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTcc > 1:577830/1‑141 (MQ=255) ttACTCATATTTAATACACTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGc < 2:970400/141‑1 (MQ=255) aCTCATATTTAATACACACCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATATAACCGTAAAGTGTTCCGCTa > 2:702524/1‑141 (MQ=255) cATATTTAATACACTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATCTTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTACTCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTAttt > 1:448559/1‑141 (MQ=255) atTTAATACACTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTaaa > 2:911678/1‑141 (MQ=255) ttAATACACTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATg < 1:228361/141‑1 (MQ=255) aTACACTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCt < 2:944760/141‑1 (MQ=255) aTACACTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCt > 1:305833/1‑141 (MQ=255) aTACACTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCt > 1:136298/1‑141 (MQ=255) aTACACTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTAATCTAATCTAACCGCAAAGTGTTCCGTTATTTAAATGCCt > 2:161257/1‑141 (MQ=255) acacTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATGATTCTAATCTGTAAAGTGTTTTTACTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAAATGTAAGGTGTTCCGCTTTTTAAATGTCTaa > 1:459801/1‑141 (MQ=255) cacTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTaaa < 1:163645/141‑1 (MQ=255) cacTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTaaa > 1:291662/1‑141 (MQ=255) cacTACTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTaaa < 1:1042471/141‑1 (MQ=255) tCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAAttt < 1:294855/141‑1 (MQ=255) ccTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTTTAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAAtttt < 2:58652/141‑1 (MQ=255) ttAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTaa > 2:7207/1‑141 (MQ=255) ttAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTaa < 2:830792/141‑1 (MQ=255) ttGTCTACGTCTTGCTTGTTTATCTTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATtcatc > 1:166878/1‑141 (MQ=255) ttGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATtcatc > 1:867880/1‑141 (MQ=255) gTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTcatcat < 1:635509/141‑1 (MQ=255) gTCTACGTCTTGCTCGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGTTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTcatcat > 2:85910/1‑141 (MQ=255) cTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTTTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCt < 1:68669/141‑1 (MQ=255) cTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCctct > 1:64045/1‑141 (MQ=255) aCGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTaa < 1:331923/141‑1 (MQ=255) cGTCTTGCTTGTTTCTATTCATTATTATATTATAATAATTTTTATCTGTTCAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTTTAATTATGCTCAACTACCCGTGTAGCGTCCCGCCATTTATGTGCCTTAATATTAATTCctcatcctat < 2:584195/141‑5 (MQ=255) tcatgcatgTTTATATAAATTATCATATAATAATACTTTTAATATGTAAAGTGTTTTTGCTATCTTTTTTATAATTATTATAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTACATGACTAATTTTTAATTAATCATCTCatat > 2:267862/4‑141 (MQ=255) cttgcttgTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAatata < 1:127337/141‑1 (MQ=255) cttgcttgTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTGTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAatata < 1:154708/141‑1 (MQ=255) ttgcttgTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAatatat < 1:505867/141‑1 (MQ=255) tgcttgTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATc > 2:265164/1‑141 (MQ=255) cttgTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCa < 1:96889/141‑1 (MQ=255) ttgTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCAt > 2:619224/1‑141 (MQ=255) ttgTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCAt < 2:841619/141‑1 (MQ=255) gTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTa > 1:1050241/1‑141 (MQ=255) ttATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATc > 1:734242/1‑141 (MQ=255) ttATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATc > 2:589955/1‑141 (MQ=255) ttaattaTTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTa > 1:394137/1‑141 (MQ=255) taattaTTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAg > 1:446140/1‑141 (MQ=255) aattaTTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTTTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGc > 2:165202/1‑141 (MQ=255) aattaTTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGc > 1:225867/1‑141 (MQ=255) aattaTTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGc < 1:986818/141‑1 (MQ=255) aattaTTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGc < 1:494549/141‑1 (MQ=255) aattaTTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGc < 1:557265/141‑1 (MQ=255) attattATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTTTTCTTTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCTATTATTAATTAGCa > 2:780684/1‑141 (MQ=255) tattatattaTAATGATTCTAATCTGTAAAGTGTTTTTACTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAAATGTAAGGTGTTCCGCTTTTTAAATGTCTAAATTTTAATTCATCATCTAGTATATCCATTATCAATTAGCAAg < 2:389920/141‑1 (MQ=255) tattatattaTAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAg > 2:696338/1‑141 (MQ=255) tattatattaTAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAg < 2:119585/141‑1 (MQ=255) attatattatAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGt > 1:216415/1‑141 (MQ=255) ttatattataATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTa < 1:916862/141‑1 (MQ=255) tatattataATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTAt > 1:174164/1‑141 (MQ=255) atattataATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATg > 2:820838/1‑141 (MQ=255) atattataATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATg > 1:224975/1‑141 (MQ=255) tattataATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGt < 2:607169/141‑1 (MQ=255) attataATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGtt > 1:1065190/1‑141 (MQ=255) taataaTTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCT‑ACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTatc < 1:1060892/141‑1 (MQ=255) aatTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTatcaat > 1:663206/1‑141 (MQ=255) atTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTACATAACCTAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTatcaatc > 1:565492/1‑141 (MQ=255) tttAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAg < 2:646316/141‑1 (MQ=255) tttAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAg < 1:6303/141‑1 (MQ=255) tAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTa > 1:276561/1‑141 (MQ=255) aaTCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTaa > 1:578636/1‑141 (MQ=255) aaTCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTaa > 1:159007/1‑141 (MQ=255) aaTCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTaa > 1:408088/1‑141 (MQ=255) aaTCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTaa > 2:442020/1‑141 (MQ=255) ttCTTTACAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTGATCTAACGGTAAAGTGTTTTGCTTTTTAATTGCCTAATTTTTATTTCTTCATCTAATATATCCATTATCAATTATCAATTTTGTTTTATCTATCAGTatt > 2:481743/2‑139 (MQ=255) tCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGt > 1:179697/1‑141 (MQ=255) cTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGtt > 1:746549/1‑141 (MQ=255) tGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGttt > 2:623132/1‑141 (MQ=255) gTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTTTAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCATTTAGTAAGtttt > 2:465711/1‑141 (MQ=255) gTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGtttt > 2:496258/1‑141 (MQ=255) aaaGTGTTTTTACTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAAATGTAAGGTGTTCCGCTTTTTAAATGTCTAAATTTTAATTCATCATCTAGTATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTAc < 2:459801/141‑1 (MQ=255) gtgtTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACttt < 2:276561/141‑1 (MQ=255) gtgtTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTATAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACttt > 1:303182/1‑141 (MQ=255) tttttGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACTTTCGc < 1:6214/141‑1 (MQ=255) tttttGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACTTTCGc < 2:898146/141‑1 (MQ=255) ttttGCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTTTTTATTTGTAATTTTTACTTTCGCa > 2:824989/1‑141 (MQ=255) tttGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACTTTCGCAt > 1:63358/1‑141 (MQ=255) tttGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACTTTCGCAt > 1:352787/1‑141 (MQ=255) tttGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACTTTCGCAt > 1:279132/1‑141 (MQ=255) ttGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTACTCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACTTTCGCAtt < 2:1053417/141‑1 (MQ=255) gCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACTTTCGCATTat < 2:62217/141‑1 (MQ=255) ctctctTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACTTTCGCATTatc < 2:214786/141‑1 (MQ=255) tctctTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACTTTCGCATTatca > 1:400665/1‑141 (MQ=255) ctTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACTTTCGCATTATCATCt > 1:34000/1‑141 (MQ=255) ttttttATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTATTTCATCATTTAATATATCTTTTTTCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACTTTCGCATTATCATCTa > 2:329758/1‑141 (MQ=255) tttATAATTATTCTAATCTAAATGTAAGGTGTTCCGCTTTTTAAATGTCTAAATTTTAATTCATCATCTAGTATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACTTTCGCATTATCATCTaaaa > 2:482747/1‑141 (MQ=255) ttATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACTTTCGCATTATCATCTaaaaa < 2:129163/141‑1 (MQ=255) tataATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACTTTCGCATTATCATCTAAAAAg > 1:577664/1‑141 (MQ=255) aaTTATTCTAATCTAAATGTAAGGTGTTCCGCTTTTTAAATGTCTAAATTTTAATTCATCATCTAGTATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACTTTCGCATTATCATCTAAAAAGAAc < 2:287512/141‑1 (MQ=255) ttCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACTTTCGCATTATCATCTAAAAAGAACGAttt < 1:265164/141‑1 (MQ=255) aatctaaCCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACTTTCGCATTATCATCTAAAAAGAACGATTTTTCa > 2:77411/1‑141 (MQ=255) atctaaCCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACTTTCGCATTATCATCTAAAAAGAACGATTTTTCAt < 1:268757/141‑1 (MQ=255) ccGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACTTTCGCATTATCATCTAAAAAGAACGATTTTTCATAATCAt < 1:665722/141‑1 (MQ=255) | AACATCTTGTTGATTACTCATATTTAATACACTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACTTTCGCATTATCATCTAAAAAGAACGATTTTTCATAATCAT > CP000730/2256891‑2257169 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |