| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 2368663 = | 62 (0.930) | 5 (0.080) | 4/254 | 8.3 | 7.3% | intergenic (‑1780/+3778) | rpmC/pbuG | ribosomal protein L29/NCS2 family nucleobase:cation symporter‑2 |
| ? | CP000730 | 2368705 = | 67 (1.050) | intergenic (‑1822/+3736) | rpmC/pbuG | ribosomal protein L29/NCS2 family nucleobase:cation symporter‑2 | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GGGAAAATTGTAGAACGACGTGACCATGTTTTGATTACTTGTTTCTTTTCGCTTCCTTCTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATAAGTTTGTCTGATGATTTTTTACCACGACGAGTTTTCTTACCAAGCGTAGGTTTACCCCATG > CP000730/2368523‑2368802 | gggAAAATTGTAGAACGACGTGACCATGTTTTGATTACTTGTTTCTTTTCGCTTCCTTCTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCcttc < 2:20271/141‑1 (MQ=255) aaaTTGTAGAACGACGTGACCATGTTTTGATTACTTGTTTCTTTTCGCTTCCTTCTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCttat < 2:764434/141‑1 (MQ=255) aaaTTGTAGAACGACGTGACCATGTTTTGATTACTTGTTTCTTTTCGCTTCCTTCTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCttat > 1:141133/1‑141 (MQ=255) aaTTGTAGAACGACGTGACCATGTTTTGATTACTTGTTTCTTTTCGCTTCCTTCTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCttatt > 1:787360/1‑141 (MQ=255) aTTGTAGAACGACGTGACCATGTTTTGATTACTTGTTTCTTTTCGCTTCCTTCTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCttatta < 2:704841/141‑1 (MQ=255) aGAACGACGTGACCATGTTTTGATTACTTGTTTCTTTTCGCTTCCTTCTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAATTGCTCATCGACGAAAGGTCCCTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATgtgc > 2:125536/1‑141 (MQ=255) aGAACGACGTGACCATGTTTTGATTACTTGTTTCTTTTCGCTTCCTTCTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATgtgc > 1:169533/1‑141 (MQ=255) aGAACGACGTGACCATGTTTTGACTACTTGTTTCTTTTCGCTTCCTTCTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTTGCCGCCTCCCTTCTTATTATgtgc > 1:559350/1‑141 (MQ=255) aCCATGTTTTGATTACTTGTTTCTTTTCGCTTCCTTCTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATgtgcggcttaaagct < 1:383927/141‑11 (MQ=255) ccATGTTTTGATTACTTGTTTCTTTTCGCTTCCTTCTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTaa < 1:402251/141‑1 (MQ=255) aTTACTTGTTTCTTTTCGCTTCCTTCTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACAcc > 2:715172/1‑141 (MQ=255) cTTGTTTCTTTTCGCTTCCTTCTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCaaa < 2:504737/141‑1 (MQ=255) tgttcacaatgcatccttcTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATaa < 1:662429/128‑1 (MQ=255) tttCTTTTCGCTTCCTTCTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAg > 1:485975/1‑141 (MQ=255) ttCTTTTCGCTTCCTTCTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGt > 1:80880/1‑141 (MQ=255) ttCGCTTCCTTCTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTATATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGatt > 2:289835/1‑141 (MQ=255) gCTTCCTTCTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCcttctt > 2:779308/1‑93 (MQ=255) gCTTCCTTCTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCcttctt < 1:779308/93‑1 (MQ=255) cttccttnTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGattatat < 2:592860/141‑1 (MQ=255) ttccttcTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTTTTTTTTCTAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTTCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCCAATCAGTCGattatatt > 2:543730/1‑141 (MQ=255) ttccttcTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGattatatt < 1:392079/141‑1 (MQ=255) ttccttcTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGattatatt < 2:1018/141‑1 (MQ=255) ccttcTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGattatattat > 1:421405/1‑141 (MQ=255) cttcttGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATattatt < 1:320093/141‑1 (MQ=255) cTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTAc > 1:494131/1‑141 (MQ=255) aaCTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTTTTTTTTTTTGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCACCTCCGTTGATTATATTATTTTTTCTTACTTcc > 2:401025/1‑141 (MQ=255) cTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGc < 1:254118/89‑1 (MQ=255) cTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGc < 1:254225/89‑1 (MQ=255) cTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGc > 2:254118/1‑89 (MQ=255) cTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGc > 2:254225/1‑89 (MQ=255) ttttCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTTCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCacgaa > 2:30483/1‑141 (MQ=255) ttCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACg > 2:158964/1‑131 (MQ=255) ttCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACg < 1:158964/131‑1 (MQ=255) tCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCacgaacga > 1:418484/1‑141 (MQ=255) aTTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATa > 1:96530/1‑141 (MQ=255) aTTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATa > 1:720051/1‑141 (MQ=255) tAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATAAg < 1:521466/141‑1 (MQ=255) cATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATAAGTTTGTCtg > 1:298251/1‑141 (MQ=255) aaaGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATAAGTTTGTCTGATGAtttt < 2:755547/141‑1 (MQ=255) tCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATAAGTTTGTCTGATGATTTTTTAcc < 1:468708/141‑1 (MQ=255) ttttttAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCac < 2:6210/107‑1 (MQ=255) ttttttAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCac > 1:6210/1‑107 (MQ=255) ttttttAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATAAGTTTGTCTGATGATTTTTTACCacg < 2:332938/141‑1 (MQ=255) ttttAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATAAGTTTGTCTGATGATTTTTTACCacgac > 1:523955/1‑141 (MQ=255) tttAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATAAGTTTGTCTGATGATTTTTTACCacgacg > 1:548822/1‑141 (MQ=255) ttAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATAAGTTTGTCTGATGATTTTTTACCAcgacga < 2:678558/141‑1 (MQ=255) ttAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATAAGTTTGTCTGATGATTTTTTACCAcgacga < 2:548822/141‑1 (MQ=255) tttttttttatccATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGTAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTTTTACTTCCACGAACGATAAGTTTGTCTGATGATTTTTTACCACGACGAGt > 2:247046/12‑141 (MQ=255) aaTACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCa < 1:105181/47‑1 (MQ=255) aaTACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCa > 2:105181/1‑47 (MQ=255) aaTACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATAAGTTTGTCTGATGATTTTTTACCACGACGAGt > 2:676134/1‑141 (MQ=255) aaTACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATAAGTTTGTCTGATGATTTTTTACCACGACGAGt < 2:206377/141‑1 (MQ=255) aaTACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATAAGTTTGTCTGATGATTTTTTACCACGACGAGt > 1:704314/1‑141 (MQ=255) tacGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATAAGTTTGTCTGATGATTTTTTACCACGACGAGTTTTCt > 1:129582/1‑141 (MQ=255) acGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATAAGTTTGTCTGATGATTTTTTACCACGACGAGTTTTCtt > 1:760457/1‑141 (MQ=255) tttGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATAAGTTTGTCTGATGATTTTTTACCACGACGAGTTTTCTTACCAAGCg > 1:570893/1‑141 (MQ=255) gggCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATAAGTTTGTCTGATGATTTTTTACCACGACGAGTTTTCTTACCAAGCGTAg > 2:504620/1‑141 (MQ=255) gggCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATAAGTTTGTCTGATGATTTTTTACCACGACGAGTTTTCTTACCAAGCGTAg > 1:125992/1‑141 (MQ=255) gcgcCTCCATTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATAAGTTTGTCTGATGATTTTTTACCACGACGAGTTTTCTTACCAAGCGTAGGt > 1:689200/1‑141 (MQ=255) ccTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATAAGTTTGTCTGATGATTTTTTACCACGACGAGTTTTCTTACCAAGCGTAGGTTTa > 2:663082/1‑141 (MQ=255) ttcttATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATAAGTTTGTCTGATGATTTTTTACCACGACGAGTTTTCTTACCAAGCGTAGGTTTACCCCAt < 2:485975/141‑1 (MQ=255) tcttATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATAAGTTTGTCTGATGATTTTTTACCACGACGAGTTTTCTTACCAAGCGTAGGTTTACCCCATg < 2:418484/141‑1 (MQ=255) | GGGAAAATTGTAGAACGACGTGACCATGTTTTGATTACTTGTTTCTTTTCGCTTCCTTCTTGAGCTTCAACTTTTTTCATTAAATGCTCATCGACGAAAGGTCCTTTTTTAATACTACGAGCCATTTGGGCGCCTCCCTTCTTATTATGTGCGTGCAGCTTTAAGCCGCACACCCAAATAAGTTGATTATATTATTTTTTCTTACGTCCACGAACGATAAGTTTGTCTGATGATTTTTTACCACGACGAGTTTTCTTACCAAGCGTAGGTTTACCCCATG > CP000730/2368523‑2368802 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |