Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP000730 | 2,379,107 | 0 | A | C | 5.2% | 358.9 / 10.1 | 116 | V127G (GTT→GGT) | USA300HOU_2240 | AEC family malonate efflux carrier |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.79e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
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caccacCTATATCAGCCATAACAAAATAAATAAGTCCCGTTTTAGGCCATATCACTTCAATTAGTGGATATGCAAACAATCCAATATTCATAGCACCAGTCATCATACCTACTGATCCACGCATGTGATTATCATATTTTc < 1:530842/141‑1 (MQ=255) ccaccTATATCAGCCATAACAAAATAAATAAGTCCCGTTTTAGGCCATATCACTTCAATTAGTGGATATGCAAACAATCCAATATTCATAGCACCAGTCATCATACCTACTGATCCACGCATGTGATTATCATATTTTCTa > 1:134736/1‑141 (MQ=255) ccaccTATATCAGCCATAACAAAATAAATAAGTCCCGTTTTAGGCCATATCACTTCAATTAGTGGATATGCAAACAATCCAATATTCATAGCACCAGTCATCATACCTACTGATCCACGCATGTGATTATCATATTTTCTa > 1:695942/1‑141 (MQ=255) caccTATATCAGCCATAACAAAATAAATAAGTCCCGTTTTAGGCCATATCACTTCAATTAGTGGATATGCAAACAATCCAATATTCATAGCACCAGTCATCATACCTACTGATCCACGCATGTGATTATCATATTTTCTaa < 2:394631/141‑1 (MQ=255) caccTATATCAGCCATAACAAAATAAATAAGTCCCGTTTTAGGCCATATCACTTCAATTAGTGGATATGCAAACAATCCAATATTCATAGCACCAGTCATCATACCTACTGATCCACGCATGTGATTATCATATTTTCTaa < 2:526005/141‑1 (MQ=255) cAGCCATAACAAAATAAATAAGTCCCGTTTTAGGCCATATCACTTCAATTAGTGGATATGCAAACAATCCAATATTCATAGCACCAGTCATCATACCTACTGATCCACGCATGTGATTATCATATTTTCTAAAAAACCAGa > 1:813371/1‑141 (MQ=255) aGCCATAACAAAATAAATAAGTCCCGTTTTAGGCCATATCACTTCAATTAGTGGATATGCAAACAATCCAATATTCATAGCACCAGTCATCATACCTACTGATCCACGCATGTGATTATCATATTTTCTAAAAAACCAGAc > 1:633803/1‑141 (MQ=255) gCCATAACAAAATAAATAAGTCCCGTTTTAGGCCATATCACTGCAATTAGTGGATATTCAAACAATCCAATATTCATAGCACCAGTCATCATACCTACTGATCCACGCATGTGATTATCATATTTTCTAAAAAACCAGACa < 1:99248/141‑1 (MQ=255) aTAACAAAATAAATAAGTCCCGTTTTAGGCCATATCACTTCAATTAGTGGATATGCAAACAATCCAATATTCATAGCACCAGTCATCATACCTACTGATCCACGCATGTGATTATCATATTTTCTAAAAAACCAGACAGCa < 2:1048807/141‑1 (MQ=255) aCAAAATAAATAAGTCCCGTTTTAGGCCATATCACTTCAATTAGTGGATATGCAAACAATCCAATATTCATAGCACCAGTCATCATACCTACTGATCCACGCATGTGATTATCATATTTTCTAAAAAACCAGACAGCAATc > 2:355656/1‑141 (MQ=255) | TATGTAACGAGTGGCACTGATTGTAATAATTTCTTACCTAAATATTTAAAATCGAATTGATCACTACCTTCACTAAAGTAGCTACCTACAAAGTAAGTAATTCCAAACATCACAAAGGCACCACCTATATCAGCCATAACAAAATAAATAAGTCCCGTTTTAGGCCATATCACTTCAATTAGTGGATATGCAAACAATCCAATATTCATAGCACCAGTCATCATACCTACTGATCCACGCATGTGATTATCATATTTTCTAAAAAACCAGACAGCAATC > CP000730/2378969‑2379247 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |