Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | CP000730 | 1608852 | 1609038 | 187 | 9 [6] | [6] 7 | [USA300HOU_1492] | [USA300HOU_1492] |
TTTTGTATAAATTAGTAATATATTTAATAGTTGATATTCGCAAAAACCCTAAGTTCTAATCCACATACAAAATTCCCCACATCAATCAAAAAACGCATGCTATAAATTAGAGTCTCTAATCAATAACATGCGTTCTGAAATAACTATATTCAATTTTATTCTGGTTTTGGTAGTTTAATAATAAATGTTGTGCCTTTCCCTAATTCGCTTTTAA > CP000730/1608966‑1609179 | ttttGTATAAATTAGTAATATATTTAATAGTTGATATTCGCAAAAACCCTAAGTTCTAATCCACATACAAAATTCCCCACATCAATCAAAAAACGCATGCTATAAATTAGAGTCTCTAATCAATAACATGCGTTCTGAAAt > 1:47776/1‑141 (MQ=255) taAATTAGTAATATATTTAATAGTTGATATTCGCAAAAACCCTAAGTTCTAATCCACATACAAAATTCCCca < 2:108939/72‑1 (MQ=255) taAATTAGTAATATATTTAATAGTTGATATTCGCAAAAACCCTAAGTTCTAATCCACATACAAAATTCCCca > 1:108939/1‑72 (MQ=255) tAGTTGATATTCGCAAAAACCCTAAGTTCTAATCCACATACAAAATTCCCCACATCAATCAAAAAACGCATGCTATAAATTAGAGTCTCTAATCAATAACATGCGTTCTGAAATAACTATATTCAATTTTATTCTGGtttt > 1:37536/1‑141 (MQ=255) atatTCGCAAAATCCCTAAGTTCTAATCCACATACAAAATTCCCCCCATCAATCAAAAAACGCATGCTATAAATTAGAGCCTCTAATCAATAACATCCGTTCTGAAAGAACGCTATTCAATATTATCCTCGTTTTGGTAGt > 2:263823/1‑141 (MQ=255) cTAAGTTCTAATCCACATACAAAATTCCCCACATCAATCAAAAAACGCATGCTATAAATTAGAGTCTCTAATCAATAACATGCGTTCTGAAATAACTATATTCAATTTTATTCTGGTTTTGGTAGTTTAATAATAAAtgtt > 2:91351/1‑141 (MQ=255) tCCCCACATCAATCAAAAAACGCATGCTATAAATTAGAGTCTCTAATCAATAACATGCGTTCTGAAATAACTATATTCAATTTTATTCTGGTTTTGGTAGTTTAATAATAAATGTTGTGCCTTTCCCTAATTCGCTTTTaa > 2:204886/1‑141 (MQ=255) | TTTTGTATAAATTAGTAATATATTTAATAGTTGATATTCGCAAAAACCCTAAGTTCTAATCCACATACAAAATTCCCCACATCAATCAAAAAACGCATGCTATAAATTAGAGTCTCTAATCAATAACATGCGTTCTGAAATAACTATATTCAATTTTATTCTGGTTTTGGTAGTTTAATAATAAATGTTGTGCCTTTCCCTAATTCGCTTTTAA > CP000730/1608966‑1609179 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |