| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,057,798 | C→A | 5.5% | R165L (CGA→CTA) | USA300HOU_1913 ← | hypothetical membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,057,798 | 0 | C | A | 5.5% | 262.5 / 2.4 | 71 | R165L (CGA→CTA) | USA300HOU_1913 | hypothetical membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (41/26); new base A (2/2); total (43/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.44e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
TCGTGACAAACAATCAGCAATTGTTTCATTCTCATTTACTTTGAATTTCATGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCATACGACTACCATCTCTACCAAACGCAGCATAGTGCGT > CP000730/2057658‑2057934 | tCGTGACAAACAATCAGCAATTGTTTCATTCTCATTTACTTTGAATTTCATGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTc < 1:316267/141‑1 (MQ=255)tCGTGACAAACAATCAGCAATTGTTTCATTCTCATTTACTTTGAATTTCATGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTc < 2:298312/141‑1 (MQ=255)tCGTAACAAACAATCAGCAATTGTTTCATTCTCATTTACTTTGAATTTCATGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTc < 2:39284/141‑1 (MQ=255) cGTGACAAACAATCAGCAATTGTTTCATTCTCATTTACTTTGAATTTCATGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCg > 1:339988/1‑141 (MQ=255) cGTGACAAACAATCAGCAATTGTTTCATTCTCATTTACTTTGAATTTCATGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCg > 1:171690/1‑141 (MQ=255) tGACAAACAATCAGCAATTGTTTCATTCTCATTTACTTTGAATTTCATGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAg > 1:224996/1‑141 (MQ=255) caaacaaTCAGCAATTGTTTCATTCTCATTTACTTTGAATTTCATGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGtt > 1:99033/1‑141 (MQ=255) caaacaaTCAGCAATTGTTTCATTCTCATTTACTTTGAATTTCATGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTGAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGtt > 1:331532/1‑141 (MQ=255) aaacaaTCAGCAATTGTTTCATTCTCATTTACTTTGAATTTCATGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTc > 1:79341/1‑141 (MQ=255) aaacaaTCAGCAATTGTTTCATTCTCATTTACTTTGAATTTCATGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTc > 1:24035/1‑141 (MQ=255) aaacaaTCAGCAATTGTTTCATTCTCATTTACTTTGAATTTCATGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTc > 2:302353/1‑141 (MQ=255) acaaTCAGCAATTGTTTCATTCTCATTTACTTTGAATTTCATGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCAt < 2:147843/141‑1 (MQ=255) caaTCAGCAATTGTTTCATTCTCATTTACTTTGAATTTCATGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATa > 2:319189/1‑141 (MQ=255) cAGCAATTGTTTCATTCTCATTTACTTTGAATTTCATGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCa < 2:139142/141‑1 (MQ=255) cAATTGTTTCATTCTCATTTACTTTGAATTTCATGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATg > 1:203139/1‑141 (MQ=255) cAATTGTTTCATTCTCATTTACTTTGAATTTCATGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATg > 2:64571/1‑141 (MQ=255) cAATTGTTTCATTCTCATTTACTTTGAATTTCATGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATg > 2:293094/1‑141 (MQ=255) tttACTTTGAATTTCATGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATc < 2:374193/141‑1 (MQ=255) ttGAATTTCATGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAAtt < 2:313587/141‑1 (MQ=255) ttGAATTTCATGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAAtt < 2:387281/141‑1 (MQ=255) tGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTa > 1:132939/1‑141 (MQ=255) ccacTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCCGAGCTATATTGTTTATCGTATCCATCAAt < 2:116381/140‑1 (MQ=255) acacTTTCCTGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTTATACGCAATGATAAATGATTTAGGATATAAGTGTTATATCGTATcctttttt < 2:213473/141‑7 (MQ=255) acacTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAAt < 2:427583/141‑1 (MQ=255) cacTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATCATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAAtt < 2:400219/141‑1 (MQ=255) cacTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAAtt < 2:82663/141‑1 (MQ=255) cacTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAAtt < 2:146587/141‑1 (MQ=255) ccAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGtt > 1:165153/1‑141 (MQ=255) ccAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGtt > 1:53206/1‑141 (MQ=255) cAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTc > 1:165239/1‑141 (MQ=255) ctGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTc > 2:139259/1‑141 (MQ=255) ctGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTc > 2:166485/1‑141 (MQ=255) tCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCGCCATGTATGTTTAGAGGTTCCTCGGCAGTGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGgt < 1:389305/141‑1 (MQ=255) tCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGgt < 1:236366/141‑1 (MQ=255) tCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGgt < 1:43115/141‑1 (MQ=255) tCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTAGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGgt < 1:212062/141‑1 (MQ=255) cATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGgtg < 1:319189/141‑1 (MQ=255) aTAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTTTCGTTTTCTTCAATTTACGTTCATATTTTCTTGgtgt > 2:349179/1‑141 (MQ=255) aTAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGgtgt < 1:211204/141‑1 (MQ=255) aTAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGgtgt > 2:2012/1‑141 (MQ=255) aTAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTAGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGgtgt > 2:410581/1‑141 (MQ=255) aTAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTAGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGgtgt > 2:410527/1‑141 (MQ=255) aTCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGCATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGCTCTAAATTTTTTATCGTCTCCAGCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTaa > 1:331614/1‑141 (MQ=255) tCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTaaa > 2:309412/1‑141 (MQ=255) ttAAGCTTTCTCCGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAAtt < 2:375040/141‑1 (MQ=255) ttAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAAtt < 2:188522/141‑1 (MQ=255) tAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAAttt < 1:188424/141‑1 (MQ=255) tAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAAttt < 2:142978/141‑1 (MQ=255) tAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAAttt < 2:74439/141‑1 (MQ=255) gCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCa > 2:278592/1‑141 (MQ=255) gCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCa > 2:237992/1‑141 (MQ=255) gCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCa > 2:347499/1‑141 (MQ=255) gCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCa > 2:138589/1‑141 (MQ=255) acgacgAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCAt > 2:238864/1‑141 (MQ=255) cgaATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCATACGa > 1:181620/1‑141 (MQ=255) gaATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCATACGAc < 1:414621/141‑1 (MQ=255) tttAGTCCAGAATCCATCATGTATGTTTCTATTTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCTCATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCATACGACTACCAtc < 2:143271/141‑1 (MQ=255) tAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGCTAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCATACGACTACCAtctc > 1:195114/1‑141 (MQ=255) tAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCATACGACTACCAtctc > 1:100046/1‑141 (MQ=255) gTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCATACGACTACCATCTCTa < 2:285674/141‑1 (MQ=255) tCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCATACGACTACCATCTCTAc < 2:224996/141‑1 (MQ=255) ccAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCATACGACTACCATCTCTAcc < 2:132939/141‑1 (MQ=255) gAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCATACGACTACCATCTCTACCaaa > 1:287468/1‑141 (MQ=255) gAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCATACGACTACCATCTCTACCaaa > 1:95363/1‑141 (MQ=255) gAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCATACGACTACCATCTCTACCaaa > 1:247810/1‑141 (MQ=255) tCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCATACGACTACCATCTCTACCAAACgc > 2:333817/1‑141 (MQ=255) ccaccaTGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAACTGCTTTCGGATCTAACTTTTTTATTGTCTCTATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCATATGCATAAAATATCTAACAAAAgca > 2:113854/1‑141 (MQ=255) caccaTGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCATACGACTACCATCTCTACCAAACgcag > 1:443247/1‑141 (MQ=255) caccaTGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCATACGACTACCATCTCTACCAAACgcag > 1:65552/1‑141 (MQ=255) ccaTGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCATACGACTACCATCTCTACCAAACgcagca > 1:115837/1‑141 (MQ=255) tgtTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCATACGACTACCATCTCTACCAAACGCAGCATAGTGCg < 1:340775/141‑1 (MQ=255) gtTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCATACGACTACCATCTCTACCAAGCGCAGCATAGTGCGt > 1:381687/1‑141 (MQ=255) gtTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCATACGACTACCATCTCTACCAAACGCAGCATAGTGCGt > 2:451430/1‑141 (MQ=255) gtTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCATACGACTACCATCTATACCAAACGCAGCATAGTGCGt > 2:42135/1‑141 (MQ=255) | TCGTGACAAACAATCAGCAATTGTTTCATTCTCATTTACTTTGAATTTCATGTTCTACTACACTTTCCAGTTCTTCTGGTTCATAATCTTTAAGCTTTCTACGACGAATGCCTTTAGTCCAGAATCCACCATGTATGTTTCGAGGTTCATACGCAATGATAAATGCTTTCGGATCTAAATTTTTTATCGTATCCATCAATTTACGTTCATATTTTCTTGGTGTTAAAATTTGCATCACCATACGACTACCATCTCTACCAAACGCAGCATAGTGCGT > CP000730/2057658‑2057934 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |