| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 355,263 | 0 | C | A | 5.5% | 411.7 / 4.3 | 123 | intergenic (‑87/+129) | ywcJ/brnQ1 | FNT family formate‑nitrite transporter/LIVCS family branched chain amino acid:cation symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (48/67); new base A (3/5); total (51/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
AATCTTATCCCATTTAATATGTTTCTCCTTCACAATGACATCCTCACTTTTCATTTGTTAATCAGAGTATACTATGAATTGCCTTATTTGTGAATAATTTCACAAAATTAATTTTAAAAACTAATATTTTTGAATAACAGCTAGGATTTTTTAACAAATCATTTATTTTAAAATAATCAATAGACAGACGGTATCACTGAAAAGTCATGAATTTCATATAAAAAAGCCTAGTAACGATGGGTCAATCATTACTAGGCAGTGAGCATTTATTAAGTTGTCGC > CP000730/355123‑355403 | aaTCTTATCCCATTTAATATGTTTCTCCTTCACAATGACATCCTCACTTTTCATTTGTTAATCAGAGTATACTATGAATTGCCTTATTTGTGAATAATTTCACAAAATTAATTTTAAAAACTAATATTTTTGAATAACAGc > 2:224745/1‑141 (MQ=255) aTCTTATCCCATTTAATATGTTTCTCCTTCACAATGACATCCTCACTTTTCATTTGTTAATCAGAGTATACTATGAATTGCCTTATTTGTGAATAATTTCACAAAATTAATTTTAAAAACTAATATTTTTGAATAACAGCt > 1:219487/1‑141 (MQ=255) aTCTTATCCCATTTAATATGTTTCTCCTTCACAATGACATCCTCACTTTTCATTTGTTAATCAGAGTATACTATGAATTGCCTTATTTGTGAATAATTTCACAAAATTAATTTTAAAAACTAATATTTTTGAATAACAGCt < 2:131331/141‑1 (MQ=255) ttATCCCATTTAATATGTTTCTCCTTCACAATGACATCCTCACTTTTCATTTGTTAATCAGAGTATACTATGAATTGCCTTATTTGTGAATAATTTCACAAAATTAATTTTAAAAACTAATATTTTTGAATAACAGCTAgg > 1:436897/1‑141 (MQ=255) 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(MQ=255) atatTTTTGAATAACAGCTAGGATTTTTTAACAAATCATTTATTTTAAAATAATCAATAGACAGACGGTATCACTGAAAAGTCATGAATTTCATATAAAAAAGCCTAGTAACGATGGGTCAATCATTACTAGGCAGTGAGc < 2:537070/141‑1 (MQ=255) atatTTTTGAATAACAGCTAGGATTTTTTAACAAATCATTTATTTTAAAATAATCAATAGACAGACGGTATCACTGAAAAGTCATGAATTTCATATAAAAAAGCCTAGTAACGATGGGTCAATCATTACTAGGCAGTGAGc < 2:297136/141‑1 (MQ=255) ttttGAATAACAGCTAGGATTTTTTAACAAATCATTTATTTTAAAATAATCAATAGACAGACGGTATCACTGAAAAGTCATGAATTTCATATAAAAAAGCCTAGTAATGATTGACCCATCGTTACTAGGcttttttatatg < 1:383591/141‑12 (MQ=37) ttGAATAACAGCTAGGATTTTTTAACAAATCATTTATTTTAAAATAATCAATAGACAGACGGTATCACTGAAAAGTCATGAATTTCATATAAAAAAGCCTAGTAACGATGGGTCAATCATTACTAGGCAGTGAGCATttat < 2:67614/141‑1 (MQ=255) aTAACAGCTAGGATTTTTTAACAAATCATTTATTTTAAAATAATCAATAGACAGACGGTATCACTGAAAAGTCATGAATTTCATATAAAAAAGCCTAGTAACGATGGGTCAATCATTACTAGGCAGTGAGCATTTATTAAg < 1:393628/141‑1 (MQ=255) aaCAGCTAGGATTTTTTAACAAATCATTTATTTTAAAATAATCAATAGACAGACGGTATCACTGAAAAGTCATGAATTTCATATAAAAAAGCCTAGTAACGATGGGTCAATCATTACTAGGCAGTGAGCATTTATTAAGtt > 2:86983/1‑141 (MQ=255) aaCAGCTAGGATTTTTTAACAAATCATTTATTTTAAAATAATCAATAGACAGACGGTATCACTGAAAAGTCATGAATTTCATATAAAAAAGCCTAGTAACGATGGGTCAATCATTACTAGGCAGTGAGCATTTATTAAGtt > 1:80884/1‑141 (MQ=255) cAGCTAGGATTTTTTAACAAATCATTTATTTTAAAATAATCAATAGACAGACGGTATCACTGAAAAGTCATGAATTTCATATAAAAAAGCCTAGTAACGATGGGTCAATCATTACTAGGCAGTGAGCATTTATTAAGTTGt > 1:1010950/1‑141 (MQ=255) cAGCTAGGATTTTTAAGTTATTCATTTATTTTAAAATAATCAATAGACAGACGGTATCACTGAAAAGTCATGAATTTCATATAAAAAAGCCTAGTAACGATGGGTCAATCATTACTAGGCAGTGAGCATTTATTAAGTTGt < 1:874472/141‑1 (MQ=255) cTAGGATTTTTTAACAAATCATTTATTTTAAAATAATCAATAGACAGACGGTATCACTGAAAAGTCATGAATTTCATATAAAAAAGCCTAGTAACGATGGGTCAATCATTACTAGGCAGTGAGCATTTATTAAGTTGTCGc > 1:12937/1‑141 (MQ=255) | AATCTTATCCCATTTAATATGTTTCTCCTTCACAATGACATCCTCACTTTTCATTTGTTAATCAGAGTATACTATGAATTGCCTTATTTGTGAATAATTTCACAAAATTAATTTTAAAAACTAATATTTTTGAATAACAGCTAGGATTTTTTAACAAATCATTTATTTTAAAATAATCAATAGACAGACGGTATCACTGAAAAGTCATGAATTTCATATAAAAAAGCCTAGTAACGATGGGTCAATCATTACTAGGCAGTGAGCATTTATTAAGTTGTCGC > CP000730/355123‑355403 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |