| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,352,815 | G→A | 100% | A92V (GCA→GTA) | rpsI ← | ribosomal protein S9 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,352,815 | 0 | G | A | 100.0% | 260.1 / ‑6.5 | 91 | A92V (GCA→GTA) | rpsI | ribosomal protein S9 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (51/38); minor base C (2/0); total (53/38) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
TCGTCCGACAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTGCTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATCAAATGGTTGGTTTAAGTCTAA > CP000730/2352680‑2352948 | tCGTCCGACAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGACCTCCTTc > 2:292021/1‑140 (MQ=255) gTCCGACAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAACGCACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCta > 2:53676/1‑140 (MQ=255) cGACAATTACCGTTTTGAGAATTGAGGTTAACGACGAGCTGCTTTAAGCCCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCtaata < 2:606314/140‑1 (MQ=255) gACAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGCGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCtaataa > 2:473207/1‑140 (MQ=255) aCAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACTACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTaataat < 1:212614/140‑1 (MQ=255) aCAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTaataat < 1:614852/140‑1 (MQ=255) aCAATTAACGATATGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTaataat > 2:618281/1‑140 (MQ=255) cAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATAAGTGGGTCACGAGTACGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCACTGAGGTGAACATCTCCTCCTAATAATg > 2:375338/1‑140 (MQ=25) cAATGAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAAGATGTACTTCtaataaat > 1:340903/1‑138 (MQ=38) aaTTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATATACTTCTAATAATGc > 2:702781/1‑140 (MQ=255) aaCGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGa < 1:564063/140‑1 (MQ=255) aCGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGTCGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAg < 1:723656/140‑1 (MQ=255) aCGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTTCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTTACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAg < 1:521091/140‑1 (MQ=255) cGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACTTCTGTATTCGGGATCTACTTCTAATACTGCAcagac > 2:113999/1‑136 (MQ=39) cGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGc > 1:750031/1‑140 (MQ=255) gTTTTGAGAATTGAGGTGAACGCCGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGGGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCg < 1:711420/140‑1 (MQ=255) tttGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTATTTCATCTGTGGGTAACGAGTCAGTAATGCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCAGTATACAGGATCTACTGCTAATAATGAACGAGCGAt > 2:633519/1‑140 (MQ=37) taaTTGAGGTGAACGACGGGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCAGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGATCGATTCCGt < 1:520958/139‑1 (MQ=255) tGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGTCTTTGTTTTTTTCGTTCTTTCATAAGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACg < 1:353811/140‑1 (MQ=255) gAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACgg < 1:651055/140‑1 (MQ=255) gAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATagc > 2:557532/1‑140 (MQ=255) gacgaGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTTTTTTTTTTTATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCATCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCTTGATCTACTTCTAATTATGCCCGAGCGATTCCGTGACGGATagcgtga > 2:448755/1‑140 (MQ=255) cgaGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATagcttgagc < 1:263426/140‑1 (MQ=255) cgaGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATagcttgagc < 1:657411/140‑1 (MQ=255) cgaGCTGCTTCAAGGCCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATagcttgagc < 1:242253/140‑1 (MQ=255) gctTCAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGCAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTACTAATGTACGAGCGATTCCGTGACGGATTGCTTGAGCTTGTcc > 1:535616/1‑140 (MQ=255) ttataaCCTTGTTTTTTACGTTCTTTCATTCGTTGGTCACGAGTAAGTAATCCAGTGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGt < 1:106259/135‑1 (MQ=255) ttAAGACCTTGTTGTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGt < 1:92460/140‑1 (MQ=255) tAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTg < 2:376942/140‑1 (MQ=255) aGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTGAAGAGTAAGTCCTTCAACGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATTATAGCTGAGCGATTCCGCGACGGATagcttgagctttcgcagtaga > 2:613497/1‑130 (MQ=255) aGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGaa > 1:546276/1‑140 (MQ=255) ggTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGATCCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAaccacc < 1:382244/140‑1 (MQ=255) ggTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAaccacc < 1:345637/140‑1 (MQ=255) ggTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAaccacc < 1:499994/140‑1 (MQ=255) ggTTTTTGACGTTCTGTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAaccacc < 2:213204/140‑1 (MQ=255) tttttACGTTCTTTAATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAacaaccacc > 1:406925/1‑140 (MQ=255) ttttgctgtttttGATACGTGAGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATTGCTTGAGGTTGTCCGGTGGAAccaccacca > 2:560090/11‑140 (MQ=255) ttttCCGTTGTTTCATACGTGGGTCCCGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAAccaccacca < 2:342856/140‑1 (MQ=255) ttttACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAAccaccacca > 1:564329/1‑140 (MQ=255) tttACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCAt > 2:298210/1‑140 (MQ=255) tttACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATCCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGGGGGATTCGTTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCAt > 2:691292/1‑140 (MQ=255) ttcctttCTTTCATACGGTGGTCACGAGTAATTAATACAGCGCTTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAACGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGATCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATg < 1:42634/135‑1 (MQ=255) ttACGTTCTTTCATTCGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTCTTCGTCCTGGGTATTCAGGATCTACTTCTAAGAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATg < 1:712973/140‑1 (MQ=255) aCGTTCTTTCATACGTGGGTCAAGACTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAGCCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGaa > 2:539144/1‑140 (MQ=255) ttCATGCGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGTGCGTTTTAAAGAACCTCTGCATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAAc < 1:42930/140‑1 (MQ=255) tCATACTTGTGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACt > 2:755312/1‑140 (MQ=255) cacaCGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCTCGTTGTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACCAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGATCTTGTTCAGTGAAACCACTACCATGAAAGTTAAGTa < 2:90122/137‑1 (MQ=255) tACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTaaa > 1:33721/1‑140 (MQ=255) cGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAGCCACCACCATGAACGTTAACTAAAAc > 1:3186/1‑140 (MQ=255) tGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAAcat > 1:220185/1‑140 (MQ=255) tGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACAATGAACGTTAACTAAAActt > 1:733365/1‑138 (MQ=255) gTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTTAACAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAAcataat > 1:180760/1‑140 (MQ=255) gTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAAcatcat > 2:242908/1‑140 (MQ=255) gTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTACAGTGCAACCACCACCATGAACGCTAACTAAAAcatcat > 2:242757/1‑140 (MQ=255) gTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTCACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAAcatcat > 1:3445/1‑140 (MQ=255) aCGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCCCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTCTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTCAACTAAAACATCATAGt < 2:586590/140‑1 (MQ=255) cGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGCTAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAACATCATAGtt > 2:625475/1‑140 (MQ=255) cGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAACCATCATAGtt > 2:115039/1‑140 (MQ=255) cGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATATACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGAGAGCTTGAGCTTATCCAGTGAAACCACCACCCTGAAGGTTAACTAAAAAATCATAGtt > 2:713296/1‑140 (MQ=255) gtaagtaaTCCAGTGTGTTTTAAAGGAACTCTGTATTAAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAACATCATAGTTAcc < 1:343780/140‑1 (MQ=255) aaTCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAACATCATAGTTACCTTTAGt < 1:557532/140‑1 (MQ=255) aaTCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAACATCATAGTTACCTTTAGt > 1:51663/1‑140 (MQ=255) aaTCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAACATCATAGTTACCTTTAGt < 1:383865/140‑1 (MQ=255) aTCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGACCGTTAACTAAAACATCATACTTACCTTTAgct > 2:385350/1‑138 (MQ=255) aTCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAACATCATAGTTACCTTTAGtt > 2:241930/1‑140 (MQ=255) aTCCAGCGCGTTTTAAAGAACATGTTTATTCAGACTCTAATTATACTAATGCAGGAGCGGTTAAGTGACCGGTAGCTTGAACTTGTACAGTTCAACCCCCACCATGAACACTACATGCAACATCATAGCTActtcttgtc > 2:702407/1‑132 (MQ=255) ccAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGACCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAAATAAAACAACATAGTTACCTTTAGTTTc > 1:267987/1‑140 (MQ=255) ccAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATCCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCTTGAACGTTAACTAAAACATCATAGTTACCGTTAGTTTc > 2:524770/1‑140 (MQ=255) tttAAAGCACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATCGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATc < 1:512427/140‑1 (MQ=255) tttAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAACACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATc < 1:544879/140‑1 (MQ=255) tttAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCAACACCATGAACGTTAACTAAAACATCATAGTCACTTTTAATTTAAGTTGCact > 1:101963/1‑138 (MQ=255) ttAAAGACCCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTACCTAAAACATCATAGTTACTTTAAGTTTCAGTTACATCa < 1:423852/140‑1 (MQ=255) aaGAACCTCTGTATTGAAGGTTTACTTACAATAATGCACGCGCGAGTCCGTGTCGGATAGATTGAGACTGTTAAGTAAAATAACCAGCTTGGACGTTAACTAAAAGATCACAGTGACCTTTAGTTTCAGTTACAttatct < 2:189777/140‑6 (MQ=255) aaGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGCCGGATAACTTGAGCTGGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGGTAACTAAAACATCATCGTTCCCTTTAATGTCAGTTACATTAAAt > 2:452375/1‑140 (MQ=255) aaGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCCGTTACATaaaag > 2:640866/1‑139 (MQ=255) aaGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATCAAAt < 2:546276/140‑1 (MQ=255) gcaCCTCTTTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCTTGAACGTTAACTAAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATCAAAtgg < 1:400540/138‑1 (MQ=255) gAACCTCTGTATTCAGTATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATCAAAtgg < 2:339441/140‑1 (MQ=255) gAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCGAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATCAAAtgg > 1:629885/1‑140 (MQ=255) gAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATCCAAtgg > 2:751271/1‑140 (MQ=255) gAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATCAAAtgg > 1:111742/1‑140 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(MQ=255) tATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAACACATTAGTTACCTTTAGTGTCAGTTACATCCAATGGTTGGGTTaa > 2:389371/1‑140 (MQ=255) aTTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCGGTTACAACAAATGGTTGGTTAAAg > 2:226955/1‑140 (MQ=255) aTTCAGGATCTACTGCTAATACTTCCTAAGCGATTCCGTGCCAGACAGATTCATCTTGTCCAGTTAACCCAACAACATGAACGTTAACTAAAACATCATAGTAACATTTAGCTTAACTTACAACAAATGGCTGGCTTAAg < 2:190659/140‑1 (MQ=255) ggATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAACATCATAGTTACCTTTAGTTACAGTTACATCAAATGGTTGGTATAAGTCTaa > 1:673109/1‑140 (MQ=255) | TCGTCCGACAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTGCTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATCAAATGGTTGGTTTAAGTCTAA > CP000730/2352680‑2352948 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |