| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 2,696,559 | 0 | T | C | 7.6% | 297.0 / 10.5 | 104 | intergenic (+111/‑129) | USA300HOU_2551/copA | hypothetical protein/P‑ATPase superfamily P‑type ATPase copper (Cu2+) transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (55/41); new base C (3/5); total (58/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.61e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
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CP000730/2696419‑2696699 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |