| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,444,143 | G→A | 5.2% | I257I (ATC→ATT) | USA300HOU_2306 ← | NhaC family sodium:proton (Na+:H) antiporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,444,143 | 0 | G | A | 5.2% | 279.7 / 2.2 | 90 | I257I (ATC→ATT) | USA300HOU_2306 | NhaC family sodium:proton (Na+:H) antiporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (49/35); new base A (3/2); total (53/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ATAATACCTTTGGACACTGCATCTAGTAGCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCACCTGGCAATACAATTTTAAAGTTTACTCTGAATTTAT > CP000730/2444003‑2444282 | ataataCCTTTGGACACTGCATCTAGTAGCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAg < 2:1031608/141‑1 (MQ=255) aataCCTTTGGACACTGCATCTAGTAGCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGat < 2:547201/141‑1 (MQ=255) ataCCTTTGGACACTGCATCTAGTAGCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAAata > 2:238874/1‑141 (MQ=255) taCCTTTGGACACTGCATCTAGTAGCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGatat < 2:359165/141‑1 (MQ=255) taCCTTTGGACACTGCATCTAGTAGCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACATAATAATGCTAATACCAATACTAAGatat < 2:73969/141‑1 (MQ=255) aCCTTTGGACACTGCATCTAGTAGCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGAtata > 2:1065300/1‑141 (MQ=255) ccTTTGGACACTGCATCTAGTAGCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATAc > 1:1045963/1‑141 (MQ=255) tGGACACTGCATCTAGTAGCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTa > 1:443363/1‑141 (MQ=255) ggACACTGCATCTAGTAGCCCCATCCAACCGAATGAGCCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTAc < 2:803705/141‑1 (MQ=255) ggACACTGCATCTAGTAGCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTAc > 1:445573/1‑141 (MQ=255) ggACACTGCATCTAGTAGCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTAc > 2:230981/1‑141 (MQ=255) gACACTGCATCTAGTAGCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACa < 2:2279/141‑1 (MQ=255) acTGCATCTAGTAGCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACt < 2:58576/141‑1 (MQ=255) cTGCATCTAGTAGCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACtt > 2:628956/1‑141 (MQ=255) cTGCATCTAGTAGCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACtt > 1:179611/1‑141 (MQ=255) tCTAGTAGCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAAtt > 1:892347/1‑141 (MQ=255) tCTAGTAGCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAAtt < 2:275742/141‑1 (MQ=255) tCTAGTAGCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAAtt > 2:243401/1‑141 (MQ=255) tCTAGTAGCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAAtt > 1:458037/1‑141 (MQ=255) agtagCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGa > 2:951959/1‑141 (MQ=255) agtagCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGa > 2:236409/1‑141 (MQ=255) tagCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGAtt > 2:306380/1‑141 (MQ=255) agCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATta > 2:664064/1‑141 (MQ=255) agCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATta > 2:509757/1‑141 (MQ=255) agCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAACGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATta > 1:844822/1‑141 (MQ=255) ccccATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATtata > 1:866431/1‑141 (MQ=255) cccATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACATTAATTAGATGATaa > 2:856548/1‑141 (MQ=255) aTCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCa < 1:1002538/141‑1 (MQ=255) tCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCAt > 2:534904/1‑141 (MQ=255) cAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAg < 2:882243/141‑1 (MQ=255) aCCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACCTTAATTAGATTATAATCATAGtt > 1:626499/1‑141 (MQ=255) ccGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGttt > 1:393890/1‑141 (MQ=255) gAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCa < 1:116455/141‑1 (MQ=255) gAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCa < 1:676767/141‑1 (MQ=255) aaCCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCAt > 1:211302/1‑141 (MQ=255) aaCCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCAt > 2:14209/1‑141 (MQ=255) aaCCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTCAGCAt > 2:902886/1‑141 (MQ=255) aCCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATg > 1:446008/1‑141 (MQ=255) cATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGAt < 2:828313/141‑1 (MQ=255) cATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGAt > 1:4184/1‑141 (MQ=255) cATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGAt < 2:514411/141‑1 (MQ=255) aTCTATGAGACCAATGATTCCAGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAAATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGAtt < 1:1087502/141‑1 (MQ=255) taaaacataCCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGAttt < 1:228859/133‑1 (MQ=255) agaCCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGaa < 1:781062/141‑1 (MQ=255) aaTGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGcc < 1:951469/141‑1 (MQ=255) aTGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCa < 2:566831/141‑1 (MQ=255) aTGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCa > 2:288183/1‑141 (MQ=255) ttCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCg > 2:544232/1‑141 (MQ=255) tCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGt < 1:11843/141‑1 (MQ=255) tCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGt < 2:29192/141‑1 (MQ=255) ggCTAATAATGTTCCGCCGCTCAATACGAGCATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTaa < 2:487484/141‑1 (MQ=255) ggCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTTCACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTaa < 1:145363/141‑1 (MQ=255) gCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAg > 2:137082/1‑141 (MQ=255) cTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTATTATATACGTTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGa > 1:487953/1‑141 (MQ=255) cTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGa < 2:774312/141‑1 (MQ=255) aataatGTTCCGCCAACCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGaaa < 1:604758/141‑1 (MQ=255) ataatGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAAt < 1:534904/141‑1 (MQ=255) ataatGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAAt > 1:806108/1‑141 (MQ=255) aatGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAACGCCATTCGTTAAGAAATAc < 2:479052/141‑1 (MQ=255) ttCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGaa > 1:1072360/1‑141 (MQ=255) aatcaatACGATAATGACATTTACATATAATAATGCTAATACCAATACTAAGAAATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATTATAGTTTTTAGAATGATTTAAAGAAAAGCCATGCGTTAAGAAATACAGaataataat < 2:60848/141‑1 (MQ=255) tcaatACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCg < 1:247033/141‑1 (MQ=255) aatACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGtt > 1:504344/1‑141 (MQ=255) aatACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAAATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGtt > 2:1058652/1‑141 (MQ=255) aatACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAAATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGtt > 2:559106/1‑141 (MQ=255) aCGAGAATTACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTaaa < 2:738769/141‑1 (MQ=255) gATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAAt < 2:883824/141‑1 (MQ=255) aaTGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAAAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGc > 2:376714/1‑141 (MQ=255) aaTGACATTTACACCAAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAACATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATTCAGAATAATAATCGTTAAAATAGc < 2:1035372/141‑1 (MQ=255) tGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCAc > 2:993799/1‑141 (MQ=255) tttACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAAACATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCACCTGGc < 1:1005084/141‑1 (MQ=255) acCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCACCTGGCAATAc > 1:794933/1‑141 (MQ=255) acCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCACCTGGCAATAc < 2:1014642/141‑1 (MQ=255) acCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCACCTGGCAATAc > 1:312101/1‑141 (MQ=255) cTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCACCTGGCAATACaa > 1:732682/1‑141 (MQ=255) cTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCACCTGGCAATACaa < 2:835933/141‑1 (MQ=255) taataaTGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCACCTGGCAATACAAt > 2:872049/1‑141 (MQ=255) aataatGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCACCTGGCAATACAAtt > 2:1020133/1‑141 (MQ=255) ataatGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCACCTGGCAATACAAttt < 1:121992/141‑1 (MQ=255) aatGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCACCTGGCAATACAATTTTa > 1:942320/1‑141 (MQ=255) tGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCACCTGGCAATACAATTTTaaa > 1:13738/1‑141 (MQ=255) cTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCACCTGGCAATACAATTTTAAAGt > 1:489906/1‑141 (MQ=255) cTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCACCTGGCAATACAATTTTAAAGt > 1:289836/1‑141 (MQ=255) tAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCACCTGGCAATACAATTTTAAAGtt < 1:367597/141‑1 (MQ=255) aaTACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCACCTGGCAATACAATTTTAAAGttt > 1:972407/1‑141 (MQ=255) aTACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCACCTGGCAATACAATTTTAAAGTTTACTCTGa > 2:235485/1‑141 (MQ=255) aTACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCACCTGGCAATACAATTTTAAAGTTTACTCTGa > 2:183083/1‑141 (MQ=255) tACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCACCTGGCAATACAATTTTAAAGTTTACTCTGaa > 1:682430/1‑141 (MQ=255) aaGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCACCTGGCAATACAATTTTAAAGTTTACTCTGAATTTa > 2:169193/1‑141 (MQ=255) aGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCACCTGGCAATACAATTTTAAAGTTTACTCTGAATTTAt < 2:234316/141‑1 (MQ=255) aGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCACCTGGCAATACAATTTTAAAGTTTACTCTGAATTTAt > 2:760206/1‑141 (MQ=255) | ATAATACCTTTGGACACTGCATCTAGTAGCCCCATCCAACCGAATGAACCATCTATGAGACCAATGATTCCGGCTAATAATGTTCCGCCAATCAATACGATAATGACATTTACACCTAATAATGCTAATACCAATACTAAGATATACGGTACAACTTTAATTAGATTATAATCATAGTTTTTAGCATGATTTAAAGAAATGCCATTCGTTAAGAAATACAGAATAATAATCGTTAAAATAGCACCTGGCAATACAATTTTAAAGTTTACTCTGAATTTAT > CP000730/2444003‑2444282 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |