| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,785,994 | C→A | intergenic (‑207/+217) | aur ← / ← isaB | M04 family aureolysin/immunodominant antigen B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,785,994 | 0 | C | A | 100.0% | 23.1 / NA | 9 | intergenic (‑207/+217) | aur/isaB | M04 family aureolysin/immunodominant antigen B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (7/2); total (7/2) | |||||||||||
TCTATACTTTTTGTTCGTTGATTTTATTTATTGATTCTTTTCTTTTTTAAAAATGTTATCTGTAGCTAAATAAAATTTTAAAAATTGAGCTTAATTATATTTTAAAATTTATCAAGGCTTTATTTTTGTGAAAATATTAACAAATACAAAATAGTGCTCTATATACTTAATCAATGCTTGAAATATGTGAGATAACTATTTAAATAATCATAATCAAATAAACATTTTTATCAATTTCAAACAACTATG > CP000730/2785877‑2786125 | tctatACTTTTTGTTTTTTTATTTTATTTATTGATTCTTTTCTTTTTTAAAAATGTTATCTGTAGCTAAATAAAATTTTAAAAATTGAGCTTAATTATATTTTAAAATTTATCAAGGATTTATTTTTTTTAAAATATTAAc > 2:152512/1‑141 (MQ=255) ttGTTCGTTGATTTTATTTATTGATTCTTTTCTTTTTTAAAAATGTTATCTGTAGCTAAATAAAATTTTAAAAATTGAGCTTAATTATATTTTAAAATTTATCAAGGATTTATTTTTGTGAAAATATTAACAAATACaaaa > 1:223699/1‑141 (MQ=255) aaTGTTATCTGTAGCTAAATAAAATTTTAAAAATTGAGCTTAATTATATTTTAAAATTTATCAAGGATTTATTTTTGTGAAAATATTAACAAATACAAAATAGTGCTCTATATACTTAATCAATGCTTGAAATATGTgaga > 2:307146/1‑141 (MQ=255) aaTGTTACCTGTAGCTAAATAAAATTTTAAAAATCGATCATAATTATATTTTAAAATTTATCAAGGATTTATTTTTGTGAAAATATTAACAAATACAAAATAGTGCTCTATATACTTAATCAATGCTTGAAATATGTgaga > 2:38062/1‑141 (MQ=255) taaaATTTTAAAAATTGAGCTTAATTATATTTTAAAATTTATCAAGGATTTATTTTTGTGAAAATATTAACAAATACaa > 2:202975/1‑79 (MQ=255) taaaATTTTAAAAATTGAGCTTAATTATATTTTAAAATTTATCAAGGATTTATTTTTGTGAAAATATTAACAAATACaa < 1:202975/79‑1 (MQ=255) tAATTATATTTTAAAATTTATCAAGGATTTATTTTTGTGAAAATATTAACAAATACAAAATAGTGCTCTATATACTTAATCAATGCTTGAAATATGTGAGATAACTATTTAAATAATCATAATCAAATAAACATTTTTATc < 1:302480/141‑1 (MQ=255) aaaaTTTATCAAGGATTTATTTTTGTGAAAATATTAACAAATACAAAATAGTGCTCTATATACTTAATCAATGCTTGAAATATGTGAGATAACTATTTAAATAATCATAATCAAATAAACATTTTTATCAATTTCAaacaa > 1:25773/1‑141 (MQ=255) ttATCAAGGATTTATTTTTGTGAAAATATTAACAAATACAAAATAGTGCTCTATATACTTAATCAATGCTTGAAATATGTGAGATAACTATTTAAATAATCATAATCAAATAAACATTTTTATCAATTTCAAACAACTATg > 2:181719/1‑141 (MQ=255) | TCTATACTTTTTGTTCGTTGATTTTATTTATTGATTCTTTTCTTTTTTAAAAATGTTATCTGTAGCTAAATAAAATTTTAAAAATTGAGCTTAATTATATTTTAAAATTTATCAAGGCTTTATTTTTGTGAAAATATTAACAAATACAAAATAGTGCTCTATATACTTAATCAATGCTTGAAATATGTGAGATAACTATTTAAATAATCATAATCAAATAAACATTTTTATCAATTTCAAACAACTATG > CP000730/2785877‑2786125 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |