| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,475,761 | T→C | 6.0% | T165T (ACA→ACG) | tcaA ← | teicoplanin resistance protein TcaA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,475,761 | 0 | T | C | 6.0% | 329.2 / 9.6 | 116 | T165T (ACA→ACG) | tcaA | teicoplanin resistance protein TcaA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (54/55); new base C (3/4); total (57/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.42e-01 | |||||||||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
GGCGTCACTTTATTTGCTTCAGCTATAACCATCTTTTTCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCTGACAAATTGCTTAAGCCCAACTTCATC > CP000730/2475621‑2475898 | ggCGTCACTTTATTTGCTTCAGCTATAACCATCTTTTTCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTTTTTCTGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACgt > 2:495127/1‑141 (MQ=255)ggCGTCACTTTATTTGCTTCAGCTATAACCATCTTTTTCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACgt < 2:160720/141‑1 (MQ=255) cACTTTATTTGCTTCAGCTATAACCATCTTTTTCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGcc < 2:16429/141‑1 (MQ=255) tttATTTGCTTCAGCTATAACCATCTTTTTCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCAtt < 1:320721/141‑1 (MQ=255) tATTTGCTTCAGCTATAACCATCTTTTTCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCAttt‑‑‑‑t > 1:344525/1‑141 (MQ=255) tATTTGCTTCAGCTATAACCATCTTTTTCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGCTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGCGTGCCAttt‑‑‑‑t > 1:319522/1‑141 (MQ=255) tttGCTTCAGCTATAACCATCTTTTTCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑tta > 1:936133/1‑141 (MQ=255) tttGCTTCAGCTATAACCATCTTTTTCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTAAAAAAAAAAAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑tta < 2:26916/141‑1 (MQ=255) gCTTCAGCTATAACCATCTTTTTCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑ttactt > 2:567945/1‑141 (MQ=255) cAGCTATAACCATCTTTTTCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGTTTTAACAATTGGTTGCTCGGTAGGTGCAGTAACGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTacac > 1:1001963/1‑141 (MQ=255) gCTATAACCATCTTTTTCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGCTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGCGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGt < 1:850075/141‑1 (MQ=255) ataACCATCTTTTTCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGCTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGCGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAat > 1:568284/1‑141 (MQ=255) aCCATCTTTTTCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTGCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAatata < 1:284237/141‑1 (MQ=255) ccATCTTTTTCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTCTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGATAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAatatat > 2:279291/1‑141 (MQ=255) aTCTTTTTCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATAttt < 2:707835/141‑1 (MQ=255) tttttCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGATTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTAAAAAAAAAAAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGa < 2:134546/141‑1 (MQ=255) ttttCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATCATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGAc > 2:549294/1‑141 (MQ=255) tttCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGCTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCTAAAAAGATATAACGCGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATAATTTTTGAcc > 2:87369/1‑141 (MQ=255) tCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAg > 1:977656/1‑141 (MQ=255) tCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAg < 1:614910/141‑1 (MQ=255) tCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAg < 1:95188/141‑1 (MQ=255) tCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAg < 2:590772/141‑1 (MQ=255) cTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGa > 1:195240/1‑141 (MQ=255) ttACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGaa > 2:1015418/1‑140 (MQ=255) ttACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGAt > 1:513211/1‑141 (MQ=255) ttACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGAt > 2:1026112/1‑141 (MQ=255) ttACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGAt > 2:347106/1‑141 (MQ=255) tACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATc < 1:389372/141‑1 (MQ=255) tACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTCCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTAAAAAAAAAGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATc < 2:863304/141‑1 (MQ=255) ccaccaGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTg < 1:198227/141‑1 (MQ=255) ccaccaGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTg > 2:965546/1‑141 (MQ=255) caccaGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTgg < 2:1038481/141‑1 (MQ=255) accaGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGt < 1:717515/141‑1 (MQ=255) accaGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGt < 2:272272/141‑1 (MQ=255) ccaGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGtt < 1:86547/141‑1 (MQ=255) gATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGa > 2:703411/1‑141 (MQ=255) gATTTAAACTAATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGa > 1:961749/1‑141 (MQ=255) tttAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAat > 1:582937/1‑141 (MQ=255) tAAACTAATATTTTGTTTTTTATTTCGGTTTAACAAGTGGTGCCTAGGTAAGTGGAGTAAAACGCATATGATCGAAAAAGAGATAACGTGGGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAatat > 2:643498/1‑141 (MQ=255) aaCTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATaa < 1:425760/141‑1 (MQ=255) aaCTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATaa > 2:503694/1‑141 (MQ=255) cATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAAGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAACAAGATCTACCGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGCATATaagaag > 1:168325/1‑141 (MQ=255) ttttGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTAc > 2:464480/1‑141 (MQ=255) tttGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGTTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACg < 1:754298/141‑1 (MQ=255) tttGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACg < 2:1070635/141‑1 (MQ=255) ttGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGc > 1:869113/1‑141 (MQ=255) gTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTg < 2:591649/141‑1 (MQ=255) tttttCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGt > 1:775774/1‑141 (MQ=255) ttttCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTc < 2:238700/141‑1 (MQ=255) tctttcGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTa > 1:124027/1‑141 (MQ=255) ctttcGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTAc > 1:166708/1‑141 (MQ=255) ttcGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTActc < 1:24715/141‑1 (MQ=255) tcGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTActct < 2:783469/141‑1 (MQ=255) tcGGTTTAACAATTGGTTGCATGGTAGGTGCAGTAAAGCTCAGATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTActct > 1:753285/1‑141 (MQ=255) ttttAACAATTCGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGAACAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTAt < 1:448132/140‑1 (MQ=255) gcttAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGCGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTAt < 1:998903/139‑1 (MQ=255) gTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTAt < 1:447816/141‑1 (MQ=255) aaCAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTTTTACTTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTAt < 1:1046032/141‑1 (MQ=255) aaCAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCaa > 1:894279/1‑141 (MQ=255) aCAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAAt > 2:931663/1‑141 (MQ=255) aaTTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAAttt > 2:71743/1‑141 (MQ=255) tGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATg < 2:97670/141‑1 (MQ=255) tGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATg < 2:97558/141‑1 (MQ=255) gTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTa > 2:584088/1‑141 (MQ=255) ttGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTAc > 2:59366/1‑141 (MQ=255) tGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTAcc > 2:886048/1‑141 (MQ=255) tGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTAcc < 1:531494/141‑1 (MQ=255) gCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCg < 1:91795/141‑1 (MQ=255) gCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGCGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCg < 2:1030993/141‑1 (MQ=255) gCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGCGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCg < 2:568284/141‑1 (MQ=255) cTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATACAATTTATGTACCGt > 1:901364/1‑141 (MQ=255) tAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTAtttt > 2:538385/1‑141 (MQ=255) ggTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTATTTACACTTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTa > 2:145842/1‑141 (MQ=255) gCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAgg > 2:100751/1‑141 (MQ=255) gCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAgg > 1:89329/1‑141 (MQ=255) aGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTc < 2:874766/141‑1 (MQ=255) aGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTAGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTc > 1:292972/1‑141 (MQ=255) gTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCg > 1:1035393/1‑141 (MQ=255) aaaGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCt > 2:488416/1‑141 (MQ=255) aaaGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCt < 1:230499/141‑1 (MQ=255) aaGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCTg < 1:119400/141‑1 (MQ=255) aGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCTGa > 2:876032/1‑141 (MQ=255) cATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCTGACaaa < 2:122188/141‑1 (MQ=255) atatTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACATGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCTGACAAAt > 1:378021/1‑141 (MQ=255) atatTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCTGACAAAt > 2:570422/1‑141 (MQ=255) atatTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCTGACAAAt > 1:646542/1‑141 (MQ=255) attatCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCTGACAAATTg < 2:303043/141‑1 (MQ=255) tCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCTGACAAATTGCTTa < 1:649369/141‑1 (MQ=255) gAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGTTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCTGACAAATTGCTTAAg < 2:817908/141‑1 (MQ=255) aaaGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCTGACAAATTGCTTAAGccc < 1:220630/141‑1 (MQ=255) aGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCTGACAAATTGCTTAAGCCCaa < 2:809143/141‑1 (MQ=255) atatAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCTGACAAATTGCTTAAGCCCAACt < 1:916509/141‑1 (MQ=255) tgtaACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACGCGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCTGACAAATTGCTTAAGCCCAACtt < 2:180470/139‑1 (MQ=255) tataACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCTGACAAATTGCTTAAGCCCAACtt < 1:816419/141‑1 (MQ=255) tataACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCTGACAAATTGCTTAAGCCCAACtt < 1:816394/141‑1 (MQ=255) ataACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCTGACAAATTGCTTAAGCCCAACTTc > 1:653108/1‑141 (MQ=255) taACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCTGACAAATTGCTTAAGCCCAACTTCa > 2:802970/1‑141 (MQ=255) taACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCTGACAAATTGCTTAAGCCCAACTTCa > 2:41239/1‑141 (MQ=255) aCGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCTGACAAATTGCTTAAGCCCAACTTCATc < 1:1052045/141‑1 (MQ=255) aCGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCTGACAAATTGCTTAAGCCCAACTTCATc < 2:848130/141‑1 (MQ=255) | GGCGTCACTTTATTTGCTTCAGCTATAACCATCTTTTTCTTACCACCAGATTTAAACTCATATTTTGTTTTTTCTTTCGGTTTAACAATTGGTTGCTTGGTAGGTGCAGTAAAGCTCATATTATCGAAAAAGATATAACGTGTGCCATTT‑‑‑‑TTACTTACACGTAATATATTTTGACCAGATCTGGTTTGAATATAAGAAGCTACGCTGGTCTTACTCTTATTCAATTTATGTACCGTATTTTTAAGGTCGCTGACAAATTGCTTAAGCCCAACTTCATC > CP000730/2475621‑2475898 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |