| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,026,955 | G→A | T331I (ACA→ATA) | vraS ← | sensor histidine kinase VraS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,026,955 | 0 | G | A | 98.7% | 271.3 / ‑4.0 | 79 | T331I (ACA→ATA) | vraS | sensor histidine kinase VraS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (43/35); total (43/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.56e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.89e-01 | |||||||||||
CCAACTACTTCAATATCACTTTGCGTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTGAA > CP000730/2026819‑2027084 | ccAACTACTTCAATATCACTTTGCGTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATAcc < 1:87692/141‑1 (MQ=255)ccAACTACTTCAATATCACTTTGCGTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATAcc > 2:777880/1‑141 (MQ=255) actactTCAATATCACTTTGCGTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAACGGTGCTTTCACCTCGCTACGTATACCTGa > 1:614790/1‑141 (MQ=255) tactTCAATATCACTTTGCGTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAAt > 1:531983/1‑141 (MQ=255) ctTCAATATCACTTTGCGTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCt > 2:425034/1‑141 (MQ=255) cACTTTGCGTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGAt < 2:660373/141‑1 (MQ=255) aCTTTGCGTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTACGGGTGCTTTCCCCTCGATACGTATACCTGAATCTTGCAAGGATa > 1:430262/1‑141 (MQ=255) aCTTTGCGTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATa > 1:478531/1‑141 (MQ=255) tttGCGTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACa > 1:445397/1‑141 (MQ=255) gatagataACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGaa > 1:111477/1‑141 (MQ=255) atagataACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAAc > 2:700556/1‑141 (MQ=255) agataACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGt < 2:739762/141‑1 (MQ=255) aCTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCAc < 2:291218/141‑1 (MQ=255) cTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCAcc > 2:574956/1‑141 (MQ=255) aaaTTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAAtt > 1:522806/1‑141 (MQ=255) aaTTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAAttt > 2:132000/1‑141 (MQ=255) aaTTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAAttt > 1:315458/1‑141 (MQ=255) aTTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTc > 1:477972/1‑141 (MQ=255) ccTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCaa < 2:315757/141‑1 (MQ=255) ccTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCaa > 1:285617/1‑141 (MQ=255) ccTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTAGTTAAAGTTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCaa > 1:358469/1‑141 (MQ=255) cTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCaaa > 1:40740/1‑141 (MQ=255) cTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCaaa > 2:514053/1‑141 (MQ=255) tataCGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAg < 2:511295/141‑1 (MQ=255) tataCGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAg < 1:255135/141‑1 (MQ=255) tataCGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAg < 1:485622/141‑1 (MQ=255) ccATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCa > 1:59890/1‑141 (MQ=255) cATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCAc < 2:323809/141‑1 (MQ=255) tttCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTg > 1:161343/1‑85 (MQ=255) tttCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTg < 2:161343/85‑1 (MQ=255) ttCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCa < 1:761149/141‑1 (MQ=255) tCATGATCATCCACACACACTACTTTGCTCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATCACTGAACCTGGCATTGCTACAATATGGAACGCTGCACCAATTTCCACAGCTCTTTCACGCat < 2:276551/141‑1 (MQ=255) cATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGa < 2:740834/83‑1 (MQ=255) cATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGa > 1:740834/1‑83 (MQ=255) cATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCata > 1:691759/1‑141 (MQ=255) cATGATCATCCACAAACAATACTCTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCata > 2:124514/1‑141 (MQ=255) tGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATAtt < 1:712085/141‑1 (MQ=255) catcCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTa > 1:605464/1‑141 (MQ=255) catcCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTa > 1:144176/1‑141 (MQ=255) acaaacaaTACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTcc < 2:21612/141‑1 (MQ=255) acaaacaaTACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTcc < 2:21438/141‑1 (MQ=255) acaaacaaTACCTTACTCGTCATACGAATCATCATTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTcc < 2:157724/141‑1 (MQ=255) caaTACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAAc > 1:460715/1‑141 (MQ=255) caaTACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAAc > 1:387847/1‑141 (MQ=255) aTACTTTAATCGTCATACGAAGCCTCCTTATTTAAAGTTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACtt < 2:669665/141‑1 (MQ=255) tACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCa < 2:129752/120‑1 (MQ=255) tACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCa > 1:129752/1‑120 (MQ=255) tttAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGtt < 2:429261/141‑1 (MQ=255) ttAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTc < 2:87357/141‑1 (MQ=255) aaTCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTa > 1:681542/1‑141 (MQ=255) aTCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTaa < 2:267330/141‑1 (MQ=255) tCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAAtttt < 1:769126/141‑1 (MQ=255) cATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAAttttt > 2:476277/1‑141 (MQ=255) cATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAAttttt > 1:56688/1‑141 (MQ=255) cATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAAttttt > 1:167097/1‑141 (MQ=255) cATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAAttttt > 2:308648/1‑141 (MQ=255) cATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCAAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAAttttt > 1:356524/1‑141 (MQ=255) aTACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTtc < 1:582320/141‑1 (MQ=255) tACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGACCGTTGCCAGAGTATGACAAGATCTTTTAACTGTTTTTTTAAGTCCATAACTTTCTTCTAATTTTtca > 1:667551/1‑141 (MQ=255) aCGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACACTATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTtcat < 1:32695/141‑1 (MQ=255) cGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTtcatc < 1:514053/141‑1 (MQ=255) cGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTtcatc > 2:501647/1‑141 (MQ=255) aTCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAAc < 1:147339/141‑1 (MQ=255) ctTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTaaa < 1:425034/141‑1 (MQ=255) aaaGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTa > 1:100224/1‑141 (MQ=255) aaaGGTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTa > 1:225127/1‑141 (MQ=255) gTGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCAt < 1:476277/141‑1 (MQ=255) gCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCaa < 2:393204/121‑1 (MQ=255) gCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCaa > 1:393204/1‑121 (MQ=255) gCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTa > 2:185116/1‑141 (MQ=255) gCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTa > 1:316195/1‑141 (MQ=255) ttCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCt < 1:315123/141‑1 (MQ=255) ttCACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCt < 2:527779/141‑1 (MQ=255) ccACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCtt < 2:430262/140‑1 (MQ=255) cACGTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTg < 2:233735/141‑1 (MQ=255) cACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTg < 1:423367/141‑1 (MQ=255) cACCTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTg < 2:285617/141‑1 (MQ=255) ccTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTGaa > 2:684302/1‑141 (MQ=255) ccTCGATACGTATACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTGaa > 2:555767/1‑141 (MQ=255) | CCAACTACTTCAATATCACTTTGCGTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAATGATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTGAA > CP000730/2026819‑2027084 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |