Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP000730 | 2,257,055 | 0 | C | T | 7.0% | 295.2 / 7.9 | 101 | intergenic (‑144/+56) | dps/yuxK | Dps family stress protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (53/39); new base T (3/4); total (58/43) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.64e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.12e-01 |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
ATACACTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACTTTCGCATTATCATCTAAAAAGAACGATTTTTCATAATCATTTGGTTGGTGCCATGTTGTTTTCCAC > CP000730/2256917‑2257195 | aTACACTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCt > 1:136298/1‑141 (MQ=255) aTACACTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCt < 2:944760/141‑1 (MQ=255) aTACACTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCt > 1:305833/1‑141 (MQ=255) aTACACTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTAATCTAATCTAACCGCAAAGTGTTCCGTTATTTAAATGCCt > 2:161257/1‑141 (MQ=255) 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ATACACTCCTTAAAATTGTCTACGTCTTGCTTGTTTATATTAATTATTATATTATAATAATTTTAATCTGTAAAGTGTTTTTGCTCTCTTTTTTATAATTATTCTAATCTAACCGTAAAGTGTTCCGCTATTTAAATGCCTAAATTTTAATTCATCATCTAATATATCCATTATCAATTAGCAAGTATGTTTTATCAATCAGTAAGTTTTACTTTCGCATTATCATCTAAAAAGAACGATTTTTCATAATCATTTGGTTGGTGCCATGTTGTTTTCCAC > CP000730/2256917‑2257195 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |