| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,726,585 | T→C | 5.3% | intergenic (‑12/+330) | USA300HOU_2581 ← / ← USA300HOU_2582 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,726,585 | 0 | T | C | 5.3% | 270.9 / 4.4 | 94 | intergenic (‑12/+330) | USA300HOU_2581/USA300HOU_2582 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (46/43); new base C (2/3); total (48/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.36e-01 | |||||||||||
ATTTCCACTTACTGTTGTACTTTCATCTTTATCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAATTATTGTATCAATAAATATGTATCATTCCTAGAATTTTATTG > CP000730/2726445‑2726724 | attTCCACTTACTGTTGTACTTTCATCTTTATCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACctctct < 1:96501/141‑1 (MQ=255)attTCCACTTACTGTTGTACTTTCATCTTTATCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACctctct < 1:92684/141‑1 (MQ=255) aCTTACTGTTGTACTTTCATCTTTATCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCAttt < 2:185015/141‑1 (MQ=255) cTTACTGTTGTACTTTCATCTTTATCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTa > 2:423088/1‑141 (MQ=255) ttACTGTTGTACTTTCATCTTTATCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTaa > 2:948496/1‑141 (MQ=255) tACTGTTGTACTTTCATCTTTATCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGACCTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTaaa < 1:270291/141‑1 (MQ=255) tgttgtACTTTCATCTTTATCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATTGATTTTGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAatta > 2:433006/1‑141 (MQ=255) gttgtACTTTCATCTTTATCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAattat < 1:424631/141‑1 (MQ=255) ttgtACTTTCATCTTTATCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAattatt < 1:931270/141‑1 (MQ=255) ttgtACTTTCATCTTTATCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAattatt > 2:293963/1‑141 (MQ=255) gtACTTTCATCTTTATCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTAtttt < 1:205588/141‑1 (MQ=255) gtACTTTCATCTTTATCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTAtttt > 2:244932/1‑141 (MQ=255) tACTTTCATCTTTATCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTa < 1:54395/141‑1 (MQ=255) ttCATCTTTATCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAat < 1:479527/141‑1 (MQ=255) ttCATCTTTATCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAat > 1:520616/1‑141 (MQ=255) cATCTTTATCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACGGCACTTTTAATAGATGATGATGCACTATTAGTCTTGAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATTATTTACACCTCTTCCCATTTAAATTATTTTAAAatta < 2:153674/141‑1 (MQ=255) cATCTTTATCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAatta > 2:21149/1‑141 (MQ=255) aTCTTTATCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAattat < 2:434397/141‑1 (MQ=255) aTCTTTATCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAattat < 2:434357/141‑1 (MQ=255) tttATCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAg < 1:896349/141‑1 (MQ=255) tATCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAAAAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGaa > 2:1050067/1‑141 (MQ=255) tCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAAc < 2:521327/141‑1 (MQ=255) ggTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGt > 2:203655/1‑141 (MQ=255) gTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTa < 2:279056/141‑1 (MQ=255) gTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTa < 2:942921/141‑1 (MQ=255) gTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTa > 2:917189/1‑141 (MQ=255) tttCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTAt < 2:878411/141‑1 (MQ=255) tCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCa > 2:994410/1‑141 (MQ=255) acacATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAata < 1:428333/141‑1 (MQ=255) cacaTTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTa > 1:320141/1‑134 (MQ=255) cacaTTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTa < 2:320141/134‑1 (MQ=255) cacaTTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAatat > 1:72195/1‑141 (MQ=255) cacaTTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAatat < 1:254762/141‑1 (MQ=255) acaTTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAatata < 1:672608/141‑1 (MQ=255) attattACATGTTTCAACGGCACTTTTAATAGATGATGATGCACTATTAGTCTTGAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATTATTTACACCTCTTCCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATg < 1:212378/141‑1 (MQ=255) tattaCATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAatatcatat < 1:509892/141‑6 (MQ=255) ttaCATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCGCTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGatat > 2:28179/1‑141 (MQ=255) ttaCATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGatat > 2:513331/1‑141 (MQ=255) aTGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCaa < 1:956473/141‑1 (MQ=255) tGTTTCAACGGCACTTTTAATAGATGATGATGCACTATTAGTCTTGAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATTATTTACACCTCTTCCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCaaa > 2:964946/1‑141 (MQ=255) tGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCaaa > 1:585444/1‑141 (MQ=255) tGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCaaa > 2:966708/1‑141 (MQ=255) tCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCAATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACAtt > 1:701880/1‑141 (MQ=255) aGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAAtt > 1:180074/1‑141 (MQ=255) ttttAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTCAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACt > 2:947550/1‑141 (MQ=255) ttttAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCACCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACt < 2:25504/141‑1 (MQ=255) ttttAATAGATGATGATGCACTATTAGTCTTGAAAATATCACTTTGAACTGTACTCTTTATTTACACCTCTTCCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATAATACt < 1:884672/141‑1 (MQ=255) ttAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTa < 1:124957/141‑1 (MQ=255) ttAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTa < 1:773080/141‑1 (MQ=255) ttAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAAAATTCCATtatattgt > 2:39928/1‑137 (MQ=255) ttAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATAATTCTTTCCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTa < 1:293963/141‑1 (MQ=255) tAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTaa > 2:954442/1‑141 (MQ=255) aaTAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTaaa < 2:1012577/141‑1 (MQ=255) aaTAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTAACAATCTATTATATTCAAACATTCAATTATACTTaaa < 1:252926/141‑1 (MQ=255) aTAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAat > 1:807245/1‑141 (MQ=255) aTAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAat > 2:52868/1‑141 (MQ=255) aTAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTAATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAat < 2:686392/141‑1 (MQ=255) aGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAatat < 2:433997/141‑1 (MQ=255) atgatgatgCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTg > 2:607622/1‑141 (MQ=255) tgatgatgCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATCCTTAAATATTGt > 2:157874/1‑141 (MQ=255) tgatgatgCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGt > 1:194638/1‑141 (MQ=255) tgatgCCCTATAGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTATCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCCATATATGATCTTCAACCATTCAATCATACTAAAATATAGtatt > 2:1078735/1‑141 (MQ=255) atgCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTAt > 2:609074/1‑141 (MQ=255) tgCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATg > 2:958644/1‑141 (MQ=255) tgCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATg > 2:66604/1‑141 (MQ=255) cTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATta > 1:344346/1‑141 (MQ=255) aTTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATtata > 1:217342/1‑141 (MQ=255) tGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATAtt < 2:846956/141‑1 (MQ=255) ggTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTc < 1:949644/141‑1 (MQ=255) tCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCaa < 2:1082080/141‑1 (MQ=255) ttAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCaaaa < 1:625996/141‑1 (MQ=255) tAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAat > 1:294412/1‑141 (MQ=255) aaaaaTATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAatt < 1:977941/141‑1 (MQ=255) aaaaTATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAatta > 1:46011/1‑141 (MQ=255) aaaTATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAattat < 2:600043/141‑1 (MQ=255) atatCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAATTATTg > 1:21780/1‑141 (MQ=255) ataaCACTTTGAACTGTACTCATCATCTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCTATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAATTATTg < 2:971898/141‑1 (MQ=255) tCACTTTGAACTGTACTCATTATTTACACCTCTTCCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATAATACTTAAATATTGTTTTGTGATTATATTCAAAATTATTGTAt > 2:680371/1‑141 (MQ=255) tCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAATTATTGTAt > 2:796014/1‑141 (MQ=255) tCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAATTATTGTAt > 2:893711/1‑141 (MQ=255) cACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAATTATTGTATc < 2:187259/141‑1 (MQ=255) ttGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAATTATTGTATCaata > 2:322068/1‑141 (MQ=255) aCTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTACATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAATTATTGTATCaataaatt > 2:480838/1‑140 (MQ=255) cTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAATTATTGTATCAATAAatat > 1:796810/1‑141 (MQ=255) tACTCATCATTTACACCTCTCTCCCTTTAAAATATTTGGAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAATTATTGTATCAATAAATATGTa > 1:575537/1‑141 (MQ=255) tACTCATCATTTACACCTCTCTCCAGTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAATTATTGTATCAATAAATATGTa > 2:57444/1‑141 (MQ=255) cTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAATTATTGTATCAATAAATATGTATc > 2:999730/1‑141 (MQ=255) tcatcaTTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAATTATTGTATCAATAAATATGTATCa < 1:941220/141‑1 (MQ=255) atcatTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGAAATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAATTATTGTATCAATAAATATGTATCAtt < 2:516322/141‑1 (MQ=255) atTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAATTATTGTATCAATAAATATGTATCATTCCt < 2:328711/141‑1 (MQ=255) tttACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAATTATTGTATCAATAAATATGTATCATTCCTa > 2:874925/1‑141 (MQ=255) ttACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAATTATTGTATCAATAAATATGTATCATTCCTAg < 2:335097/141‑1 (MQ=255) ttACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAATTATTGTATCAATAAATATGTATCATTCCTAg < 1:335626/141‑1 (MQ=255) acacCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAATTATTGTATCAATAAATATGTATCATTCCTAGaa > 2:732921/1‑141 (MQ=255) cacCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAATTATTGTATCAATAAATATGTATCATTCCTAGAAt < 2:253010/141‑1 (MQ=255) cacCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAATTATTGTATCAATAAATATGTATCATTCCTAGAAt < 2:203580/141‑1 (MQ=255) ctcCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAATTATTGTATCAATAAATATGTATCATTCCTAGAATTTTATTg < 1:984468/141‑1 (MQ=255) | ATTTCCACTTACTGTTGTACTTTCATCTTTATCCGGTTTCGACACATTATTACATGTTTCAACAGCGCTTTTAATAGATGATGATGCACTATTGGTCTTAAAAATATCACTTTGAACTGTACTCATCATTTACACCTCTCTCCATTTAAATTATTTTAAAATTATTAGAAACTGTATCAATATATGATATTCAAACATTCAATTATACTTAAATATTGTTTTATGATTATATTCAAAATTATTGTATCAATAAATATGTATCATTCCTAGAATTTTATTG > CP000730/2726445‑2726724 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |