| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,379,394 | T→C | 7.9% | K31K (AAA→AAG) | USA300HOU_2240 ← | AEC family malonate efflux carrier |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,379,394 | 0 | T | C | 7.9% | 243.9 / 10.3 | 89 | K31K (AAA→AAG) | USA300HOU_2240 | AEC family malonate efflux carrier |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/50); new base C (2/5); total (34/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.04e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.00e-01 | |||||||||||
GCCACAATACCATATATAATCATTAAAATTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCATAATTTATAACTTTAACATACTCCACAGATATTTTAGA > CP000730/2379254‑2379533 | gCCACAATACCATATATAATCATTAAAATTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCt > 2:677409/1‑141 (MQ=255)gCCACAATACCATATATAATCATTAAAATTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCt < 1:1045862/141‑1 (MQ=255)gCCACAATACCATATATAATCATTAAAATTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCt < 2:627213/141‑1 (MQ=255)gCCACAATACCATATATAATCATTAAAATTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCt < 2:125177/141‑1 (MQ=255)gCCACAATACCATATATAATCATTAAAATTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCt < 1:498402/141‑1 (MQ=255) ccACAATACCATATATAATCATTAAAATTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCtt > 1:818336/1‑141 (MQ=255) aaTACCATATATAATCATTAAAATTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTtat < 1:349394/141‑1 (MQ=255) aaTACCATATATAATCATTAAAATTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTtat > 2:285819/1‑141 (MQ=255) tACCATATATAATCATTAAAATTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATaa < 2:378122/141‑1 (MQ=255) atatatAATCATTAAAATTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAAtt > 1:1052525/1‑141 (MQ=255) atataATCATTAAAATTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTaa < 2:847106/141‑1 (MQ=255) taATCATTAAAATTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATgc < 2:166721/141‑1 (MQ=255) aaTCATTAAAATTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATgcg < 2:997833/141‑1 (MQ=255) aaTCATTAAAATTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATgcg < 2:884066/141‑1 (MQ=255) tCATTAAAATTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCt > 1:173984/1‑141 (MQ=255) tCATTAAAATTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCt > 2:756305/1‑141 (MQ=255) cATTAAAATTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCtt > 2:590700/1‑141 (MQ=255) aTTAAAATTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTc < 1:360045/141‑1 (MQ=255) tAAAATTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCaa < 1:142280/141‑1 (MQ=255) aaaTTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCaaaa < 1:145331/141‑1 (MQ=255) aaaTTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCaaaa < 2:695262/141‑1 (MQ=255) aaTTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCaaaaa > 1:317321/1‑141 (MQ=255) ttGGTAAAATGGAGAATGACAAGTTTAATTCTGCACTGTTTAAATACACAATAACTAAAGATGGGAGTGGGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAAAGCGCAAAAAAAAGt < 2:464758/141‑1 (MQ=255) gTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCCTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAAc > 2:1004747/1‑141 (MQ=255) gTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCCTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAAc > 2:1004780/1‑141 (MQ=255) tAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAAcc < 2:608785/141‑1 (MQ=255) aTGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAgc < 1:306934/141‑1 (MQ=255) aTGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAgc < 2:240114/141‑1 (MQ=255) tGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAtcg < 2:153476/141‑1 (MQ=255) tGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAgcg < 1:912665/141‑1 (MQ=255) tGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAgcg < 1:74004/141‑1 (MQ=255) ggAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAgcgc < 2:285316/141‑1 (MQ=255) ggAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAgcgc < 1:355656/141‑1 (MQ=255) ggAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTATTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAgcgc > 1:852675/1‑141 (MQ=255) gagaATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTACTGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCa < 1:148554/141‑1 (MQ=255) agaATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCaa < 1:250112/141‑1 (MQ=255) gaATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAAt < 2:134736/141‑1 (MQ=255) gaATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAAt > 2:6024/1‑141 (MQ=255) aTGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGGGTGTGACATTAAGGACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATta < 1:213154/141‑1 (MQ=255) aCAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATtaata > 2:662968/1‑141 (MQ=255) aTTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCCTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTaataaaa < 1:207211/141‑1 (MQ=255) aTTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCCTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTaataaaa < 2:557521/141‑1 (MQ=255) tttAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTaataaaata > 2:32988/1‑141 (MQ=255) cTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTGACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAg < 2:147475/141‑1 (MQ=255) tGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGATTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGt > 1:1052803/1‑141 (MQ=255) gCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTa < 1:733306/141‑1 (MQ=255) gCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCCTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTa < 2:233590/141‑1 (MQ=255) cACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACNAAGCGCAATTAANAAAATAATCATAGTaa < 1:676364/141‑1 (MQ=255) tGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAAtt < 2:223390/141‑1 (MQ=255) tttAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCCTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGt < 2:3641/141‑1 (MQ=255) tttAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCCTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGt < 1:304176/141‑1 (MQ=255) tAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGGCTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAACAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGttt > 1:904335/1‑140 (MQ=255) tAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTc > 2:149976/1‑141 (MQ=255) tAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTc > 2:249024/1‑141 (MQ=255) actCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAAAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAATAAATTGTTCTGt > 2:159810/3‑141 (MQ=255) acaATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACt > 1:745454/1‑141 (MQ=255) acaATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACt > 2:616941/1‑141 (MQ=255) acaATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACt > 1:907026/1‑141 (MQ=255) caATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAAAGCACTACAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTg < 2:611538/141‑1 (MQ=255) aTAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGtt > 1:246845/1‑141 (MQ=255) aCTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATc > 1:367019/1‑141 (MQ=255) aCTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCAGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATc > 1:550792/1‑141 (MQ=255) tAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATccc < 2:493404/141‑1 (MQ=255) gATGGGANTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCACTTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCActtct < 2:813371/141‑1 (MQ=255) aTGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCcttctt < 2:379466/141‑1 (MQ=255) aTGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCcttctt < 1:625354/141‑1 (MQ=255) aTGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCcttctt > 1:1068937/1‑141 (MQ=255) gAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCaa > 2:832189/1‑141 (MQ=255) gAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCaa > 1:717306/1‑141 (MQ=255) gtgtGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCaata < 1:296682/141‑1 (MQ=255) gACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAGTAATCt > 2:1036981/1‑141 (MQ=255) ttAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCAt > 2:940251/1‑141 (MQ=255) gAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCa > 1:758/1‑90 (MQ=255) gAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCa < 2:758/90‑1 (MQ=255) gAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCATAAtt < 2:490826/141‑1 (MQ=255) cTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCATAATTtat < 1:627501/141‑1 (MQ=255) cTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCATAATTtat < 1:966451/141‑1 (MQ=255) tAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCCCTTCAAAAAGTATCCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCATAATTtata < 2:23645/141‑1 (MQ=255) aaTGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCATAATTTATaa > 1:725739/1‑141 (MQ=255) tGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCATAATTTATAACt < 2:89500/141‑1 (MQ=255) agaaaTGACTTGACTATCTATTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCATAATTTATAACTTTa < 2:758920/138‑1 (MQ=255) gCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCATAATTTATAACTTTaa > 2:8019/1‑141 (MQ=255) aaTGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCATAATTTATAACTTTAACa < 1:654329/141‑1 (MQ=255) aTGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCATAATTTATAACTTTAACAt > 2:78186/1‑141 (MQ=255) tgactATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCATAATTTATAACTTTAACATACTCca < 1:39033/141‑1 (MQ=255) tgactATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCATAATTTATAACTTTAACATACTCca < 1:1015373/141‑1 (MQ=255) tgactATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCATAATTTATAACTTTAACATACTCca < 2:949406/141‑1 (MQ=255) ctATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAACAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCATAATTTATAACTTTAACATACTCCACAg < 2:244890/141‑1 (MQ=255) aTCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTTTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCATAATTTATAACTTTAACATACTCCACAGat < 2:432404/141‑1 (MQ=255) aTCTATTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCGTAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCATAATTTATAACTTTAACATTCTCCGCAGat < 2:695942/141‑1 (MQ=255) cTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCATAATTTATAACTTTAACATACTCCACAGatat < 2:941892/141‑1 (MQ=255) ttGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCATAATTTATAACTTTAACATACTCCACAGATAtttt > 1:999312/1‑141 (MQ=255) tGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCATAATTTATAACTTTAACATACTCCACAGATATTTTa < 1:616941/141‑1 (MQ=255) gCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCATAATTTATAACTTTAACATACTCCACAGATATTTTAg < 2:502063/141‑1 (MQ=255) cTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCATAATTTATAACTTTAACATACTCCACAGATATTTTAGa > 1:402488/1‑141 (MQ=255) | GCCACAATACCATATATAATCATTAAAATTGGTAAAATGGAGAATGACAATTTTAATTCTGCACTGTTTAAATTCACAATAACTAAAGATGGGAGTGTGACATTAAGAACTAATGTAGCAATGACTTGACTATCTGTTGCTTTTATAAAATTAATGCGCTTCAAAAAGTAACCAAGCGCAATTAATAAAATAATCATAGTAAATTGTTCTGTCACTGTTATCCCTTCTTTCAATAATCTTCATAATTTATAACTTTAACATACTCCACAGATATTTTAGA > CP000730/2379254‑2379533 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |