| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,330,500 | A→G | 5.4% | F161F (TTT→TTC) | lacD ← | tagatose‑bisphosphate aldolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,330,500 | 0 | A | G | 5.4% | 386.6 / 9.0 | 129 | F161F (TTT→TTC) | lacD | tagatose‑bisphosphate aldolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (66/56); new base G (5/2); total (71/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
ACTTCAACTTTCAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTGCGCCTTGTTCTTTTAAACG > CP000730/2330360‑2330640 | aCTTCAACTTTCAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTaaa > 1:257998/1‑141 (MQ=255)aCTTCAACTTTCAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTaaa > 1:806180/1‑141 (MQ=255)aCTTCAACTTTCAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTaaa < 1:779746/141‑1 (MQ=255) ttCAACTTTCAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTaaaaa < 2:611427/141‑1 (MQ=255) ttCAACTTTCAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTAAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTaaaaa < 1:866577/141‑1 (MQ=255) aaCTTTCAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGaa > 1:831276/1‑141 (MQ=255) cTTTCAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATg > 1:907051/1‑141 (MQ=255) cTTTCAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATg > 2:137953/1‑141 (MQ=255) tttCAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATgg < 1:152753/141‑1 (MQ=255) tttCAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATgg < 1:239789/141‑1 (MQ=255) ttCAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGa < 1:540535/141‑1 (MQ=255) tCAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATAATAATAAAAAGAATGGaa < 2:589149/141‑1 (MQ=255) cAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAat > 1:607818/1‑141 (MQ=255) cAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAat > 1:473470/1‑141 (MQ=255) aCATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATAtct > 2:185065/1‑141 (MQ=255) cGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCaa < 2:240028/141‑1 (MQ=255) gTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAac < 2:886922/141‑1 (MQ=255) aGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACAtt > 1:662952/1‑141 (MQ=255) gCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAAGCTTTCTCGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTc > 1:934283/1‑141 (MQ=255) cGTGTNTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCt < 1:367980/141‑1 (MQ=255) gTGGTTCTGAGAATATTTTCAGGGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTg < 1:9385/141‑1 (MQ=255) gTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAGAAGAAAGGAATGTCTTCTGCAACACATTCTg > 1:47317/1‑141 (MQ=255) gTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAGAAGAAAGGAATGTCTTCTGCAACACATTCTg > 1:271272/1‑141 (MQ=255) tGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGa > 2:970694/1‑141 (MQ=255) gTTCTGAGAATACTTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAAc < 2:270607/141‑1 (MQ=255) tCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCg < 1:55371/141‑1 (MQ=255) aataatTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCtt < 2:421489/141‑1 (MQ=255) atTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCaa > 1:169423/1‑141 (MQ=255) ttCATTGCTTCGATAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTTTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGCACCGATTCTTTCAATg > 2:21238/1‑141 (MQ=255) cATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTa < 1:712056/141‑1 (MQ=255) cATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTa < 2:760263/141‑1 (MQ=255) tGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGc < 2:868149/141‑1 (MQ=255) gCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTTCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGct > 2:1061960/1‑141 (MQ=255) cTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATNTATGctt > 2:814271/1‑141 (MQ=255) gTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGctttctt > 2:847239/1‑141 (MQ=255) tAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCtttt > 1:1021987/1‑141 (MQ=255) aaCCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCGGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTg < 2:1054248/141‑1 (MQ=255) aCCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGa > 2:908189/1‑141 (MQ=255) ccTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGaa > 1:247075/1‑141 (MQ=255) ccTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGaa > 2:312154/1‑141 (MQ=255) cTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTa < 1:1023629/126‑1 (MQ=255) cTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTa > 2:1023629/1‑126 (MQ=255) ttCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGt < 1:72044/141‑1 (MQ=255) cTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTa < 2:243007/141‑1 (MQ=255) cTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTa < 2:560865/141‑1 (MQ=255) tAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTaa < 2:415723/141‑1 (MQ=255) tAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTaa > 2:177949/1‑141 (MQ=255) ggCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAAtt > 2:316996/1‑141 (MQ=255) gCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAAttt > 1:929779/1‑141 (MQ=255) tAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATttctt < 2:526180/141‑1 (MQ=255) aaCTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTCAAACGAATGGAATTTCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATttcttc < 1:214676/141‑1 (MQ=255) aCTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAGAAGAAAGGAATGTCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCa > 1:913347/1‑141 (MQ=255) aCTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAGAAGAAAGGAATGTCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCa > 1:31098/1‑141 (MQ=255) cTTTCGCGAATTCAACACTACCGTCATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACATATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAg > 1:169534/1‑141 (MQ=255) tttGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGca > 1:301846/1‑141 (MQ=255) gCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGcatca < 2:907051/141‑1 (MQ=255) gCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGcatca > 2:549642/1‑141 (MQ=255) cGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGcatcat < 1:335154/141‑1 (MQ=255) gAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATAATTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCatcatc < 2:350912/141‑1 (MQ=255) ttCAACACTACCGTTATCAGGAGTGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAAc > 1:279846/1‑141 (MQ=255) ttCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAAc < 2:649146/141‑1 (MQ=255) aaaCACAACAGTTAGCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAAGACTTCTAAAAAGGATGGAATATCTTCTGCAACACAGTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTGCTTTTGAATGTTAATTTCGTCGGCATCATCAAcat < 1:88398/140‑1 (MQ=255) acacTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAAcatca < 1:897586/141‑1 (MQ=255) acacTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAAcatca > 2:762839/1‑141 (MQ=255) cacTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAGAAGAAAGGAATGTCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAAcatcat > 2:817402/1‑141 (MQ=255) acTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTATTAGGGCTAAAATGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATa > 2:322606/1‑141 (MQ=255) acTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATa < 2:408665/141‑1 (MQ=255) acTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATa > 1:991244/1‑141 (MQ=255) acTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATa > 2:423287/1‑141 (MQ=255) cTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATag < 2:635130/141‑1 (MQ=255) tACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATagt < 1:649822/141‑1 (MQ=255) gTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATagtaaag > 1:138769/1‑141 (MQ=255) ttATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATagtaaagt < 2:922291/141‑1 (MQ=255) tATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATTATCAACATCATtgtaaagta > 2:75287/1‑141 (MQ=255) tATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATagtaaagta < 2:64368/141‑1 (MQ=255) ggAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAAt > 2:569835/1‑141 (MQ=255) gAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAAtt > 2:304462/1‑141 (MQ=255) tgtCATTGTATTTTAATACTTCTAAGAAGATAGGGATGTCTTCTGCAACACATTCTGAACGGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTATGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAATGTAAGTGTTTAAAAg < 2:236109/141‑1 (MQ=255) tgtCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACac > 2:984415/1‑140 (MQ=255) gtCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGc > 1:1046217/1‑141 (MQ=255) gtCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGc > 2:782975/1‑141 (MQ=255) cATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCAt > 2:416890/1‑141 (MQ=255) cATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACAGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCAt > 2:777772/1‑141 (MQ=255) cGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTg > 2:673320/1‑141 (MQ=255) cGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTg > 1:1014686/1‑141 (MQ=255) cGTATGTTAATACTTCCAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTg > 1:993197/1‑141 (MQ=255) gTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTgc > 2:1075825/1‑141 (MQ=255) gTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTgc < 2:35089/141‑1 (MQ=255) gTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTgc < 2:607818/141‑1 (MQ=255) tATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATTTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTgcg > 2:544848/1‑141 (MQ=255) gTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTNAACAGCATTTGCGCCt < 1:885845/141‑1 (MQ=255) ttAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTGCGCCtt < 1:484316/141‑1 (MQ=255) tAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTGCGCCTTg < 2:824757/141‑1 (MQ=255) tAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTGCGCCTTg < 1:815644/141‑1 (MQ=255) aaTACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTGCGCCTTGt < 1:316996/141‑1 (MQ=255) aCTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTGCGCCTTGTTCt > 1:307001/1‑141 (MQ=255) cTAAAAAGAATGGAATATCATCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTGCGCCTTGTTCTTTTa > 2:1087556/1‑141 (MQ=255) tAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTGCGCCTTGTTCTTTTaa < 1:730906/141‑1 (MQ=255) aaaaaGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTGCGCCTTGTTCTTTTaaa < 2:365240/141‑1 (MQ=255) aaaGAATCGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTGCGCCTTGTTCTTTTAAACg > 1:859470/1‑141 (MQ=255) | ACTTCAACTTTCAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTGCGCCTTGTTCTTTTAAACG > CP000730/2330360‑2330640 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |